| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-21页 |
| ·研究背景 | 第12-13页 |
| ·单体型分型的重要意义 | 第13-15页 |
| ·单体型分型计算 | 第15-17页 |
| ·单体型组装问题 | 第15-16页 |
| ·单体型推断问题 | 第16-17页 |
| ·参数计算理论 | 第17-19页 |
| ·本文的主要研究内容及结构安排 | 第19-21页 |
| 第二章 单体型组装问题 | 第21-35页 |
| ·遗传的物质基础及遗传法则 | 第21-25页 |
| ·染色体 | 第21-22页 |
| ·DNA分子与基因 | 第22-24页 |
| ·分子生物学的中心法则 | 第24-25页 |
| ·单核苷酸多态性、单体型和基因型 | 第25-27页 |
| ·单体型组装问题 | 第27-34页 |
| ·单体型组装问题相关概念 | 第28-31页 |
| ·单体型组装问题计算模型及研究现状 | 第31-34页 |
| ·本章小结 | 第34-35页 |
| 第三章 MSR和MFR参数化模型和算法 | 第35-72页 |
| ·引言 | 第35页 |
| ·MSR和MFR参数化模型 | 第35-38页 |
| ·MSR和MFR参数化算法 | 第38-63页 |
| ·预处理 | 第38-40页 |
| ·P_MSR参数化算法 | 第40-44页 |
| ·P_MFR参数化算法 | 第44-51页 |
| ·PG_MSR参数化算法 | 第51-57页 |
| ·PG_MFR参数化算法 | 第57-63页 |
| ·实验结果 | 第63-70页 |
| ·无空隙MSR和MFR算法性能比较 | 第64-68页 |
| ·有空隙MSR和MFR算法性能比较 | 第68-70页 |
| ·本章小结 | 第70-72页 |
| 第四章 有长Mate-Pair时MSR和MFR参数化算法 | 第72-96页 |
| ·引言 | 第72-73页 |
| ·有长Mate-Pair时MSR参数化算法 | 第73-85页 |
| ·有长Mate-Pair片段时MSR参数化模型 | 第73-74页 |
| ·预处理 | 第74-75页 |
| ·PM_MSR算法 | 第75-81页 |
| ·实验结果 | 第81-85页 |
| ·有长Mate-Pair时MFR参数化算法 | 第85-94页 |
| ·有长Mate-Pair片段时MFR参数化模型 | 第85-86页 |
| ·预处理 | 第86页 |
| ·PM_MFR参数化算法 | 第86-92页 |
| ·实验结果 | 第92-94页 |
| ·本章小结 | 第94-96页 |
| 第五章 MEC与MEC/GI参数化模型和算法 | 第96-112页 |
| ·引言 | 第96-97页 |
| ·MEC和MEC/GI参数化模型 | 第97-98页 |
| ·MEC和MEC/GI参数化算法 | 第98-107页 |
| ·P_MEC参数化算法 | 第98-102页 |
| ·P_MEC/GI参数化算法 | 第102-107页 |
| ·实验结果 | 第107-110页 |
| ·本章小结 | 第110-112页 |
| 第六章 WMEC/GS模型和参数化算法 | 第112-127页 |
| ·引言 | 第112页 |
| ·基因型谱加权最小错误纠正模型WMEC/GS | 第112-116页 |
| ·WMEC/GS的参数化算法 | 第116-122页 |
| ·实验结果 | 第122-125页 |
| ·本章小结 | 第125-127页 |
| 第七章 总结 | 第127-131页 |
| ·主要贡献和创新点 | 第127-128页 |
| ·展望 | 第128-131页 |
| 参考文献 | 第131-144页 |
| 致谢 | 第144-146页 |
| 攻读博士学位期间主要的研究成果 | 第146-147页 |