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南瓜性别分化转录组及差异表达基因分析

摘要第8-9页
英文摘要第9-10页
1 前言第11-23页
    1.1 植物性别决定机制第11-14页
        1.1.1 植物性染色体决定机制第11页
        1.1.2 植物性别决定基因第11-13页
        1.1.3 植物激素对性别分化的影响第13-14页
    1.2 植物激素乙烯及相关基因研究进展第14-19页
        1.2.1 乙烯的生物合成第14-15页
        1.2.2 乙烯的信号传导途径第15-17页
        1.2.3 ACC氧化酶基因研究进展第17-18页
        1.2.4 ACC氧化酶基因的表达研究第18页
        1.2.5 植物转录因子第18-19页
        1.2.6 AP2转录因子第19页
    1.3 南瓜性别分化研究进展第19-20页
    1.4 转录组研究进展第20-21页
        1.4.1 转录组技术概述第20-21页
        1.4.2 转录组测序在性别分化中的应用第21页
    1.5 目的与意义第21页
    1.6 研究内容和技术路线第21-23页
        1.6.1 研究内容第21-22页
        1.6.2 技术路线第22-23页
2 材料与方法第23-32页
    2.1 转录组数据分析及差异表达基因验证第23-28页
        2.1.1 植物材料第23页
        2.1.2 RNA测序文库的构建第23页
        2.1.3 RNA-Seq生物信息分析流程第23-24页
        2.1.4 基因表达水平分析第24-25页
        2.1.5 RNA-Seq样品间相关性分析第25页
        2.1.6 样品间差异表达基因的筛选第25-26页
        2.1.7 差异表达基因的GO分析第26页
        2.1.8 差异表达基因的KEGG分析第26页
        2.1.9 部分差异表达基因的qRT-PCR验证第26-28页
    2.2 差异基因ACO的表达分析第28-30页
        2.2.1 植物材料第28-29页
        2.2.2 方法第29-30页
    2.3 差异基因AP2的表达分析第30-32页
        2.3.1 植物材料第30-31页
        2.3.2 方法第31-32页
3 结果与分析第32-65页
    3.1 转录组数据分析及差异表达基因的筛选第32-46页
        3.1.1 样本RNA检测结果第32页
        3.1.2 测序质量分析与数据统计第32-33页
        3.1.3 基因表达水平和相关性分析第33-34页
        3.1.4 差异表达基因的筛选第34-35页
        3.1.5 差异表达基因的GO功能注释第35-36页
        3.1.6 差异表达基因的KEGG分析第36-39页
        3.1.7 性别分化相关差异基因的筛选第39-42页
        3.1.8 部分差异表达基因的qRT-PCR验证第42-46页
    3.2 差异基因ACO的表达分析第46-54页
        3.2.1 CmACO基因在不同器官中的表达模式的研究第46-47页
        3.2.2 CmACO1基因在花不同发育时期表达模式的研究第47-48页
        3.2.3 CmACO1基因在花不同部位表达模式的研究第48-49页
        3.2.4 在激素处理下CmACO1基因的表达分析第49-50页
        3.2.5 CmACO1基因的克隆及序列分析第50-54页
    3.3 差异基因AP2的表达分析第54-65页
        3.3.1 CmAP2基因在不同器官中的表达模式的研究第54-55页
        3.3.2 CmAP2基因在花不同发育时期表达模式的研究第55-56页
        3.3.3 CmAP2基因在花不同部位表达模式的研究第56-57页
        3.3.4 激素处理下CmAP2基因的表达分析第57-58页
        3.3.5 CmAP2基因在授粉后不同时期胚珠中的表达模式第58-59页
        3.3.6 不同激素对未受粉体外胚的影响第59-60页
        3.3.7 CmAP2基因的克隆及序列分析第60-65页
4 讨论第65-68页
    4.1 转录组数据分析,筛选差异表达基因及验证第65-66页
    4.2 CmACO基因的功能初步分析第66页
    4.3 CmAP2基因的功能初步分析第66-68页
5 结论第68-69页
致谢第69-70页
参考文献第70-79页
攻读硕士学位期间发表的学术论文第79页

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