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桑树黄化型萎缩病病原及其响应蛋白的蛋白质组学研究

中文摘要第1-18页
英文摘要第18-21页
第一章 文献综述第21-71页
 1 桑树黄化型萎缩病的研究进展第21-36页
   ·桑树黄化型萎缩病病症研究第21-22页
   ·桑黄化型萎缩病病原研究第22-27页
     ·桑树黄化型萎缩病病原的发现第22-23页
     ·桑树黄化型萎缩病病原的特性第23-24页
     ·桑树黄化型萎缩病病原的分离、保存第24-25页
     ·桑树黄化型萎缩病病原检测第25-26页
     ·桑树黄化型萎缩病病原的分类第26-27页
   ·桑树黄化型萎缩病发病机理的研究第27-30页
   ·桑黄化型萎缩病的传染途径与流行规律研究第30-31页
     ·桑树黄化型萎缩病的传染途径第30-31页
     ·桑树黄化型萎缩病发生、流行的影响因素第31页
   ·桑树黄化型萎缩病的防治技术研究第31-35页
     ·桑树黄化型萎缩病药物防治技术第31-32页
     ·桑品种抗病性鉴定技术第32-33页
     ·无病良种桑苗培育技术第33页
     ·治虫防病技术第33-34页
     ·桑树肥水管理和采伐技术第34页
     ·其它防治技术第34-35页
   ·问题与展望第35-36页
 2 植物逆境胁迫差异蛋白质组学研究进展第36-52页
   ·蛋白质组差异的产生原因及其表现形式第37页
   ·差异蛋白质组学的研究方法第37-40页
     ·双向电泳第37页
     ·用于蛋白质定量和比较研究的质谱相关技术第37-38页
     ·表面增强激光解吸离子化飞行时间质谱(SELDI)技术第38页
     ·HPLC 及CE 技术第38-39页
     ·SELDI 蛋白质芯片技术第39页
     ·生物信息学分析第39-40页
   ·差异蛋白质组学在植物非生物胁迫研究中的进展第40-47页
     ·干旱胁迫第40-41页
     ·盐渍胁迫第41-43页
     ·低温胁迫第43-44页
     ·机械损伤第44页
     ·营养胁迫第44-45页
     ·缺氧和其他非生物胁迫第45-47页
   ·差异蛋白质组学在植物生物胁迫研究中的进展第47-51页
     ·植物与共生微生物的关系第47-48页
     ·植物与病原微生物的关系第48-51页
   ·植物差异蛋白质组学面临的主要问题和展望第51-52页
 3 景天庚酮糖-1,7-二磷酸酶研究进展第52-59页
   ·SBPase 的生物化学研究第52-53页
   ·SBPase 的分子生物学研究第53-54页
   ·SBPase 的结构研究第54-55页
   ·SBPase 基因的表达调控研究第55-57页
   ·SBPase 的基因工程研究第57-58页
   ·问题与展望第58-59页
 4 Rubisco 活化酶研究进展第59-70页
   ·Rubisco 活化酶的分子特性第59-63页
   ·Rubisco 活化酶对Rubisco 的活化机制第63-64页
   ·环境因素对Rubisco 活化酶的影响第64-67页
     ·温度第64-66页
     ·CO_2第66页
     ·光第66页
     ·其它第66-67页
   ·植物生长发育时期、品种和组织间Rubisco 活化酶的活性和表达差异第67-68页
   ·Rubisco 活化酶的基因工程第68-69页
   ·问题与展望第69-70页
 5 本研究的目的意义第70-71页
第二章 桑树黄化型萎缩病病原—植原体蛋白质组 Shotgun 策略分析第71-102页
 1 材料与方法第72-78页
   ·材料第72-73页
     ·植物材料第72页
     ·其它材料第72-73页
   ·方法第73-78页
     ·桑树黄化型萎缩病病株透射电镜检测第73页
     ·桑树黄化型萎缩病植原体的PCR 检测及进化树分析第73-75页
       ·桑树叶片DNA 的提取第73页
       ·桑树黄化型萎缩病病原—植原体的PCR 检测第73-74页
       ·目的片段的回收第74页
       ·目的片段与克隆载体的连接第74页
       ·大肠杆菌DH5α感受态的制备第74-75页
       ·大肠杆菌细胞的转化第75页
       ·阳性克隆质粒的鉴定第75页
       ·序列测定第75页
       ·序列比对分析、进化树绘制第75页
     ·植原体的提取与纯化第75-76页
     ·植原体纯化物的电子显微镜检测第76页
     ·植原体蛋白质的提取第76页
     ·植原体蛋白质的聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第76页
     ·植原体蛋白质组的Shotgun 分析第76-78页
       ·胶内酶解第76-77页
       ·毛细管高效液相色谱第77-78页
       ·质谱检测及蛋白鉴定第78页
 2 结果与分析第78-97页
   ·桑树黄化型萎缩病病症第78页
   ·桑树黄化型萎缩病病原的PCR 检测及其进化树分析第78-79页
   ·桑树黄化型萎缩病病原的电子显微镜检测第79-80页
   ·纯化的植原体的电镜检测第80页
   ·植原体蛋白质组的SDS-PAGE 分析第80-81页
   ·植原体蛋白质组的Shotgun 分析第81-97页
 3 小结第97页
 4 讨论第97-102页
   ·植原体的能量代谢第97-100页
   ·植原体的毒力因子第100页
   ·植原体假定蛋白第100-102页
第三章 桑树黄化型萎缩病病原响应蛋白的蛋白质组学分析第102-129页
 1 材料与方法第102-111页
   ·植物材料第102-103页
   ·方法第103-111页
     ·叶片超薄切片透射电镜观察第103页
     ·桑树叶片蛋白质的提取第103页
     ·蛋白质的纯化第103页
     ·蛋白质的定量第103-104页
     ·桑树叶片蛋白质的聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)第104页
     ·桑树叶片蛋白质的双向电泳第104-106页
       ·第一向等电聚焦电泳第104页
       ·IPG 胶条的平衡第104-105页
       ·灌胶第105-106页
       ·第二向SDS 电泳第106页
       ·染色、脱色第106页
     ·图象的扫描和分析第106-107页
     ·差异点的胶内酶解第107页
     ·MALDI-TOF-MS 质谱分析与数据检索第107-108页
     ·MALDI-TOF/ TOF-MS 质谱分析与数据检索第108页
     ·质谱鉴定的差异表达蛋白的功能分类分析第108-109页
     ·叶绿素含量的测定第109页
     ·叶片净光合速率的测定第109页
     ·叶片羧化效率的测定第109页
     ·荧光参数测定第109-110页
     ·Rubisco 活性的测定第110页
     ·SBPase 活性的测定第110页
     ·桑树叶片可溶性糖及淀粉含量的测定第110-111页
 2 结果与分析第111-122页
   ·植原体侵染对桑树叶片超微结构的影响第111-112页
   ·植原体侵染对桑树生理生化特性的影响第112-115页
     ·植原体侵染对桑树叶片叶绿素含量的影响第112页
     ·植原体侵染对桑树叶片光合能力的影响第112-113页
     ·植原体侵染对桑树叶片羧化效率的影响第113页
     ·植原体侵染对桑树叶片荧光参数的影响第113-114页
     ·植原体侵染对桑树叶片淀粉及可溶性糖含量的影响第114-115页
     ·植原体侵染对桑树叶片SBPase 和Rubisco 活性的影响第115页
   ·桑树叶片的蛋白质单向电泳分析第115-116页
   ·桑树叶片蛋白质的双向电泳分析第116页
   ·差异表达蛋白点的质谱鉴定第116-122页
 3 小结第122页
 4 讨论第122-129页
   ·植原体侵染促进叶绿体蛋白的降解第122-123页
   ·病原响应蛋白的主要生理功能第123-126页
   ·桑树黄化型萎缩病的发病机制第126-129页
第四章 桑树黄化型萎缩病病原响应蛋白—景天庚酮糖-1,7-二磷酸酶基因的克隆与表达分析第129-161页
 1 材料与方法第130-142页
   ·材料第130-131页
     ·植物材料第130页
     ·PCR 引物第130页
     ·载体第130页
     ·其它材料第130-131页
   ·方法第131-142页
     ·MSBPase 的克隆第131-135页
       ·总RNA 的提取第131页
       ·cDNA 的合成第131-132页
       ·MSBPase 中间片段的克隆第132页
       ·MSBPase 的3'RACE第132-133页
       ·cDNA 同聚物加尾反应第133页
       ·MSBPase 的5'RACE第133-134页
       ·MSBPase cDNA 编码区全长序列的获得第134页
       ·目的片段的回收第134页
       ·目的片段与克隆载体的连接第134页
       ·大肠杆菌DH5α感受态的制备第134页
       ·大肠杆菌细胞的转化第134页
       ·质粒DNA 的提取第134-135页
       ·阳性克隆质粒的鉴定第135页
       ·序列测定第135页
     ·MSBPase 序列分析第135页
     ·MSBPase 所编码的蛋白质特性分析第135页
     ·原核表达载体的构建与鉴定第135页
     ·MSBPase 融合蛋白诱导表达与SDS-PAGE 电泳分析第135页
     ·MSBPase 植物表达载体的构建与鉴定第135-136页
     ·农杆菌GV3101 感受态细胞制备及转化第136-137页
     ·拟南芥的无土栽培、转化第137-138页
       ·拟南芥的无土栽培第137页
       ·拟南芥转化方法第137-138页
     ·转基因植株的PCR 鉴定第138页
     ·Northern 杂交分析第138-141页
       ·总RNA 的提取第138页
       ·甲醛变性凝胶电泳第138-139页
       ·转膜第139页
       ·预杂交第139-140页
       ·探针的制备第140页
       ·杂交第140页
       ·洗膜第140-141页
       ·放射自显影第141页
     ·Western 杂交分析第141-142页
       ·抗体的制备第141页
       ·抗血清效价的测定(试管微量沉淀法)第141页
       ·Western 杂交第141-142页
     ·转基因植株的表型分析及相关生理生化指标的测定第142页
       ·植株干重的测定第142页
       ·转基因植株其它生理生化指标的测定第142页
 2 结果与分析第142-158页
   ·MSBPase 的体外扩增与克隆第142-143页
   ·MSBPase 的序列分析第143页
   ·MSBPase 所编码的蛋白质特性分析第143-150页
     ·MSBPase 所编码的蛋白质结构分析第143-147页
     ·MSBPase 所编码的蛋白质结构功能保守区和功能结构域分析第147页
     ·疏水性分析第147-148页
     ·跨膜区分析第148-150页
     ·前导肽和定位分析第150页
   ·原核表达载体的构建第150页
   ·pET30a-SBP 融合蛋白的诱导和抗体制备第150-151页
   ·植物表达载体构建第151-153页
   ·桑树MSBPase 基因在拟南芥中超表达及转基因拟南芥的筛选第153-155页
     ·转基因拟南芥的PCR 鉴定第153页
     ·转基因植株的Northern 杂交第153-154页
     ·转基因植株的Western 杂交第154-155页
   ·转MSBPase 基因拟南芥植株的生理生化特性分析第155-158页
     ·转MSBPase 基因拟南芥植株的表型分析第155页
     ·转MSBPase 基因拟南芥植株的其他特性分析第155-158页
 3 小结第158页
 4 讨论第158-161页
   ·SBPase 对于植物生长发育的影响第158-159页
   ·SBPase 的进化分析第159-161页
第五章 桑树黄化型萎缩病病原响应蛋白-1,5-二磷酸核酮糖羧化酶活化酶cDNA 片段的克隆、原核表达与植物反义表达载体的构建第161-172页
 1 材料与方法第161-164页
   ·材料第161页
   ·RNA 的提取及cDNA 的合成第161-162页
   ·RCA 中间片段的克隆第162页
   ·RCA 3'端的克隆第162-163页
   ·扩增产物的克隆与序列测定第163页
   ·序列分析第163页
   ·原核表达载体的构建第163页
   ·RCA 片段所编码的蛋白原核诱导表达与SDS-PAGE 电泳分析第163-164页
   ·RCA 植物反义表达载体的构建与鉴定第164页
 2 结果与分析第164-170页
   ·RCA 片段的体外扩增与克隆第164-165页
   ·RCA 的序列分析第165页
   ·原核表达载体的构建第165-168页
   ·RCA 片段编码蛋白的原核诱导表达及抗体制备第168页
   ·RCA 植物反义表达载体的构建与鉴定第168-170页
 3 小结第170页
 4 讨论第170-172页
结论第172-173页
参考文献第173-202页
致谢第202-203页
攻读学位期间发表的主要论文第203-204页

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