中文摘要 | 第1-10页 |
英文摘要 | 第10-13页 |
符号和缩略词 | 第13-14页 |
前言 | 第14-15页 |
第一章 文献综述 | 第15-28页 |
1 转录因子 | 第16-17页 |
2 大白菜和油菜的AP2/ERF转录因子 | 第17-21页 |
·大白菜的AP2/ERF转录因子 | 第18页 |
·油菜的AP2/ERF转录因子 | 第18-21页 |
·油菜AP2/ERF转录因子的结构 | 第19-21页 |
·油菜AP2/ERF转录因子的生物学功能 | 第21页 |
3 基因克隆的方法 | 第21-24页 |
·插入突变 | 第22页 |
·图位克隆 | 第22-23页 |
·RACE技术 | 第23页 |
·电子克隆 | 第23-24页 |
4 基因进化与复制 | 第24-28页 |
·基因和基因组复制是产生新遗传特性的源动力 | 第25页 |
·进化基因的进化方向 | 第25-26页 |
·细胞器基因组和核基因组之间的基因转移 | 第26-28页 |
第二章 大白菜AP2/ERF家族转录因子生物信息学分析 | 第28-48页 |
1 材料和方法 | 第29-30页 |
·大白菜和拟南芥数据库来源 | 第29页 |
·数据库的搜索 | 第29页 |
·序列分析和构建进化树 | 第29-30页 |
·生物信息学分析 | 第30页 |
·表达模式的分析 | 第30页 |
2 结果与分析 | 第30-46页 |
·大白菜中AP2/ERF家族转录因子的分离与预测 | 第30-32页 |
·大白菜和拟南芥AP2/ERF家族转录因子的进化树分析 | 第32-34页 |
·大白菜与拟南芥AP2/ERF家族转录因子序列比对 | 第34-38页 |
·大白菜与拟南芥AP2/ERF家族转录因子氨基酸序列的特性分析 | 第38-42页 |
·大白菜AP2/ERF家族转录因子的表达模式 | 第42-46页 |
3 讨论 | 第46-48页 |
第三章 甘蓝型油菜"沪油15"中AP2/ERF-B2亚族转录因子的克隆和分析 | 第48-64页 |
1 材料与方法 | 第49-50页 |
·数据库的来源 | 第49页 |
·AP2/ERF转录因子的电子克隆 | 第49页 |
·生物信息学分析 | 第49-50页 |
·油菜BnaERF转录因子的PCR和RT-PCR扩增、克隆及鉴定 | 第50页 |
2 结果和分析 | 第50-62页 |
·电子克隆获得3个油菜AP2/ERF家族转录因子cDNA序列 | 第50-52页 |
·油菜ERF家族转录因子核苷酸和氨基酸序列的相似性分析 | 第52-53页 |
·油菜ERF家族转录因子推导的氨基酸组成成分及理化性质分析 | 第53页 |
·油菜ERF家族转录因子推导的氨基酸序列疏水性/亲水性分析 | 第53-54页 |
·油菜ERF家族转录因子的序列比对和进化树分析 | 第54-56页 |
·油菜ERF家族转录因子的功能域和二级结构预测与分析 | 第56-57页 |
·油菜ERF家族转录因子的三级结构预测与分析 | 第57-59页 |
·油菜ERF家族转录因子的蛋白质固有无序化特性分析 | 第59-61页 |
·双低油菜"沪油15"中分离ERF-B2亚族转录因子基因 | 第61页 |
·油菜ERF-B2亚族转录因子表达分析 | 第61-62页 |
3 讨论 | 第62-64页 |
第四章 油菜"沪油15"AP2/ERF-B3亚族转录因子的克隆和及其表达载体构建 | 第64-80页 |
1 材料与方法 | 第65-66页 |
·数据库的来源 | 第65页 |
·油菜AP2/ERF-B3亚族转录因子的电子克隆 | 第65页 |
·生物信息学分析 | 第65页 |
·油菜AP2/ERF-B3亚族转录因子的分离、克隆及鉴定 | 第65-66页 |
2 结果与分析 | 第66-78页 |
·油菜AP2/ERF-B3亚族转录因子cDNA序列的获得 | 第66页 |
·分离BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15转录因子基因 | 第66-68页 |
·BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15的核苷酸和氨基酸序列比较 | 第68-70页 |
·BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15序列比对和进化树 | 第70-71页 |
·BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15氨基酸组成及理化性质 | 第71-72页 |
·BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15氨基酸序列疏水性/亲水性 | 第72-73页 |
·BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15功能域和二级结构预测 | 第73-74页 |
·BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15转录因子三级结构预测 | 第74-75页 |
·BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15转录因子蛋白质无序化 | 第75-76页 |
·油菜BnaERFB3-1-Hy15和BnaERFB3-2-Hy15转录因子表达载体的构建 | 第76页 |
·BnaERFB3-1和BnaERFB3-2转录因子表达分析 | 第76-78页 |
3 讨论 | 第78-80页 |
第五章 油菜"沪油15"AP2/ERF-B4类转录因子的克隆及表达载体构建 | 第80-96页 |
1 材料与方法 | 第81-82页 |
·数据库的来源 | 第81页 |
·转录因子的电子克隆 | 第81页 |
·生物信息学分析 | 第81页 |
·RT-PCR扩增、克隆及鉴定 | 第81页 |
·表达载体的构建及鉴定 | 第81-82页 |
2 结果和分析 | 第82-94页 |
·油菜AP2/ERF-B4亚族转录因子的电子克隆 | 第82-83页 |
·油菜BnaERFB4-1-Hy15转录因子的分离 | 第83-84页 |
·BnaERFB4-1转录因子序列分析 | 第84页 |
·BnaERFB4-1转录因子序列比对和进化树分析 | 第84-87页 |
·BnaERFB4-1转录因子推导的氨基酸组成及理化性质分析 | 第87-89页 |
·BnaERFB4-1转录因子推导氨基酸疏水性/亲水性分析 | 第89页 |
·BnaERFB4-1转录因子的功能域和二级结构预测与分析 | 第89-91页 |
·BnaERFB4-1转录因子三级结构预测与分析 | 第91页 |
·BnaERFB4-1转录因子蛋白质固有无序化特性分析 | 第91-92页 |
·BnaERFB4-1转录因子表达载体的构建 | 第92-94页 |
3 讨论 | 第94-96页 |
第六章 甘蓝型油菜"沪油15"两个CBF类转录因子的克隆与分析 | 第96-105页 |
1 材料与方法 | 第97页 |
2 结果与讨论 | 第97-103页 |
·油菜CBF类转录因子cDNA序列的获得 | 第97-98页 |
·BnaCBF-1-Hy15和BnaCBF-2-Hy15转录因子基因克隆 | 第98-99页 |
·BnaCBF-1-Hy15和BnaCBF-2-Hy15转录因子的进化树分析 | 第99-101页 |
·BnaCBF-1-Hy15和BnaCBF-2-Hy15氨基酸组成及理化性质分析 | 第101页 |
·BnaCBF-1-Hy15和BnaCBF-2-Hy15功能域和二级结构预测与分析 | 第101-103页 |
·BnaCBF-1-Hy15和BnaCBF-2-Hy15三级结构预测与分析 | 第103页 |
3 讨论 | 第103-105页 |
全文结论 | 第105-106页 |
本文创新点 | 第106-107页 |
参考文献 | 第107-120页 |
附录Ⅰ 葡萄全基因组AP2/ERF家族转录因子的分析 | 第120-144页 |
1 材料和方法 | 第121-122页 |
2 结果与分析 | 第122-140页 |
3 讨论 | 第140-141页 |
4 参考文献 | 第141-144页 |
附录Ⅱ 杨树全基因组AP2/ERF家族转录因子的分析 | 第144-168页 |
1 材料和方法 | 第145-146页 |
2 结果与分析 | 第146-164页 |
3 讨论 | 第164页 |
4 参考文献 | 第164-168页 |
攻读博士期间发表和拟发表的学术论文 | 第168-169页 |
致谢 | 第169页 |