| 摘要 | 第5-7页 |
| abstract | 第7-8页 |
| 第一章 引言 | 第14-24页 |
| 1.1 构建优良根系构型是提高油菜生产力的有效途径 | 第14页 |
| 1.2 植物根系分类及其形态建成 | 第14-15页 |
| 1.3 作物根系性状的分子遗传学研究进展 | 第15-23页 |
| 1.3.1 作物根系研究方法 | 第15-17页 |
| 1.3.2 QTL定位 | 第17-18页 |
| 1.3.3 关联分析 | 第18-19页 |
| 1.3.4 转录组测序 | 第19-20页 |
| 1.3.5 作物根系性状基因克隆情况 | 第20-22页 |
| 1.3.6 油菜根系性状分子遗传学研究进展 | 第22-23页 |
| 1.4 本研究的主要内容和目的意义 | 第23-24页 |
| 第二章 实验材料与方法 | 第24-34页 |
| 2.1 实验材料 | 第24页 |
| 2.2 水培实验设计及性状调查 | 第24-27页 |
| 2.2.1 油菜营养生长阶段根系表型精准鉴定体系 | 第24-25页 |
| 2.2.2 水培实验流程 | 第25-26页 |
| 2.2.3 水培实验设计 | 第26-27页 |
| 2.2.4 水培实验性状调查 | 第27页 |
| 2.3 田间实验设计及性状调查 | 第27-29页 |
| 2.3.1 田间实验设计 | 第27-29页 |
| 2.3.2 田间实验性状考察 | 第29页 |
| 2.4 数据统计分析 | 第29-30页 |
| 2.5 全基因组关联分析 | 第30页 |
| 2.6 QTL定位与整合 | 第30-31页 |
| 2.7 转录组测序 | 第31-34页 |
| 2.7.1 样品准备 | 第31页 |
| 2.7.2 转录组测序流程 | 第31页 |
| 2.7.3 差异表达基因(DEGs)的筛选和功能分类 | 第31-32页 |
| 2.7.4 RT-PCR对测序结果的验证 | 第32-34页 |
| 第三章 结果与分析 | 第34-79页 |
| 3.1 油菜根系与地上部生物量、株型和产量的关系 | 第34-38页 |
| 3.1.1 两种磷水平下80份材料在两个发育时期性状表现 | 第34页 |
| 3.1.2 80份材料根系性状间以及根系与地上部性状间相关性 | 第34-38页 |
| 3.2 两种培养方式下(大田和水培)根系性状相关性分析 | 第38-40页 |
| 3.3 根系表型精准鉴定体系可靠性评价及根系性状全基因组关联分析 | 第40-55页 |
| 3.3.1 油菜营养生长阶段根系表型精准鉴定体系可靠性评价 | 第40-44页 |
| 3.3.2 关联群体营养生长阶段各根系相关性状遗传相关性 | 第44-46页 |
| 3.3.3 生长动态分析显示油菜营养生长阶段存在两种调控根系发育的分子机制(persistent and stage-specific) | 第46-48页 |
| 3.3.4 油菜营养生长阶段根系性状全基因组关联分析 | 第48-55页 |
| 3.4 RIL群体根系、株型和产量性状QTL定位 | 第55-73页 |
| 3.4.1 亲本及RIL群体性状表现 | 第55页 |
| 3.4.2 RIL群体不同发育时期各根系性状间遗传相关性 | 第55-62页 |
| 3.4.3 RIL群体根系性状、株型和产量性状QTL定位概况 | 第62-65页 |
| 3.4.4 RIL群体营养生长阶段根系发育遗传规律及根系与地上部性状QTL共定位情况 | 第65-67页 |
| 3.4.5 多效性QTLcluster检测及解析 | 第67-68页 |
| 3.4.6 有研究价值的根系性状QTLcluster | 第68-72页 |
| 3.4.7 有研究价值的根系性状QTLcluster与氮吸收效率共定位情况 | 第72-73页 |
| 3.5 根系性状极端材料转录组测序以及候选基因筛选 | 第73-79页 |
| 3.5.1 材料的选择及其根系性状差异 | 第73-74页 |
| 3.5.2 转录组测序概况 | 第74页 |
| 3.5.3 差异表达基因筛选及其功能注释和分类 | 第74-75页 |
| 3.5.4 GWAS分析、QTL定位与差异表达基因结合筛选候选基因 | 第75-79页 |
| 第四章 讨论 | 第79-85页 |
| 4.1 根系形态在油菜株型形态建成、生物量和产量形成中的作用 | 第79页 |
| 4.2 油菜营养生长阶段根系表型精准鉴定体系的优点和应用 | 第79-80页 |
| 4.3 油菜营养生长阶段根系生长发育规律及两种分子调控机制(持续型和时期特异性) | 第80页 |
| 4.4 油菜根系性状遗传研究中调查时期和调查性状选择 | 第80-82页 |
| 4.5 本研究检测到的重要的根系性状QTLcluster | 第82-84页 |
| 4.6 GWAS、QTL定位结合RNA-seq可以加速根系性状候选基因的筛选 | 第84-85页 |
| 第五章 全文结论 | 第85-87页 |
| 参考文献 | 第87-100页 |
| 附录 | 第100-141页 |
| 致谢 | 第141-142页 |
| 作者简历 | 第142页 |
