| 第1章 绪论 | 第1-33页 |
| 1 引言 | 第17-18页 |
| 2 低等木食性白蚁肠道共生微生物的研究进展 | 第18-25页 |
| ·低等木食性白蚁肠道环境的生理状态 | 第18-20页 |
| ·低等木食性白蚁肠道内的共生鞭毛虫 | 第20-22页 |
| ·低等木食性白蚁肠道内的原核生物 | 第22-25页 |
| ·从低等木食性白蚁肠道内分离到的原核生物 | 第22-23页 |
| ·低等木食性白蚁肠道内原核生物系统发育的研究 | 第23-24页 |
| ·应用功能基因研究白蚁肠道内微生物的活性 | 第24-25页 |
| 3 研究目的和意义 | 第25-26页 |
| 4 参考文献 | 第26-33页 |
| 第2章 与散白蚁Reticulitermes flavipes(Kollar)肠道共生鞭毛虫Pyrsonympha vertens相关的共生细菌的研究 | 第33-46页 |
| 1 材料和方法 | 第33-36页 |
| ·实验材料 | 第33-34页 |
| ·白蚁的采集和饲养 | 第33页 |
| ·缓冲液 | 第33-34页 |
| ·PCR反应试剂及酶 | 第34页 |
| ·实验方法 | 第34-36页 |
| ·鞭毛虫Pyrsonympha vertens的显微分离 | 第34页 |
| ·与鞭毛虫P.vertens相关微生物的16S rDNA的扩增 | 第34-35页 |
| ·细菌16S rDNA的扩增 | 第34-35页 |
| ·古菌(Archaea)16S rDNA的扩增 | 第35页 |
| ·与鞭毛虫P.vertens共生细菌16S rDNA基因文库的建立 | 第35页 |
| ·RFLP分析 | 第35-36页 |
| ·与鞭毛虫P.vertens共生细菌的系统发育分析 | 第36页 |
| 2 结果与分析 | 第36-43页 |
| ·鞭毛虫P.vertens的显微分离 | 第36-38页 |
| ·与P.vertens相关微生物16S rDNA的扩增及基因文库的建立 | 第38-39页 |
| ·RFLP分析 | 第39-41页 |
| ·与鞭毛虫p.vertens共生细菌的系统发育分析 | 第41-43页 |
| 3 讨论 | 第43页 |
| 4 小结 | 第43-44页 |
| 5 参考文献 | 第44-46页 |
| 第3章 散白蚁Reticulitermes santonensis肠道共生细菌的系统发育及区系结构 | 第46-83页 |
| 1 材料和方法 | 第46-51页 |
| ·实验材料 | 第46-47页 |
| ·白蚁的采集和饲养 | 第46页 |
| ·缓冲液 | 第46-47页 |
| ·PCR反应试剂及酶 | 第47页 |
| ·实验方法 | 第47-51页 |
| ·散白蚁R.Santonensis肠道不同微环境内共生微生物的原位显微观察 | 第47页 |
| ·散白蚁R.santonensis肠道不同部分的分离解剖 | 第47-48页 |
| ·散白蚁R.santonensis肠道不同部分DNA的抽提 | 第48页 |
| ·原核生物16S rRNA基因的PCR扩增及纯化 | 第48-49页 |
| ·肠道不同部分共生细菌16S rRNA基因文库的建立及限制性酶切分析 | 第49页 |
| ·散白蚁R.santonensis肠道共生细菌的系统发育分析 | 第49-50页 |
| ·末端限制性片段长度多态性分析(T-RFLP) | 第50页 |
| ·统计分析 | 第50页 |
| ·细菌16S rRNA基因的序列数据 | 第50-51页 |
| 2 结果与分析 | 第51-76页 |
| ·散白蚁R.santonensis肠道不同微环境内共生微生物的原位显微镜观察 | 第51-54页 |
| ·中肠 | 第51页 |
| ·后肠 | 第51-54页 |
| ·散白蚁R.santonensis肠道不同部分的分离解剖 | 第54页 |
| ·二种DNA抽提方法的比较 | 第54-56页 |
| ·原核生物16S rRNA基因的PCR扩增及共生细菌16S rRNA基因文库的建立 | 第56-57页 |
| ·古菌16S rRNA基因的PCR扩增 | 第56-57页 |
| ·细菌16S rRNA基因的PCR扩增及基因文库的建立 | 第57页 |
| ·限制性片段长度多态性分析(RFLP analysis) | 第57-63页 |
| ·中肠 | 第57-58页 |
| ·鞭毛虫 | 第58-60页 |
| ·后肠肠液 | 第60-62页 |
| ·后肠肠壁 | 第62-63页 |
| ·白蚁R.santonensis肠道共生细菌的系统发育及分析 | 第63-76页 |
| ·肠道共生细菌的多样性分析 | 第63-66页 |
| ·肠道共生细菌主要系统发育类群的分布 | 第66-68页 |
| ·肠道共生细菌的主要系统发育类群 | 第68-76页 |
| ·“白蚁菌群1” | 第68页 |
| ·低G+C含量的革兰氏阳性菌 | 第68-71页 |
| ·CFB Phylum | 第71-74页 |
| ·螺旋体 | 第74页 |
| ·紫细菌 | 第74-76页 |
| ·其它Phylum | 第76页 |
| 3 讨论 | 第76-78页 |
| ·散白蚁R.Santonensis肠道共生微生物的区系结构及肠道微环境的关系 | 第76-77页 |
| ·与鞭毛虫相关的细菌 | 第77页 |
| ·与其它白蚁肠道共生微生物的比较 | 第77-78页 |
| 4 小结 | 第78页 |
| 5 参考文献 | 第78-83页 |
| 第4章 散白蚁ReticulitormesSantonensis肠道不同微环境细菌区系多样性的T-RFLP分析 | 第83-95页 |
| 1 材料与方法 | 第83-84页 |
| ·白蚁的采集与饲养 | 第83页 |
| ·白蚁肠道的解剖与DNA抽提 | 第83页 |
| ·PCR扩增与纯化 | 第83-84页 |
| ·限制性核酸内切酶消化 | 第84页 |
| ·末端限制性片段长度多态性分析(T-RFLP) | 第84页 |
| 2 结果与分析 | 第84-92页 |
| ·MspI消化产物的T-RFLP指纹图谱分析 | 第84-89页 |
| ·四个克隆文库中细菌多样性的比较 | 第84-86页 |
| ·不同细菌系统发育类型所归属的T-RF | 第86-89页 |
| ·不同酶消化产物的T-RFLP指纹图谱分析 | 第89-92页 |
| ·限制性内切酶MspI，TasI，TaiI消化产物的T-RFs | 第89-90页 |
| ·限制性内切酶TasI消化产物的T-RFLP指纹图谱分析 | 第90-91页 |
| ·限制性内切酶MspI+TaiI消化产物的T-RFLP指纹图谱分析 | 第91-92页 |
| 3 讨论 | 第92-93页 |
| 4 小结 | 第93页 |
| 5 参考文献 | 第93-95页 |
| 第5章 应用荧光原位杂交技术对散白蚁Roticulitermes santonensis肠道共生细菌分布及定位的研究 | 第95-114页 |
| 1 材料与方法 | 第95-99页 |
| ·材料 | 第95-98页 |
| ·用于肠道细菌及鞭毛虫固定的磷酸缓冲液 | 第95页 |
| ·用于荧光原位杂交的缓冲液 | 第95-96页 |
| ·用于制备石蜡切片的缓冲液 | 第96-97页 |
| ·16S rRNA寡核苷酸探针 | 第97-98页 |
| ·方法 | 第98-99页 |
| ·肠道共生细菌的形态及DAPI计数 | 第98页 |
| ·肠道共生鞭毛虫的分离与同定 | 第98页 |
| ·散白蚁R.santonensis(Feytaud)肠道石蜡切片的制作 | 第98页 |
| ·荧光原位杂交(FISH analysis) | 第98-99页 |
| 2 结果与分析 | 第99-111页 |
| ·肠道不同微环境中共生原核生物的特征 | 第99-102页 |
| ·肠道不同微环境中共生原核生物的形态 | 第99-100页 |
| ·肠道不同微环境中共生原核生物的数量及类别 | 第100-101页 |
| ·肠道不同微环境中共生细菌的系统发育类群及数量 | 第101-102页 |
| ·与鞭毛虫共生的细菌 | 第102-107页 |
| ·Pyrsonympha vertens | 第102页 |
| ·Trichonympha agilis | 第102-104页 |
| ·Spirotrichonympha sp | 第104-106页 |
| ·Dinenympha gracilis | 第106页 |
| ·其它鞭毛虫 | 第106-107页 |
| ·不同系统发育类群细菌在肠道的空间分布与定位 | 第107-111页 |
| ·“白蚁菌群1” | 第107-108页 |
| ·CFB phylum | 第108页 |
| ·低G+C含量的革兰氏阳性菌 | 第108-111页 |
| ·其它细菌类群 | 第111页 |
| 3 讨论 | 第111-112页 |
| 4 小结 | 第112页 |
| 5 参考文献 | 第112-114页 |
| 第六章 总结 | 第114-116页 |
| 博士学习期间发表的论文 | 第116-117页 |
| 致谢 | 第117-118页 |
