| 摘要 | 第4-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-14页 |
| 1.1 细胞凋亡与癌症 | 第10-11页 |
| 1.2 转录组学与癌基因组学 | 第11页 |
| 1.3 RNA-Seq与微阵列转录组数据 | 第11-12页 |
| 1.4 相关网络数据库及应用工具介绍 | 第12-14页 |
| 第2章 凋亡网络分析 | 第14-27页 |
| 2.1 细胞凋亡相关基因选择 | 第14-18页 |
| 2.2 凋亡相关基因的PPI网络构建 | 第18页 |
| 2.3 凋亡网络的拓扑特性分析 | 第18-21页 |
| 2.4 凋亡网络社区发现 | 第21-23页 |
| 2.5 凋亡网络进化分析 | 第23-27页 |
| 第3章 多种癌细胞凋亡机制的比较研究 | 第27-96页 |
| 3.1 数据获取与整理 | 第27-34页 |
| 3.1.1 差异表达基因的鉴定 | 第28-30页 |
| 3.1.2 差异表达基因的功能家族分析 | 第30页 |
| 3.1.3 十五种癌症差异表达基因的路径富集分析 | 第30-31页 |
| 3.1.4 十五种癌症中差异表达基因的GO的分层分析 | 第31-33页 |
| 3.1.5 细胞凋亡相关的转录因子和死亡结构域超家族的收集 | 第33-34页 |
| 3.2 数据处理结果 | 第34-91页 |
| 3.2.1 不同功能性家族的特异性表达基因的分析 | 第34-49页 |
| 3.2.2 十五种肿瘤差异表达基因的重叠分析 | 第49-54页 |
| 3.2.3 与凋亡相关的GOterms的三个层次分析 | 第54-76页 |
| 3.2.4 不同水平上细胞凋亡途径的分析 | 第76-79页 |
| 3.2.5 细胞凋亡阶段死亡结构域超家族蛋白的分析 | 第79-82页 |
| 3.2.6 细胞凋亡中涉及到的基因的不同功能组 | 第82-87页 |
| 3.2.7 与细胞凋亡相关的差异性表达转录因子的分析 | 第87-91页 |
| 3.3 凋亡相关基因可分泌入血液中的预测分析 | 第91-94页 |
| 3.4 本章小结 | 第94-96页 |
| 第4章 研究总结与展望 | 第96-97页 |
| 4.1 本文主要工作及存在的问题 | 第96页 |
| 4.2 未来展望 | 第96-97页 |
| 参考文献 | 第97-102页 |
| 附录Ⅰ | 第102-108页 |
| 作者简介 | 第108-109页 |
| 致谢 | 第109页 |
