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大白菜和甘蓝型油菜AP2/ERF家族转录因子的克隆与分析

中文摘要第1-10页
英文摘要第10-13页
符号和缩略词第13-14页
前言第14-15页
第一章 文献综述第15-28页
 1 转录因子第16-17页
 2 大白菜和油菜的AP2/ERF转录因子第17-21页
   ·大白菜的AP2/ERF转录因子第18页
   ·油菜的AP2/ERF转录因子第18-21页
     ·油菜AP2/ERF转录因子的结构第19-21页
     ·油菜AP2/ERF转录因子的生物学功能第21页
 3 基因克隆的方法第21-24页
   ·插入突变第22页
   ·图位克隆第22-23页
   ·RACE技术第23页
   ·电子克隆第23-24页
 4 基因进化与复制第24-28页
   ·基因和基因组复制是产生新遗传特性的源动力第25页
   ·进化基因的进化方向第25-26页
   ·细胞器基因组和核基因组之间的基因转移第26-28页
第二章 大白菜AP2/ERF家族转录因子生物信息学分析第28-48页
 1 材料和方法第29-30页
   ·大白菜和拟南芥数据库来源第29页
   ·数据库的搜索第29页
   ·序列分析和构建进化树第29-30页
   ·生物信息学分析第30页
   ·表达模式的分析第30页
 2 结果与分析第30-46页
   ·大白菜中AP2/ERF家族转录因子的分离与预测第30-32页
   ·大白菜和拟南芥AP2/ERF家族转录因子的进化树分析第32-34页
   ·大白菜与拟南芥AP2/ERF家族转录因子序列比对第34-38页
   ·大白菜与拟南芥AP2/ERF家族转录因子氨基酸序列的特性分析第38-42页
   ·大白菜AP2/ERF家族转录因子的表达模式第42-46页
 3 讨论第46-48页
第三章 甘蓝型油菜"沪油15"中AP2/ERF-B2亚族转录因子的克隆和分析第48-64页
 1 材料与方法第49-50页
   ·数据库的来源第49页
   ·AP2/ERF转录因子的电子克隆第49页
   ·生物信息学分析第49-50页
   ·油菜BnaERF转录因子的PCR和RT-PCR扩增、克隆及鉴定第50页
 2 结果和分析第50-62页
   ·电子克隆获得3个油菜AP2/ERF家族转录因子cDNA序列第50-52页
   ·油菜ERF家族转录因子核苷酸和氨基酸序列的相似性分析第52-53页
   ·油菜ERF家族转录因子推导的氨基酸组成成分及理化性质分析第53页
   ·油菜ERF家族转录因子推导的氨基酸序列疏水性/亲水性分析第53-54页
   ·油菜ERF家族转录因子的序列比对和进化树分析第54-56页
   ·油菜ERF家族转录因子的功能域和二级结构预测与分析第56-57页
   ·油菜ERF家族转录因子的三级结构预测与分析第57-59页
   ·油菜ERF家族转录因子的蛋白质固有无序化特性分析第59-61页
   ·双低油菜"沪油15"中分离ERF-B2亚族转录因子基因第61页
   ·油菜ERF-B2亚族转录因子表达分析第61-62页
 3 讨论第62-64页
第四章 油菜"沪油15"AP2/ERF-B3亚族转录因子的克隆和及其表达载体构建第64-80页
 1 材料与方法第65-66页
   ·数据库的来源第65页
   ·油菜AP2/ERF-B3亚族转录因子的电子克隆第65页
   ·生物信息学分析第65页
   ·油菜AP2/ERF-B3亚族转录因子的分离、克隆及鉴定第65-66页
 2 结果与分析第66-78页
   ·油菜AP2/ERF-B3亚族转录因子cDNA序列的获得第66页
   ·分离BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15转录因子基因第66-68页
   ·BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15的核苷酸和氨基酸序列比较第68-70页
   ·BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15序列比对和进化树第70-71页
   ·BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15氨基酸组成及理化性质第71-72页
   ·BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15氨基酸序列疏水性/亲水性第72-73页
   ·BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15功能域和二级结构预测第73-74页
   ·BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15转录因子三级结构预测第74-75页
   ·BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15转录因子蛋白质无序化第75-76页
   ·油菜BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15转录因子表达载体的构建第76页
   ·BnaERFB3-1和BnaERFB3-2转录因子表达分析第76-78页
 3 讨论第78-80页
第五章 油菜"沪油15"AP2/ERF-B4类转录因子的克隆及表达载体构建第80-96页
 1 材料与方法第81-82页
   ·数据库的来源第81页
   ·转录因子的电子克隆第81页
   ·生物信息学分析第81页
   ·RT-PCR扩增、克隆及鉴定第81页
   ·表达载体的构建及鉴定第81-82页
 2 结果和分析第82-94页
   ·油菜AP2/ERF-B4亚族转录因子的电子克隆第82-83页
   ·油菜BnaERFB4-1-Hy15转录因子的分离第83-84页
   ·BnaERFB4-1转录因子序列分析第84页
   ·BnaERFB4-1转录因子序列比对和进化树分析第84-87页
   ·BnaERFB4-1转录因子推导的氨基酸组成及理化性质分析第87-89页
   ·BnaERFB4-1转录因子推导氨基酸疏水性/亲水性分析第89页
   ·BnaERFB4-1转录因子的功能域和二级结构预测与分析第89-91页
   ·BnaERFB4-1转录因子三级结构预测与分析第91页
   ·BnaERFB4-1转录因子蛋白质固有无序化特性分析第91-92页
   ·BnaERFB4-1转录因子表达载体的构建第92-94页
 3 讨论第94-96页
第六章 甘蓝型油菜"沪油15"两个CBF类转录因子的克隆与分析第96-105页
 1 材料与方法第97页
 2 结果与讨论第97-103页
   ·油菜CBF类转录因子cDNA序列的获得第97-98页
   ·BnaCBF-1-Hy15和BnaCBF-2-Hy15转录因子基因克隆第98-99页
   ·BnaCBF-1-Hy15和BnaCBF-2-Hy15转录因子的进化树分析第99-101页
   ·BnaCBF-1-Hy15和BnaCBF-2-Hy15氨基酸组成及理化性质分析第101页
   ·BnaCBF-1-Hy15和BnaCBF-2-Hy15功能域和二级结构预测与分析第101-103页
   ·BnaCBF-1-Hy15和BnaCBF-2-Hy15三级结构预测与分析第103页
 3 讨论第103-105页
全文结论第105-106页
本文创新点第106-107页
参考文献第107-120页
附录Ⅰ 葡萄全基因组AP2/ERF家族转录因子的分析第120-144页
 1 材料和方法第121-122页
 2 结果与分析第122-140页
 3 讨论第140-141页
 4 参考文献第141-144页
附录Ⅱ 杨树全基因组AP2/ERF家族转录因子的分析第144-168页
 1 材料和方法第145-146页
 2 结果与分析第146-164页
 3 讨论第164页
 4 参考文献第164-168页
攻读博士期间发表和拟发表的学术论文第168-169页
致谢第169页

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