| 中文摘要 | 第3-5页 |
| 英文摘要 | 第5-6页 |
| 1 绪论 | 第10-21页 |
| 1.1 粪便污染 | 第10页 |
| 1.2 牛粪便污染 | 第10-12页 |
| 1.2.1 牛粪对空气的污染 | 第11页 |
| 1.2.2 牛粪占用土地与对土壤的污染 | 第11-12页 |
| 1.2.3 牛粪对环境水的污染 | 第12页 |
| 1.3 牛粪便污染特征 | 第12-13页 |
| 1.4 牛粪便污染的解决途径 | 第13页 |
| 1.5 水体中粪便污染源的检测方法 | 第13-17页 |
| 1.5.1 MST的指示物选择 | 第14-15页 |
| 1.5.2 MST的源指示物检测方法 | 第15-16页 |
| 1.5.3 MST的源解析方法 | 第16-17页 |
| 1.6 检测水体粪便污染的新型指示菌 | 第17-18页 |
| 1.7 粪便指示菌在水体中的稳定性研究 | 第18-19页 |
| 1.8 研究目的、内容及技术路线 | 第19页 |
| 1.9 研究创新点 | 第19-21页 |
| 2 实验材料和方法 | 第21-39页 |
| 2.1 实验耗材 | 第21-25页 |
| 2.1.1 采集粪便样品 | 第21页 |
| 2.1.2 采集污水样品 | 第21-22页 |
| 2.1.3 实验试剂与耗材 | 第22-23页 |
| 2.1.4 主要试剂盒 | 第23页 |
| 2.1.5 主要仪器设备 | 第23-24页 |
| 2.1.6 实验主要溶液及配制方法 | 第24-25页 |
| 2.2 实验方法和步骤 | 第25-39页 |
| 2.2.1 提取粪便样品基因组DNA | 第25-26页 |
| 2.2.2 粪便基因组DNA的验证 | 第26-27页 |
| 2.2.3 高通量测序(454焦磷酸测序) | 第27页 |
| 2.2.4 高通量数据分析 | 第27页 |
| 2.2.5 各物种间和牛粪便样品间的微生物多样性分析 | 第27-28页 |
| 2.2.6 探究基因标记物特异性 | 第28-29页 |
| 2.2.7 测定基因标记物阳性率 | 第29页 |
| 2.2.8 确定基因标记物灵敏度 | 第29-34页 |
| 2.2.9 基因标记物的实用性验证 | 第34-35页 |
| 2.2.10 选择最适牛粪便基因标记物 | 第35页 |
| 2.2.11 基因标记物稳定性及衰减规律的研究 | 第35-39页 |
| 3 实验结果与分析 | 第39-51页 |
| 3.1 基因组DNA的数据结果 | 第39页 |
| 3.1.1 基因组DNA的数据结果分析 | 第39页 |
| 3.2 微生物数据结果 | 第39-44页 |
| 3.2.1 高通量测序结果 | 第39-40页 |
| 3.2.2 不同物种肠道微生物多样性的结果 | 第40-41页 |
| 3.2.3 不同物种肠道微生物多样性结果分析 | 第41-42页 |
| 3.2.4 不同牛粪便样品的微生物多样性结果 | 第42-44页 |
| 3.2.5 不同牛粪便样品的微生物多样性结果分析 | 第44页 |
| 3.2.6 Faecalibacterium菌在各物种的比例结果 | 第44页 |
| 3.3 基因标记物的确定 | 第44-45页 |
| 3.3.1 初步选择基因标记物引物 | 第44-45页 |
| 3.4 基因标记物特异性与阳性率结果 | 第45-46页 |
| 3.4.1 特异性结果 | 第45页 |
| 3.4.2 特异性结果分析 | 第45-46页 |
| 3.4.3 阳性率结果 | 第46页 |
| 3.4.4 阳性率结果分析 | 第46页 |
| 3.5 基因标记物灵敏度与实用性结果 | 第46-48页 |
| 3.5.1 重组质粒的测序检测 | 第46页 |
| 3.5.2 连接转化实验讨论 | 第46页 |
| 3.5.3 灵敏度结果 | 第46-47页 |
| 3.5.4 灵敏度结果分析 | 第47页 |
| 3.5.5 实用性结果 | 第47页 |
| 3.5.6 实用性结果分析 | 第47-48页 |
| 3.5.7 确定最适牛粪便基因标记物 | 第48页 |
| 3.6 基因标记物稳定性探究结果 | 第48-51页 |
| 3.6.1 水环境和温度对基因标记物稳定性的影响 | 第48页 |
| 3.6.2 光照时间对基因标记物稳定性的影响 | 第48-49页 |
| 3.6.3 基因标记物稳定性探究结果分析 | 第49-51页 |
| 4 结论与展望 | 第51-55页 |
| 4.1 总结 | 第51-52页 |
| 4.2 讨论 | 第52-53页 |
| 4.3 后续探究工作展望 | 第53-55页 |
| 致谢 | 第55-56页 |
| 参考文献 | 第56-61页 |