| 致谢 | 第1-11页 |
| 中文摘要 | 第11-13页 |
| 英文摘要 | 第13-15页 |
| 第一篇 文献综述 | 第15-48页 |
| 1 双生病毒的特性与分类 | 第16-31页 |
| 1．1 玉米线条病毒属（Mastrevirus） | 第16-17页 |
| 1．1．1 寄主范围 | 第16页 |
| 1．1．2 传播 | 第16页 |
| 1．1．3 基因组结构 | 第16-17页 |
| 1．1．4 症状 | 第17页 |
| 1．1．5 地理分布 | 第17页 |
| 1．1．6 成员 | 第17页 |
| 1．2 甜菜曲顶病毒属（Curtovirus） | 第17-20页 |
| 1．2．1 寄主范围 | 第17-18页 |
| 1．2．2 传播 | 第18页 |
| 1．2．3 基因组结构 | 第18-19页 |
| 1．2．4 症状 | 第19页 |
| 1．2．5 地理分布 | 第19页 |
| 1．2．6 成员 | 第19-20页 |
| 1．3 番茄伪曲顶病毒属（Topocuvirus） | 第20-21页 |
| 1．3．1 寄主范围 | 第20页 |
| 1．3．2 传播 | 第20页 |
| 1．3．3 基因组结构 | 第20页 |
| 1．3．4 症状 | 第20页 |
| 1．3．5 地理分布 | 第20页 |
| 1．3．6 成员 | 第20-21页 |
| 1．4 菜豆金色花叶病毒属（Begomovirus） | 第21-31页 |
| 1．4．1 寄主范围 | 第21页 |
| 1．4．2 传播 | 第21页 |
| 1．4．3 基因组结构 | 第21-24页 |
| 1．4．4 症状 | 第24页 |
| 1．4．5 地理分布 | 第24页 |
| 1．4．6 抗原特性 | 第24页 |
| 1．4．7 细胞病理学 | 第24-25页 |
| 1．4．8 成员 | 第25-31页 |
| 2 双生病毒的复制和转录 | 第31-35页 |
| 2．1 双生病毒的复制 | 第31-33页 |
| 2．2 双生病毒的转录 | 第33-35页 |
| 3 双生病毒的运动 | 第35-38页 |
| 3．1 组份双生病毒的运动 | 第35-36页 |
| 3．2 单组份双生病毒的运动 | 第36-38页 |
| 4 双生病毒基因组变异 | 第38-42页 |
| 4．1 突变 | 第38-39页 |
| 4．2 获取外源DNA | 第39-40页 |
| 4．3 假重组（Pseudo-Recombination） | 第40页 |
| 4．4 重组 | 第40-42页 |
| 4．4．1 属间重组 | 第40-41页 |
| 4．4．2 Begomovimses属内重组 | 第41-42页 |
| 5 与双生病毒伴随的小分子DNA | 第42-48页 |
| 5．1 缺陷型小分子DNA | 第42-43页 |
| 5．2 DNA1分子的发现 | 第43-44页 |
| 5．3 DNAβ分子 | 第44-48页 |
| 第二篇 研究内容 | 第48-151页 |
| 第一章 材料与方法 | 第48-56页 |
| 1 材料 | 第48页 |
| 1．1 病毒 | 第48页 |
| 1．2 抗血清 | 第48页 |
| 1．3 常用化学试剂分子生物学试剂及仪器 | 第48页 |
| 1．4 常用缓冲液的配制 | 第48页 |
| 2 方法 | 第48-56页 |
| 2．1 植物总DNA提取 | 第48页 |
| 2．2 粉虱传毒试验 | 第48页 |
| 2．3 粒子形态观察 | 第48页 |
| 2．4 三抗体夹心ELISA （TAS-ELISA）测定 | 第48-49页 |
| 2．5 免疫捕获PCR | 第49页 |
| 2．6 PCR反应 | 第49-50页 |
| 2．6．1 反应体系 | 第49页 |
| 2．6．2 反应参数设置 | 第49-50页 |
| 2．7 割胶回收 | 第50-51页 |
| 2．8 DNA克隆技术 | 第51-54页 |
| 2．8．1 连接方法 | 第51页 |
| 2．8．2 感受态细胞制备方法 | 第51-52页 |
| 2．8．3 转化 | 第52页 |
| 2．8．4 重组克隆的筛选 | 第52-53页 |
| 2．8．5 重组质粒PCR鉴定 | 第53页 |
| 2．8．6 重组质粒的提取和纯化 | 第53-54页 |
| 2．9 测序 | 第54页 |
| 2．10 Southern blot分析 | 第54-56页 |
| 2．10．1 电泳及转膜 | 第54页 |
| 2．10．2 探针标记（用Promega Prime-a-Gene DNA Label kit） | 第54-55页 |
| 2．10．3 杂交 | 第55-56页 |
| 第二章 粉虱传双生病毒的TAS-ELISA及PCR快速检测 | 第56-61页 |
| 1 材料与方法 | 第56-57页 |
| 1．1 病毒 | 第56页 |
| 1．2 三抗体夹心ELISA （TAS-ELISA）测定 | 第56页 |
| 1．3 DNA提取及PCR扩增 | 第56-57页 |
| 1．4 田间样品的TAS-ELISA及PCR检测 | 第57页 |
| 2 结果与分析 | 第57-60页 |
| 2．1 粉虱传双生病毒的TAS-ELISA检测 | 第57-58页 |
| 2．2 粉虱传双生病毒的PCR检测 | 第58页 |
| 2．3 粉虱传双生病毒的田间检测 | 第58-60页 |
| 3 讨论 | 第60-61页 |
| 第三章 云南烟草曲叶病毒是菜豆金色花叶病毒属的一个新种 | 第61-70页 |
| 1 材料 | 第61页 |
| 1．1 病毒 | 第61页 |
| 1．2 抗血清 | 第61页 |
| 2 方法 | 第61-63页 |
| 2．1 植物总DNA提取 | 第61页 |
| 2．2 粉虱传毒试验 | 第61页 |
| 2．3 粒子形态观察 | 第61-62页 |
| 2．4 三抗体夹心ELISA （TAS-ELISA）测定 | 第62页 |
| 2．5 引物设计及序列 | 第62页 |
| 2．6 序列分析 | 第62-63页 |
| 3 结果与分析 | 第63-69页 |
| 3．1 病毒病症状及粒子形态 | 第63页 |
| 3．2 病毒粒子形态 | 第63-64页 |
| 3．3 抗原表位型比较 | 第64-65页 |
| 3．4 病毒基因组DNA-A结构 | 第65-66页 |
| 3．5 Y3与其它双生病毒的比较 | 第66-67页 |
| 3．6 Y3与其它双生病毒的分子进化分析 | 第67-69页 |
| 4 讨论 | 第69-70页 |
| 第四章 烟草曲茎病毒是菜豆金色花叶病毒属的一个新种 | 第70-80页 |
| 1 材料 | 第70-71页 |
| 1．1 病毒 | 第70页 |
| 1．2 抗血清 | 第70-71页 |
| 2 方法 | 第71-72页 |
| 2．1 植物总DNA提取 | 第71页 |
| 2．2 粉虱传毒试验 | 第71页 |
| 2．3 粒子形态观察 | 第71页 |
| 2．4 三抗体夹心ELISA （TAS-ELISA）测定 | 第71页 |
| 2．5 引物设计及序列 | 第71-72页 |
| 2．6 序列分析 | 第72页 |
| 3 结果与分析 | 第72-78页 |
| 3．1 病毒病症状及粒子形态 | 第72-73页 |
| 3．2 抗原表位型比较 | 第73-74页 |
| 3．3 病毒基因组DNA-A结构 | 第74-75页 |
| 3．4 Y1与其它双生病毒的比较 | 第75-77页 |
| 3．5 Y1与其它双生病毒DNA-A的分子进化分析 | 第77-78页 |
| 4 讨论 | 第78-80页 |
| 第五章 与烟草曲茎病毒伴随的缺陷干扰型DNA分子鉴定 | 第80-87页 |
| 1 材料 | 第80页 |
| 1．1 病毒 | 第80页 |
| 1．2 抗血清 | 第80页 |
| 2 方法 | 第80-81页 |
| 2．1 免疫捕获PCR | 第80-81页 |
| 2．2 PCR | 第81页 |
| 2．3 Southern blot分析 | 第81页 |
| 3 结果与分析 | 第81-85页 |
| 3．1 小分子DNA的发现 | 第81-82页 |
| 3．2 小分子DNA的分子鉴定 | 第82-84页 |
| 3．3 小分子DNA由病毒粒子包裹 | 第84页 |
| 3．4 小分子DNA由粉虱传播 | 第84-85页 |
| 4 讨论 | 第85-87页 |
| 第六章 与烟草曲茎病毒伴随的卫星DNA的鉴定及其基因组特征 | 第87-96页 |
| 1 材料与方法 | 第87-89页 |
| 1．1 病毒 | 第87页 |
| 1．2 总DNA提取 | 第87页 |
| 1．3 PCR扩增 | 第87-88页 |
| 1．4 克隆 | 第88页 |
| 1．5 测序及序列分析 | 第88页 |
| 1．6 免疫捕获PCR（Immunotrapping PCR,IT-PCR） | 第88页 |
| 1．7 粉虱传毒实验 | 第88-89页 |
| 2 结果与分析 | 第89-94页 |
| 2．1 Y35是烟草曲茎病毒的一个分离物 | 第89页 |
| 2．2 TbCSV DNA β分子的鉴定 | 第89-90页 |
| 2．3 烟草曲茎病毒DNA β结构 | 第90-91页 |
| 2．4 烟草曲茎病毒DNA β与其它双生病毒DNA β的比较 | 第91-92页 |
| 2．5 烟草曲茎病毒DNA β的分子进化分析 | 第92页 |
| 2．6 DNA β由烟草曲茎病毒包裹，且由烟粉虱传播 | 第92-94页 |
| 3 讨论 | 第94-96页 |
| 第七章 云南南瓜曲叶病毒是一种由重组产生的双生病毒新种 | 第96-105页 |
| 1 材料与方法 | 第96-98页 |
| 1．1 病毒 | 第96页 |
| 1．2 抗血清 | 第96页 |
| 1．3 PCR及测序引物 | 第96-97页 |
| 1．4 序列分析 | 第97-98页 |
| 2 结果与分析 | 第98-103页 |
| 2．1 抗原表位型比较 | 第98页 |
| 2．2 Y23病毒基因组DNA-A结构 | 第98-99页 |
| 2．3 Y23与其它双生病毒的比较及分子进化分析 | 第99-102页 |
| 2．4 Y23是重组病毒的证据 | 第102-103页 |
| 3 讨论 | 第103-105页 |
| 第八章 侵染烟草的中国番茄黄化曲叶病毒及其卫星DNA的基因组结构及变异 | 第105-120页 |
| 1 材料和方法 | 第105-107页 |
| 1．1 病毒 | 第105页 |
| 1．2 抗血清 | 第105页 |
| 1．3 PCR扩增、克隆及序列测定 | 第105-106页 |
| 1．4 序列分析 | 第106-107页 |
| 2 结果与分析 | 第107-118页 |
| 2．1 病毒抗原表位型测定 | 第107-108页 |
| 2．2 病毒分离物DNA-A的序列分析 | 第108-109页 |
| 2．3 病毒分离物DNA-A与中国报道其它双生病毒的比较 | 第109-111页 |
| 2．4 Y5、Y8、Y10、Y11、Y36和Y38DNA-A编码蛋白比较 | 第111-112页 |
| 2．5 Y5、Y8、Y10、Y11、Y36和Y38基因间隔区序列比较 | 第112页 |
| 2．6 病毒分离物与其它双生病毒的分子进化分析 | 第112-114页 |
| 2．7 病毒伴随卫星DNA β的鉴定 | 第114页 |
| 2．8 病毒伴随卫星DNA β的结构特征 | 第114-115页 |
| 2．9 TYLCCNV β的同源性比较 | 第115页 |
| 2．10 病毒伴随卫星DNA β与其它DNA β的同源性比较 | 第115-117页 |
| 2．11 病毒伴随卫星DNA β与其它DNA β的分子进化分析 | 第117-118页 |
| 3 讨论 | 第118-120页 |
| 第九章 与赛葵黄脉病毒伴随的卫星DNA分子 | 第120-126页 |
| 1 材料与方法 | 第120-121页 |
| 1．1 病毒 | 第120页 |
| 1．2 DNA提取、PCR扩增、克隆及测序 | 第120页 |
| 1．3 序列分析 | 第120-121页 |
| 2 结果与分析 | 第121-124页 |
| 2．1 与赛葵黄脉病毒伴随的DNA β分子的鉴定 | 第121页 |
| 2．2 Y47 β的结构特征 | 第121-122页 |
| 2．3 Y47 β与其它DNA β的同源性比较 | 第122-123页 |
| 2．4 Y47 β与其它DNA β的分子进化分析 | 第123-124页 |
| 3 讨论 | 第124-126页 |
| 第十章 与中国粉虱传双生病毒伴随的DNA β的特征及与其辅助病毒共进化的证据 | 第126-137页 |
| 1 材料和方法 | 第126-128页 |
| 1．1 病毒 | 第126-127页 |
| 1．2 DNA提取、PCR扩增、克隆及测序 | 第127页 |
| 1．3 序列分析 | 第127-128页 |
| 2 结果与分析 | 第128-134页 |
| 2．1 与中国粉虱传双生病毒伴随的DNA β分子的鉴定 | 第128页 |
| 2．2 DNA β的序列分析 | 第128-129页 |
| 2．3 DNA β分子的结构特征 | 第129-130页 |
| 2．4 DNA β分子与其辅助病毒基因组的共进化 | 第130-134页 |
| 3 讨论 | 第134-137页 |
| 第十一章 与双生病毒伴随的类nanovirus分子的鉴定 | 第137-145页 |
| 1 材料与方法 | 第137-138页 |
| 1．1 病毒 | 第137页 |
| 1．2 总DNA提取 | 第137页 |
| 1．3 PCR扩增 | 第137-138页 |
| 1．4 克隆 | 第138页 |
| 1．5 测序及序列分析 | 第138页 |
| 2 结果与分析 | 第138-141页 |
| 2．1 与中国粉虱传双生病毒伴随的DNA1分子的鉴定 | 第138-139页 |
| 2．2 与中国粉虱传双生病毒伴随的DNA1的序列测定 | 第139页 |
| 2．3 与中国粉虱传双生病毒伴随的DNA1的结构特征 | 第139-140页 |
| 2．4 与中国粉虱传双生病毒伴随的DNA1的序列分析 | 第140-141页 |
| 2．5 与begomoviruses伴随的DNA1分子与nanoviruses小分子的进化分析 | 第141页 |
| 2．6 与begomoviruses伴随的DNA1分子与nanoviruses小分子编码的Rep蛋白的多序列比较分析 | 第141页 |
| 3 讨论 | 第141-145页 |
| 第十二章 云南粉虱传双生病毒田间复合侵染检测 | 第145-151页 |
| 1 材料与方法 | 第145-146页 |
| 1．1 病毒 | 第145页 |
| 1．2 总DNA提取 | 第145页 |
| 1．3 特异引物 | 第145-146页 |
| 2 结果与分析 | 第146-149页 |
| 2．1 DNA-A复合侵染检测 | 第146-149页 |
| 2．2 DNA β复合侵染检测 | 第149页 |
| 3 讨论 | 第149-151页 |
| 全文小结 | 第151-152页 |
| 综述文献 | 第152-162页 |
| 附录A 常用化学试剂、分子生物学试剂及仪器 | 第162-164页 |
| 附录B 常用缓冲液及培养基配方 | 第164-169页 |
| 附录C 博士研究生期间发表的及投稿中的学术论著 | 第169-171页 |
| 附录D EMBL登录基因 | 第171-172页 |
