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城市景观娱乐水体人类细菌病原菌多样性及风险研究

摘要第3-4页
abstract第4-5页
主要符号对照表第10-11页
第1章 绪论第11-29页
    1.1 研究背景与意义第11-12页
        1.1.1 城市水体功能第11页
        1.1.2 城市景观娱乐水体的生物风险第11页
        1.1.3 我国城市水体污染现状第11-12页
    1.2 水传性人类细菌病原菌的种类第12-13页
        1.2.1 肠道病原菌第12-13页
        1.2.2 环境病原菌第13页
    1.3 细菌病原菌的检测方法第13-16页
        1.3.1 基于培养和分子生物技术的方法比较第13-15页
        1.3.2 扩增子高通量测序检测细菌病原菌多样性第15-16页
    1.4 细菌病原菌在城市水体中的分布和来源第16-25页
        1.4.1 基于传统方法研究城市水体人类细菌病原菌的分布规律第17-20页
        1.4.2 城市水体人类细菌病原菌多样性研究第20-21页
        1.4.3 细菌病原菌在水体各种介质中的分布第21-23页
        1.4.4 城市水体中细菌病原菌的来源及微生物源解析方法第23-25页
    1.5 研究现状总结第25-26页
    1.6 本研究的目的、主要内容与技术路线第26-29页
        1.6.1 研究目的第26页
        1.6.2 研究内容第26-28页
        1.6.3 技术路线第28-29页
第2章 材料与方法第29-49页
    2.1 环境样品采集与预处理第29页
    2.2 水质指标测定方法第29-30页
    2.3 流式细胞仪测定水中微生物细胞总数第30-31页
    2.4 细菌基因组DNA提取第31-32页
    2.5 高通量测序及数据处理第32-35页
        2.5.1 细菌16S rRNA基因多样性测序实验流程第32-33页
        2.5.2 测序数据处理第33-35页
    2.6 基于高通量测序结果识别潜在病原菌第35-39页
    2.7 基于高通量测序识别人源微生物标记物解析水体中人类粪便污染第39-40页
        2.7.1 已知人类粪便特异性指示菌信息第39页
        2.7.2 基于高通量测序结果识别指示菌种解析人源污染第39-40页
    2.8 qPCR第40-44页
        2.8.1 qPCR目的基因信息第40页
        2.8.2 目的基因标准品质粒制作第40-44页
        2.8.3 qPCR上机测定第44页
    2.9 定量微生物风险评估第44-48页
    2.10 数据统计分析及可视化方法第48-49页
第3章 基于16S rRNA基因高通量测序技术检测细菌病原菌多样性的方法优化第49-62页
    3.1 病原菌16S rRNA基因数据库完善第49-56页
        3.1.1 含有病原菌的属清单(全文简称病原菌属)第49-54页
        3.1.2 23个病原菌属的种水平数据库构建第54-56页
    3.2 高通量测序条件优化选择第56-60页
    3.3 本章小结第60-62页
第4章 城市景观娱乐湖泊细菌病原菌分布特征及风险评价第62-84页
    4.1 研究方案第62-65页
        4.1.1 研究对象概况第62-63页
        4.1.2 采样方案第63-65页
    4.2 湖水营养水平变化规律及影响因素第65-68页
        4.2.1 湖水营养水平时间变化第65-66页
        4.2.2 再生水补入对湖水营养水平的影响第66页
        4.2.3 人工湿地循环净化对湖水营养水平的影响第66-68页
    4.3 细菌群落结构特征第68-71页
        4.3.1 微生物总数变化第68-69页
        4.3.2 细菌群落结构变化特征第69页
        4.3.3 细菌群落结构与环境因子相关性第69-71页
    4.4 细菌病原菌多样性特征第71-75页
        4.4.1 病原菌属多样性第72页
        4.4.2 潜在病原菌种多样性第72-75页
    4.5 病原菌定量第75-80页
        4.5.1 qPCR标准曲线和测定质量第75页
        4.5.2 湖水病原菌整体存在水平第75-77页
        4.5.3 湖水病原菌存在水平的季节变化与空间变化第77-78页
        4.5.4 人工湿地对湖水中病原菌水平的影响第78-80页
    4.6 娱乐活动中病原微生物定量风险评价第80-83页
    4.7 本章小结第83-84页
第5章 城市河流细菌病原菌分布特征及风险评价第84-128页
    5.1 研究方案第84-88页
        5.1.1 研究对象概况第84-86页
        5.1.2 采样方案第86-88页
    5.2 城市河流水质特征第88-91页
        5.2.1 河流长期监测断面水质变化规律第88页
        5.2.2 河水水质特征与生活污水、污水厂出水比较第88-91页
    5.3 细菌群落结构特征第91-95页
        5.3.1 河水、生活污水、污水厂出水中细菌总数第91-92页
        5.3.2 河水、生活污水、污水厂出水中细菌群落结构比较第92-95页
    5.4 河水细菌病原菌多样性特征第95-111页
        5.4.1 河水、生活污水、污水厂出水中病原菌属多样性第95-102页
        5.4.2 河水、生活污水、污水厂出水中潜在病原菌种多样性第102-109页
        5.4.3 河水细菌病原菌多样性特征与其他水体比较第109-111页
    5.5 河水细菌病原菌定量第111-125页
        5.5.1 目的基因qPCR标准曲线和测定质量第111页
        5.5.2 河水、生活污水、污水厂出水中病原菌定量水平第111-115页
        5.5.3 河水与污水中的病原菌定量水平比较第115-116页
        5.5.4 河水中病原菌水平与其他水体比较第116-121页
        5.5.5 河水中病原菌水平与环境因子相关性第121-123页
        5.5.6 病原菌qPCR定量与基于NGS测序检测结果比较第123-125页
    5.6 病原微生物定量风险评价第125-126页
    5.7 本章小结第126-128页
第6章 城市水体原位生态净化/修复措施对细菌病原菌水平的影响第128-144页
    6.1 城市河流人工浮岛生物膜细菌病原菌分布及潜在影响研究方案第128-129页
    6.2 修复河流人工浮岛生物膜、底泥中细菌群落特征第129-133页
        6.2.1 细菌总数第129-130页
        6.2.2 人工浮岛生物膜、底泥细菌群落结构第130-131页
        6.2.3 生物膜、底泥中细菌群落结构与河水中的差异第131-133页
    6.3 人工浮岛生物膜、底泥中细菌病原菌多样性第133-136页
        6.3.1 病原菌属多样性第133-134页
        6.3.2 潜在病原菌种多样性第134-136页
    6.4 人工浮岛生物膜、底泥中病原菌定量水平第136-137页
    6.5 人工浮岛生物膜、底泥与河水中病原菌分布特征比较第137-141页
        6.5.1 多样性特征比较第137-138页
        6.5.2 定量水平比较第138-141页
    6.6 人工浮岛中植物与塑料纤维生物膜中病原菌分布特征比较第141-143页
        6.6.1 多样性特征比较第141页
        6.6.2 定量水平比较第141-143页
    6.7 本章小结第143-144页
第7章 城市河流肠道病原菌污染源解析及管理建议第144-150页
    7.1 利用人类粪便微生物标记物解析城市河流人源污染程度第144-146页
        7.1.1 人源粪便微生物标记物的区域有效性确认第145-146页
        7.1.2 城市河流人源污染程度解析第146页
    7.2 肠道病原菌与河流人源污染程度的相关性分析第146-148页
    7.3 城市河流肠道病原菌的主要输入途径第148-149页
    7.4 城市河流微生物风险管理建议第149页
    7.5 本章小结第149-150页
第8章 结论与建议第150-153页
    8.1 结论第150-152页
    8.2 建议第152-153页
参考文献第153-165页
致谢第165-167页
个人简历、在学期间发表的学术论文及研究成果第167页

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