中文摘要 | 第3-5页 |
英文摘要 | 第5-7页 |
1 绪论 | 第10-16页 |
1.1 课题的提出及研究意义 | 第10页 |
1.2 抗菌分子的发展 | 第10-12页 |
1.3 抗菌肽 | 第12-13页 |
1.3.1 抗菌肽的概念 | 第12页 |
1.3.3 抗菌肽的研究现状 | 第12-13页 |
1.4 β-内酰胺分子 | 第13页 |
1.4.1 β-内酰胺分子的概念 | 第13页 |
1.4.2 β-内酰胺分子的作用机理 | 第13页 |
1.5 磺胺类抗菌分子 | 第13-14页 |
1.5.1 磺胺类抗菌分子概念 | 第13页 |
1.5.2 磺胺类抗菌分子的作用机理 | 第13-14页 |
1.6 本论文的研究思路与主要内容 | 第14-16页 |
1.6.1 本文的主要研究内容 | 第14页 |
1.6.2 本文的主要创新点 | 第14-15页 |
1.6.3 技术路线 | 第15-16页 |
2 原理与方法 | 第16-20页 |
2.1 2D-QSAR | 第16页 |
2.1.1 偏最小二乘方法 | 第16页 |
2.1.2 遗传算法 | 第16页 |
2.2 Topomer CoMFA | 第16-17页 |
2.3 QSAR模型的评价 | 第17-18页 |
2.4 Topomer Search | 第18页 |
2.5 I-TASSER | 第18-19页 |
2.5.1 I-TASSER预测蛋白质结构 | 第18-19页 |
2.5.2 I-TASSER结构预测的评价 | 第19页 |
2.6 Surflex-Dock分子对接 | 第19-20页 |
3 抗菌肽的定量构效关系研究 | 第20-32页 |
3.1 数据来源 | 第20页 |
3.2 抗菌肽的定量构效关系研究 | 第20-21页 |
3.2.1 抗菌肽结构的表征 | 第20-21页 |
3.2.2 变量的筛选及模型的建立 | 第21页 |
3.3 结果与讨论 | 第21-28页 |
3.3.1 10 种表征方法构建模型的比较 | 第21-24页 |
3.3.2 基于FASGAI与z-scales的PLS模型比较 | 第24-25页 |
3.3.3 基于FASGAI建立的模型的分析 | 第25-28页 |
3.4 抗菌肽结构及活性位点的预测 | 第28-30页 |
3.5 抗菌肽的设计 | 第30页 |
3.6 本章小结 | 第30-32页 |
4 头孢菌素类分子的定量构效关系研究 | 第32-47页 |
4.1 现有头孢菌素类药物进行定量构效关系研究 | 第32-37页 |
4.1.1 数据来源 | 第32-34页 |
4.1.2 Topomer CoMFA建模及结果分析 | 第34-37页 |
4.2 头孢菌素类分子设计和分子对接研究 | 第37-46页 |
4.2.1 数据来源 | 第37-38页 |
4.2.2 Topomer CoMFA建模及结果分析 | 第38-41页 |
4.2.3 Topomer Search和分子设计 | 第41-43页 |
4.2.4 头孢菌素类分子基于分子对接进行构效关系的研究 | 第43-46页 |
4.3 本章小结 | 第46-47页 |
5 磺胺类抗菌分子定量构效关系研究 | 第47-52页 |
5.1 数据来源 | 第47-49页 |
5.2 Topomer CoMFA建模及结果分析 | 第49-51页 |
5.3 本章小结 | 第51-52页 |
6 总结与展望 | 第52-55页 |
6.1 本文工作总结 | 第52-53页 |
6.2 后续研究与展望 | 第53-55页 |
致谢 | 第55-56页 |
参考文献 | 第56-63页 |
附录 | 第63-64页 |
A. 作者在攻读学位期间发表的论文和专利 | 第63页 |
B. 支持信息 | 第63-64页 |