摘要 | 第6-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
主要英文缩略词表 | 第12-13页 |
第一章 文献综述 | 第13-33页 |
1.1 FecB基因在绵羊中的研究进展 | 第13-18页 |
1.1.1 绵羊FecB基因检测及主要表型效应研究 | 第13-15页 |
1.1.2 绵羊FecB基因影响内分泌机制研究探索 | 第15-17页 |
1.1.3 FecB突变调控排卵的分子机制研究 | 第17-18页 |
1.2 哺乳动物卵巢器官功能研究进展 | 第18-23页 |
1.2.1 哺乳动物卵巢组织结构与卵泡发育 | 第18-20页 |
1.2.2 哺乳动物卵巢的基因表达和调控研究 | 第20-23页 |
1.2.3 绵、山羊卵巢的转录组研究近况 | 第23页 |
1.3 单细胞转录组学测序技术 | 第23-27页 |
1.3.1 单细胞转录组学分析技术的发展历程 | 第24页 |
1.3.2 单细胞转录组测序一般流程 | 第24-26页 |
1.3.3 单细胞转录组测序的灵敏度和技术噪声 | 第26页 |
1.3.4 单细胞转录组测序技术的应用 | 第26-27页 |
1.4 代谢组学测定技术 | 第27-31页 |
1.4.1 代谢组学的研究分析方法 | 第28-30页 |
1.4.2 代谢组学在畜牧业中的应用 | 第30-31页 |
1.5 研究目的和意义 | 第31-32页 |
1.6 技术路线 | 第32-33页 |
第二章 小尾寒羊FecB突变的繁殖表型效应研究 | 第33-43页 |
2.1 引言 | 第33页 |
2.2 材料与方法 | 第33-36页 |
2.2.1 试验动物 | 第33页 |
2.2.2 TaqMan探针分型及试验分组 | 第33-34页 |
2.2.3 试验处理与试验设计 | 第34页 |
2.2.4 发情表型测定 | 第34-35页 |
2.2.5 排卵表型测定 | 第35页 |
2.2.6 血清收集及激素测定 | 第35-36页 |
2.2.7 数据统计与分析 | 第36页 |
2.3 试验结果 | 第36-40页 |
2.3.1 小尾寒羊母羊的FecB基因遗传特征及其与产羔数性状的关联分析 | 第36-37页 |
2.3.2 发情表型测定 | 第37-38页 |
2.3.3 排卵时间及排卵数测定 | 第38页 |
2.3.4 完整情期内小尾寒羊血清中P_4、FSH、LH和E_2激素浓度的差异 | 第38-40页 |
2.3.5 完整情期内小尾寒羊的发情、激素和排卵状况 | 第40页 |
2.4 讨论 | 第40-42页 |
2.5 小结 | 第42-43页 |
第三章 小尾寒羊FecB突变后的卵巢代谢效应研究 | 第43-55页 |
3.1 引言 | 第43页 |
3.2 材料与方法 | 第43-45页 |
3.2.1 试验动物和分组 | 第43页 |
3.2.2 排卵数数据收集 | 第43-44页 |
3.2.3 样品采集和卵泡数据测量 | 第44页 |
3.2.4 LC-MS和GC-MS分析 | 第44页 |
3.2.5 数据提取和化合物鉴定 | 第44页 |
3.2.6 代谢物定量和统计分析 | 第44-45页 |
3.3 试验结果 | 第45-52页 |
3.3.1 排卵数、排卵前大卵泡数和直径的测定 | 第45页 |
3.3.2 卵泡液和卵巢静脉血清的代谢组学数据概览 | 第45-47页 |
3.3.3 在FF和OVS中鉴定FecB基因突变效应的分子标志物 | 第47-48页 |
3.3.4 卵泡液中能量代谢的变化 | 第48页 |
3.3.5 BB型绵羊的FF中拥有较高的氨基酸水平 | 第48-49页 |
3.3.6 提高BB绵羊FF的抗氧化防御能力 | 第49-51页 |
3.3.7 OVS样品中类固醇激素的变化情况 | 第51页 |
3.3.8 代谢物差异与排卵数之间的关系 | 第51-52页 |
3.4 讨论 | 第52-53页 |
3.5 小结 | 第53-55页 |
第四章 利用单细胞RNA-Seq分析FecB突变在绵羊卵母细胞和卵丘颗粒细胞中的效应 | 第55-81页 |
4.1 引言 | 第55页 |
4.2 材料与方法 | 第55-60页 |
4.2.1 试验动物和分组 | 第55-56页 |
4.2.2 试验仪器 | 第56页 |
4.2.3 试验试剂耗材 | 第56-57页 |
4.2.4 单细胞RNA-Seq建库及测序流程 | 第57页 |
4.2.5 卵母细胞和卵丘颗粒细胞收集 | 第57-58页 |
4.2.6 单细胞RNA扩增及cDNA文库构建 | 第58-59页 |
4.2.7 上机测序 | 第59页 |
4.2.8 测序原始数据质量及过滤 | 第59-60页 |
4.2.9 参考序列比对和基因差异表达分析 | 第60页 |
4.2.10 GO和KEGG通路富集分析 | 第60页 |
4.3 试验结果 | 第60-79页 |
4.3.1 采样细胞状态及单细胞RNA扩增检测 | 第60-62页 |
4.3.2 测序原始数据质量评估及过滤 | 第62-67页 |
4.3.3 与绵羊基因组序列比对情况 | 第67-68页 |
4.3.4 测序文库的分类注释 | 第68-69页 |
4.3.5 卵母细胞和卵丘颗粒细胞RNA-Seq相关性检查 | 第69-70页 |
4.3.6 基因差异表达分析概览 | 第70-72页 |
4.3.7 差异表达基因的GO富集分析 | 第72-73页 |
4.3.8 差异表达基因的KEGG富集分析 | 第73-77页 |
4.3.9 重要繁殖相关基因的差异表达情况 | 第77-78页 |
4.3.10 颗粒细胞荧光定量PCR验证 | 第78-79页 |
4.4 讨论 | 第79-80页 |
4.5 小结 | 第80-81页 |
第五章 结论 | 第81-82页 |
参考文献 | 第82-101页 |
致谢 | 第101-102页 |
附录 | 第102-110页 |
个人简历 | 第110-111页 |