摘要 | 第5-6页 |
ABSTRACT | 第6页 |
第1章 绪论 | 第10-16页 |
1.1 研究背景及意义 | 第10页 |
1.2 国内外研究现状 | 第10-13页 |
1.3 本文研究内容与结构 | 第13-16页 |
第2章 相关理论及技术 | 第16-25页 |
2.1 最小二乘法支持向量机LS-SVM | 第16-17页 |
2.2 高通量测序技术简介 | 第17-21页 |
2.2.1 高通量测序技术及其发展现状 | 第18页 |
2.2.2 高通量测序技术的优点 | 第18页 |
2.2.3 高通量测序技术的应用 | 第18-21页 |
2.3 公共基因数据库 | 第21-23页 |
2.3.1 NCBI | 第21-22页 |
2.3.2 EMBL | 第22-23页 |
2.3.3 DDBJ | 第23页 |
2.4 编程语言选择 | 第23-24页 |
2.5 运行环境 | 第24页 |
2.6 小结 | 第24-25页 |
第3章 癌症术后存活时间影响因素分析系统设计 | 第25-33页 |
3.1 前言 | 第25页 |
3.2 癌症术后存活时间影响因素分析系统 | 第25-27页 |
3.2.1 Cox比例风险回归模型 | 第25-26页 |
3.2.2 系统分析流程 | 第26-27页 |
3.3 性能评估 | 第27-32页 |
3.3.1 数据集 | 第27页 |
3.3.2 特征提取 | 第27-29页 |
3.3.3 结果分析 | 第29-32页 |
3.4 小结 | 第32-33页 |
第4章 基于系统发育树的癌症复发模式分析系统设计 | 第33-42页 |
4.1 前言 | 第33页 |
4.2 系统发育树 | 第33-34页 |
4.3 癌症复发模式分析系统 | 第34-36页 |
4.4 性能评估 | 第36-41页 |
4.4.1 数据集 | 第36-38页 |
4.4.2 结果分析 | 第38-41页 |
4.5 小结 | 第41-42页 |
第5章 基于最大伪似然估计物种树模型的改进系统发育树验证系统设计 | 第42-50页 |
5.1 前言 | 第42-43页 |
5.2 基于最大伪似然估计物种树模型的验证系统设计 | 第43-47页 |
5.2.1 系统验证流程 | 第43页 |
5.2.2 数据下载 | 第43-44页 |
5.2.3 统计基因号 | 第44-46页 |
5.2.4 下载基因序列数据 | 第46页 |
5.2.5 构建系统发育树 | 第46页 |
5.2.6 最大伪似然估计物种树模型修正 | 第46-47页 |
5.3 性能评估 | 第47-49页 |
5.4 小结 | 第49-50页 |
结论 | 第50-52页 |
参考文献 | 第52-56页 |
致谢 | 第56-58页 |
附录A 攻读学位期间所发表的学术论文目录 | 第58-59页 |
附录B 攻读学位期间所参与的主要项目 | 第59页 |