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鸡多趾候选基因的SNPs及表达差异研究

摘要第1-8页
Abstract第8-11页
第一部分 文献综述第11-48页
 一、多趾及其相关基因的研究概况第11-34页
  1 肢体发育概述第11-14页
   1.1 为什么要研究肢体的发育第11页
   1.2 肢体发育的轴模式及其信号分子第11-14页
  2 多趾(指)的研究概况第14-20页
   2.1 人类多趾的研究概况第14-16页
   2.2 小鼠多趾的研究概况第16-18页
   2.3 鸡多趾的研究概况第18-20页
   2.4 人、鼠和鸡多趾候选区间比较第20页
  3 多趾相关基因及其互作第20-34页
   3.1 shh基因研究进展第20-23页
   3.2 Lmbr1基因研究进展第23-26页
   3.3 Gli3基因第26-30页
   3.4 dHand基因第30-31页
   3.5 Hlxb9/Hb9基因第31页
   3.6 En2基因第31-32页
   3.7 Hox基因第32-34页
  4 本研究的内容及目的第34页
 二、单核昔酸多态性的研究与应用第34-41页
  1 SNP的基本概念与特点第34-36页
   1.1 SNP的基本概念及分类第34-35页
   1.2 SNP的特点第35-36页
  2 SNP的检测技术第36-40页
   2.1 基于 PCR或酶切的方法第36-37页
   2.2 基于分子杂交的方法第37页
   2.3 基于荧光共振能量传递的方法第37-38页
   2.4 基于 DNA构象的方法第38-39页
   2.5 质谱法第39页
   2.6 直接测序方法第39-40页
   2.7 生物信息学方法第40页
  3 SNP的应用前景及存在的问题第40-41页
   3.1 SNP的应用前景第40-41页
   3.2 SNP存在的问题第41页
 三、实时定量 PCR技术的原理与应用第41-48页
  1 实时定量 PCR的发展第41-42页
  2 实时定量 PCR原理第42-43页
   2.1 实时定量 PCR技术中的几个关键概念第42-43页
   2.2 荧光标记第43页
  3 实时定量PCR的参照第43-44页
  4 实时定量 PCR方法第44-45页
   4.1 标准曲线法的相对定量第44页
   4.2 比较 Ct法的相对定量第44-45页
   4.3 标准曲线法的绝对定量第45页
  5 实时定量 PCR的应用第45-47页
   5.1 基因表达的研究第45-46页
   5.2 基因突变及其多态性第46页
   5.3 肿瘤研究第46页
   5.4 病原体测定第46页
   5.5 遗传病的诊断第46-47页
  6 存在的问题及应用前景第47-48页
第二部分 材料与方法第48-68页
 1 总技术路线第48-49页
 2 主要仪器第49页
 3 寻找候选基因的SNP第49-58页
  3.1 实验材料第49-50页
  3.2 试剂及溶液配制第50-51页
  3.3 候选基因序列的获得和所用引物第51-55页
  3.4 实验方法与步骤第55-58页
 4 PCR-SSCP第58-61页
  4.1 实验材料第58-59页
  4.2 所用引物第59页
  4.3 试剂及溶液配制第59-60页
  4.4 实验方法与步骤第60-61页
 5 候选基因的表达研究第61-68页
  5.1 实验器材准备第61页
  5.2 试剂及溶液配制第61-62页
  5.3 实验材料及其处理第62-64页
  5.4 候选基因表达研究所用引物第64页
  5.5 实验方法与步骤第64-68页
第三部分 结果与讨论第68-99页
 1 候选基因趾型相关 SNPs的确定第68-75页
  1.1 鸡血DNA提取效果第68页
  1.2 候选基因外显子趾型相关SNPs第68-70页
  1.3 候选基因内含子保守区趾型相关SNPs第70-71页
  1.4 Lmbrl 5'上游区段趾型相关 SNPs第71-75页
  1.5 小结第75页
 2 趾型相关 SNPs的SSCP筛查第75-82页
  2.1 PC12引物的SSCP结果第75-76页
  2.2 PC5引物SSCP结果与讨论第76-78页
  2.3 SNPs转录因子结合位点预测与讨论第78-81页
  2.4 Lmbr1与鸡多趾的关系讨论第81页
  2.5 小结第81-82页
 3 候选基因的表达研究第82-97页
  3.1 RNA提取效果第82页
  3.2 RT-PCR扩增子测序第82-84页
  3.3 RT-PCR结果第84-86页
  3.4 定量 PCR结果第86-96页
  3.5 Gli3、Lmbr1和 Shh的表达量与多趾讨论第96页
  3.6 小结第96-97页
 4 总结第97-99页
参考文献第99-108页
致谢第108-109页
附图第109-123页
附表第123-126页
作者简历第126页

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