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极端草甘膦环境中EPSP合酶基因的克隆及其抗性相关位点的鉴定

1 引言第1-26页
   ·草甘膦特性第14页
   ·草甘膦的作用靶酶--EPSP合酶第14-20页
     ·EPSP合酶的作用机理及草甘膦对该酶的抑制机理第15-16页
     ·EPSP合酶及其编码基因研究进展第16-20页
   ·草甘膦抗性获得途径第20-23页
   ·EPSP合酶基因的应用第23-24页
     ·抗草甘膦转基因植物的构建第23页
     ·EPSP合酶基因的拆分转基因作物的安全性第23-24页
   ·立题依据及研究内容第24-26页
2 EPSP合酶抗性新基因的克隆第26-39页
   ·材料第27页
     ·菌株和质粒第27页
     ·细菌的培养第27页
     ·培养基第27页
     ·试剂第27页
   ·实验方法第27-32页
     ·土壤总DNA基因组文库的构建第27-31页
     ·筛选草甘膦抗性转化子第31页
     ·目的菌株的草甘膦抗性分析第31-32页
     ·目的菌株的EPSP合酶基因的获得第32页
     ·测序结果的分析第32页
   ·结果和分析第32-38页
     ·土壤总DNA的获得第32-33页
     ·土壤总DNA的部分酶切片段的获得第33-34页
     ·重组载体文库的构建第34页
     ·ERAM1菌株草甘膦抗性分析第34-35页
     ·ERAM1菌株插入外源片段序列测定第35-36页
     ·ERAM1-aroA基因是否为新基因的鉴定第36-38页
   ·讨论第38-39页
3 PCR随机突变鉴定EPSP合酶基因中抗性相关位点第39-50页
   ·材料第40页
     ·菌株和质粒第40页
     ·培养基第40页
   ·方法第40-44页
     ·质粒DNA的提取-碱裂解法第40页
     ·目的基因片段的错误倾向PCR突变扩增-使用毛细管PCR扩增仪第40-41页
     ·重组质粒的构建第41-43页
     ·突变株的筛选及草甘膦抗性分析第43页
     ·突变株分子鉴定第43-44页
     ·EPSP合酶突变基因的序列测定第44页
     ·突变基因与野生型基因的比较及分析第44页
   ·结果和分析第44-49页
     ·PCR扩增产物第44-45页
     ·重组质粒的构建和鉴定第45页
     ·突变株的筛选及鉴定第45-46页
     ·序列的测定及比较分析第46-47页
     ·蛋白质二级结构的预测第47-49页
   ·讨论第49-50页
4 菌落直接PCR方法坚定EPSP合酶抗性相关位点第50-62页
   ·材料第51页
     ·菌株第51页
     ·试剂第51页
     ·培养基第51页
   ·方法第51-56页
     ·土壤样品的草甘膦含量的分析第51页
     ·目的菌株的获得第51-52页
     ·目的菌株的生理特性的研究第52-53页
     ·目的菌株的EPSP合酶基因的获得第53-55页
     ·目的菌株的分子生物学鉴定-16s rDNA序列的分析第55-56页
     ·16s rDNA和EPSP合酶基因序列分析第56页
   ·结果和分析第56-61页
     ·土壤样品的草甘膦含量及其理性的分析第56-57页
     ·目的菌株L35的获得第57页
     ·L35菌株和G2菌株的草甘膦抗性分析比较第57-58页
     ·L35菌株与G2菌株的抗生素抗性分析第58页
     ·pH值对L35和G2菌的生长的影响第58-59页
     ·L35菌株的16s rDNA的序列测定及结果分析第59页
     ·L35菌株的EPSP合酶基因的序列测定及结果分析第59-60页
     ·L35菌株EPSP合酶二级结构预测第60-61页
   ·讨论第61-62页
5 结论第62-64页
6 参考文献第64-69页
7 附录第69-92页
 附录1: AZ50的碱基和氨基酸序列第69-70页
 附录2: AZ100的碱基和氨基酸序列第70-71页
 附录3: ERL135未突变碱基及氨基酸序列第71-72页
 附录4: G2的EPSP合酶基因碱基和氨基酸序列第72-73页
 附录5: L35的碱基和氨基酸序列第73-74页
 附录6: ERAM1的完整的外源片段的碱基序列第74-75页
 附录7: ERAM1的EPSP合酶的碱基和氨基酸序列第75-76页
 附录8: ERAM1与ERL135中EPSP合酶基因碱基序列比较第76-77页
 附录9: ERAM1与G2中EPSP合酶基因碱基序列比较第77-78页
 附录10: ERAM1、ERL135和G2中EPSP合酶基因碱基序列比较第78-79页
 附录11: ERAM1与ERL135中EPSP合酶基因氨基酸序列比较第79-80页
 附录12: ERAM1与G2中EPSP合酶基因氨基酸序列比较第80-81页
 附录13: ERAM1、ERL135和G2中EPSP合酶基因氨基酸序列比较第81-82页
 附录14: 溶液的配置第82-85页
 附录15: 培养基的配置第85-86页
 附录16: 16S rRNA基因PCR引物第86-88页
 附录17: ERL135全基因的引物设计第88-90页
 附录18: G2菌株EPSP合酶基因的引物第90-92页
8 在读期间发表的学术论文第92-100页
9 作者简历第100-101页
10 致谢第101页

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