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结合外因素和系统发育树的癌症分析系统设计与实现

摘要第5-6页
ABSTRACT第6页
第1章 绪论第10-16页
    1.1 研究背景及意义第10页
    1.2 国内外研究现状第10-13页
    1.3 本文研究内容与结构第13-16页
第2章 相关理论及技术第16-25页
    2.1 最小二乘法支持向量机LS-SVM第16-17页
    2.2 高通量测序技术简介第17-21页
        2.2.1 高通量测序技术及其发展现状第18页
        2.2.2 高通量测序技术的优点第18页
        2.2.3 高通量测序技术的应用第18-21页
    2.3 公共基因数据库第21-23页
        2.3.1 NCBI第21-22页
        2.3.2 EMBL第22-23页
        2.3.3 DDBJ第23页
    2.4 编程语言选择第23-24页
    2.5 运行环境第24页
    2.6 小结第24-25页
第3章 癌症术后存活时间影响因素分析系统设计第25-33页
    3.1 前言第25页
    3.2 癌症术后存活时间影响因素分析系统第25-27页
        3.2.1 Cox比例风险回归模型第25-26页
        3.2.2 系统分析流程第26-27页
    3.3 性能评估第27-32页
        3.3.1 数据集第27页
        3.3.2 特征提取第27-29页
        3.3.3 结果分析第29-32页
    3.4 小结第32-33页
第4章 基于系统发育树的癌症复发模式分析系统设计第33-42页
    4.1 前言第33页
    4.2 系统发育树第33-34页
    4.3 癌症复发模式分析系统第34-36页
    4.4 性能评估第36-41页
        4.4.1 数据集第36-38页
        4.4.2 结果分析第38-41页
    4.5 小结第41-42页
第5章 基于最大伪似然估计物种树模型的改进系统发育树验证系统设计第42-50页
    5.1 前言第42-43页
    5.2 基于最大伪似然估计物种树模型的验证系统设计第43-47页
        5.2.1 系统验证流程第43页
        5.2.2 数据下载第43-44页
        5.2.3 统计基因号第44-46页
        5.2.4 下载基因序列数据第46页
        5.2.5 构建系统发育树第46页
        5.2.6 最大伪似然估计物种树模型修正第46-47页
    5.3 性能评估第47-49页
    5.4 小结第49-50页
结论第50-52页
参考文献第52-56页
致谢第56-58页
附录A 攻读学位期间所发表的学术论文目录第58-59页
附录B 攻读学位期间所参与的主要项目第59页

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