| 中文摘要 | 第1-9页 |
| 英文摘要 | 第9-11页 |
| 第1章 文献综述 | 第11-25页 |
| 1.基因芯片的概念及发展概况 | 第11-13页 |
| ·基因芯片的概念 | 第11-12页 |
| ·基因芯片的发展概况 | 第12-13页 |
| 2.基因芯片的分类 | 第13-14页 |
| ·根据支持介质划分 | 第13页 |
| ·根据芯片上的探针划分 | 第13-14页 |
| 3.基因芯片的制备 | 第14-18页 |
| ·对基因芯片载体的要求 | 第14页 |
| ·基因芯片载体的材料选择 | 第14-15页 |
| ·载体的活化 | 第15页 |
| ·基因芯片的基本制作方法 | 第15-17页 |
| ·制作基因芯片的常用工具 | 第17-18页 |
| 4.基因芯片的应用 | 第18-22页 |
| ·病毒性肝炎基因诊断芯片的开发应用 | 第18-19页 |
| ·基因芯片在肿瘤相关基因的应用研究 | 第19-20页 |
| ·基因芯片在DNA序列测定中的研究 | 第20页 |
| ·DNA芯片在基因表达分析中的研究 | 第20页 |
| ·基因芯片对细菌基因分型及菌种鉴定 | 第20-21页 |
| ·药物筛选 | 第21页 |
| ·给药个性化 | 第21-22页 |
| 5.基因芯片发展前景及存在的问题 | 第22-23页 |
| 6.本研究的目的及意义 | 第23-25页 |
| 第2章 病毒性肝炎基因诊断芯片的设计 | 第25-50页 |
| 1.基因芯片研制的基本原理和总体技术路线 | 第25-27页 |
| ·基因芯片制备的相关技术 | 第25-26页 |
| ·基因芯片的相关技术流程图 | 第26页 |
| ·基因芯片的应用流程图 | 第26-27页 |
| 2.病毒性肝炎基因诊断芯片的设计路线 | 第27-28页 |
| ·肝炎病毒检测芯片设计及研制全过程的流程图 | 第27-28页 |
| 3.病毒性肝炎基因诊断芯片探针设计 | 第28-50页 |
| ·查找序列方法和结果 | 第28-31页 |
| ·探针设计 | 第31-50页 |
| ·探针设计原理 | 第31-33页 |
| ·探针设计中运用工具 | 第33-36页 |
| ·设计原则 | 第36-37页 |
| ·方法和步骤 | 第37-40页 |
| ·布局和对照 | 第40-41页 |
| ·探针设计结果 | 第41-50页 |
| 第3章 病毒性肝炎基因诊断芯片引物设计 | 第50-62页 |
| 1.设计工具 | 第50-51页 |
| 2.设计结果及部分引物列表 | 第51-53页 |
| 3.引物的测试筛选及PCR扩增 | 第53-62页 |
| ·PCR扩增效率指标 | 第53页 |
| ·样品纯化方法 | 第53-54页 |
| ·最适合PCR反应循环条件与最适反应体系配比的建立 | 第54页 |
| ·引物的筛选 | 第54-57页 |
| ·引物的确定 | 第54-55页 |
| ·同一引物用于扩增不同病人标本以判断引物的稳定性 | 第55-56页 |
| ·不对称PCR反应结果 | 第56-57页 |
| ·各肝炎病毒的代表序列的有关资料 | 第57-62页 |
| 第4章 病毒性肝炎基因诊断芯片的制作 | 第62-73页 |
| 1.乙丙型肝炎双检基因芯片的制作 | 第62-64页 |
| ·HBV、HCV克隆的构建 | 第62页 |
| ·监控系统组成 | 第62页 |
| ·芯片点样 | 第62-63页 |
| ·结果判定 | 第63-64页 |
| 2 乙型肝炎基因分型诊断芯片的制作 | 第64-68页 |
| ·玻片的清洗 | 第64页 |
| ·手臂分子的固定 | 第64-66页 |
| ·点样 | 第66-67页 |
| ·芯片结构示意图 | 第67页 |
| ·芯片杂交检测意义 | 第67-68页 |
| 3 丙型肝炎基因分型诊断芯片制作 | 第68-73页 |
| ·基因芯片载体制备 | 第68页 |
| ·基因芯片探针制备 | 第68页 |
| ·HCV基因芯片探针序列及分型诊断 | 第68-70页 |
| ·HCV基因分型诊断基因芯片模板示意图 | 第70-71页 |
| ·HCV基因芯片合成点样 | 第71-73页 |
| 第5章 病毒性肝炎基因诊断芯片的临床应用研究 | 第73-100页 |
| 1.研究对像和诊断标准 | 第73页 |
| 2.配对资料 | 第73-74页 |
| 3.临床研究误差控制措施 | 第74页 |
| 4.基因芯片检测血清中HBVDNA、HCVRNA操作程序及方法 | 第74-75页 |
| ·待测血清样品处理 | 第74页 |
| ·反转录及PCR扩增 | 第74页 |
| ·杂交 | 第74-75页 |
| ·检测分析 | 第75页 |
| 5.基因芯片检测肝组织中HBVDNA操作程序及方法 | 第75-76页 |
| 6.肝组织中HBV免疫组织化学、原位分子杂交法检测的操作程序及方法 | 第76-77页 |
| ·免疫组化标准化的染色方法 | 第76页 |
| ·肝组织HBcAg检测 | 第76页 |
| ·原位分子杂交方法 | 第76-77页 |
| ·肝组织HBVDNA检测 | 第77页 |
| ·例乙型肝炎血清、20例丙型肝炎血清基因芯片检测结果 | 第77-81页 |
| ·例乙型肝炎肝硬化肝组织中HBVDNA基因芯片检测结果 | 第81页 |
| ·例乙型肝炎患者血清及肝活检组织中HBVDNA基因芯片同时检测结果 | 第81-84页 |
| ·例拉米夫定治疗乙型肝炎血清HBVDNA基因芯片检测结果 | 第84-87页 |
| ·标本来源 | 第84页 |
| ·HBVDNA基因扩增序列及扩增片段及探针序列 | 第84-85页 |
| ·结果 | 第85-87页 |
| ·例乙型肝炎病人血清基因芯片分型检测结果 | 第87-89页 |
| ·例丙型肝炎血清HCVRNA分型基因芯片检测结果 | 第89-92页 |
| ·血清标本 | 第89页 |
| ·HCVRNA的分离和纯化 | 第89页 |
| ·逆转录反应步骤 | 第89页 |
| ·巢式PCR反应 | 第89-90页 |
| ·杂交 | 第90页 |
| ·检测分析 | 第90页 |
| ·对5′UTR区扩增产物进行测序 | 第90-91页 |
| ·结果 | 第91-92页 |
| 13.临床实验的部分图片及报告 | 第92-100页 |
| ·乙、丙型肝炎基因双检芯片照片 | 第92-93页 |
| ·丙型肝炎基因分型芯片照片 | 第93-96页 |
| ·免疫组织化学检测结果照片 | 第96-97页 |
| ·原位分子杂交检测结果照片 | 第97-98页 |
| ·测序报告单 | 第98-99页 |
| ·Lightcycle HBVDNA、HCVRNA报告单 | 第99-100页 |
| 第6章 全文讨论 | 第100-106页 |
| 第7章 全文总结 | 第106-108页 |
| 参考文献 | 第108-122页 |
| 在读期间发表的学术论文目录 | 第122-125页 |
| 在读期间承担的科研和获得科研经费资助 | 第125-126页 |
| 在读期间获得科研奖励 | 第126-127页 |
| 在读期间获得表彰和荣誉称号 | 第127-128页 |
| 在读期间申请和获得的专利 | 第128-129页 |
| 致谢 | 第129页 |
