致谢 | 第4-5页 |
摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-9页 |
主要缩略词及符号表 | 第14-15页 |
文献综述 | 第15-24页 |
引言 | 第24-27页 |
1 材料与方法 | 第27-39页 |
1.1 材料 | 第27-28页 |
1.1.1 供试菌株与昆虫 | 第27页 |
1.1.2 培养基的配制 | 第27页 |
1.1.3 主要试剂 | 第27页 |
1.1.4 主要试剂溶液配方 | 第27-28页 |
1.1.5 主要仪器设备 | 第28页 |
1.2 实验方法 | 第28-39页 |
1.2.1 四大条件下培养罗伯茨绿僵菌 | 第28-30页 |
1.2.2 样本总RNA的提取 | 第30-31页 |
1.2.3 样本基因组DNA的提取 | 第31-32页 |
1.2.4 罗伯茨绿僵菌RNA文库的建立及Illumina测序 | 第32-39页 |
2 结果与分析 | 第39-57页 |
2.1 罗伯茨绿僵菌的RNA-seq测序数据处理及统计分析 | 第39-40页 |
2.1.1 RNA-Seq测序的数据概况 | 第39页 |
2.1.2 RNA-Seq测序的数据质量分析 | 第39-40页 |
2.2 罗伯茨绿僵菌中超多的可变剪接事件 | 第40-42页 |
2.2.1 RNA-Seq测序的数据概况 | 第40-41页 |
2.2.2 可变剪接事件分布 | 第41页 |
2.2.3 可变剪接基因分组及数据分析 | 第41-42页 |
2.3 罗伯茨绿僵菌中剪接因子及其可变剪接事件 | 第42-48页 |
2.3.1 数据中出现的剪接调控子 | 第42-44页 |
2.3.2 U2AF蛋白家族的可变剪接事件 | 第44-48页 |
2.4 罗伯茨绿僵菌中与毒力相关的蛋白酶发生的可变剪接事件 | 第48-50页 |
2.4.1 蛋白酶及其表达状况 | 第48页 |
2.4.2 蛋白酶发生可变剪接事件的比较 | 第48-50页 |
2.5 罗伯茨绿僵菌中几丁质酶的表达及可变剪接事件 | 第50-52页 |
2.5.1 几丁质酶表达 | 第50页 |
2.5.2 几丁质酶中可变剪接事件及物种间可变剪接差异 | 第50-52页 |
2.6 可变剪接基因的分类及功能性注释 | 第52-57页 |
2.6.1 基因分类及功能性注释(GO)结果 | 第52-53页 |
2.6.2 较多变体基因富集的通路分析 | 第53-57页 |
3 讨论 | 第57-60页 |
3.1 RNA-seq 测序优化表达基因框架 | 第57页 |
3.2 高等生物与低等生物可变剪接的比较 | 第57-58页 |
3.3 剪接调控子的可变剪接 | 第58页 |
3.4 与昆虫病原真菌毒力相关基因的可变剪接 | 第58-59页 |
3.5 可变剪接基因的功能性注释 | 第59-60页 |
4 结论 | 第60-61页 |
参考文献 | 第61-65页 |
附录 | 第65-66页 |
作者简介 | 第66页 |