首页--生物科学论文--生物工程学(生物技术)论文--仿生学论文--生物信息论论文

赖氨酸翻译后修饰位点的计算识别与生物信息分析

摘要第3-5页
abstract第5-7页
第1章 绪论第11-31页
    1.1 研究背景第11-12页
    1.2 赖氨酸翻译后几种修饰第12-16页
        1.2.1 丙二酰化修饰第14页
        1.2.2 丙酰化修饰第14-15页
        1.2.3 巴豆酰化修饰第15-16页
    1.3 蛋白质翻译后修饰(PTMs)位点计算识别第16-27页
        1.3.1 计算识别PTMs位点方法及研究现状第16-18页
        1.3.2 计算识别蛋白质PTMs位点流程第18-19页
        1.3.3 蛋白质PTMs相关数据库第19-21页
        1.3.4 蛋白质PTMs位点计算预测的几类特征第21-25页
        1.3.5 两类特征优化算法第25-26页
        1.3.6 计算识别PTMs位点模型评估的几个重要参数第26页
        1.3.7 计算识别PTMs位点在线网络构建第26-27页
    1.4 蛋白质翻译后修饰生物信息学分析的相关工具第27-28页
        1.4.1 Cytoscape第27页
        1.4.2 Motif-x第27页
        1.4.3 DISPRED第27-28页
        1.4.4 Fisher'sexacttest第28页
    1.5 本论文思路及主要工作内容第28-31页
第2章 物种特异性丙二酰化修饰的计算识别第31-43页
    2.1 引言第31-32页
    2.2 数据和方法第32-35页
        2.2.1 总体框架第32-33页
        2.2.2 数据搜集和处理第33页
        2.2.3 特征提取和优化第33-34页
        2.2.4 基于SVM进行特征筛选第34-35页
        2.2.5 模型训练和性能评估第35页
    2.3 结果与讨论第35-41页
        2.3.1 功能分析第35-37页
        2.3.2 序列分析第37-39页
        2.3.3 进化信息分析第39-40页
        2.3.4 性能评估第40-41页
    2.4 结论第41-43页
第3章 原核生物丙酰化修饰计算预测与功能分析第43-55页
    3.1 前言第43-44页
    3.2 数据和方法第44-47页
        3.2.1 数据收集和处理第44页
        3.2.2 三步特征筛选法建立丙酰化位点预测模型第44-46页
        3.2.3 功能分析第46-47页
    3.3 结果与讨论第47-54页
        3.3.1 构建原核生物丙酰化修饰在线预测工具第47-50页
        3.3.2 原核生物丙酰化修饰功能分析第50-54页
    3.4 结论第54-55页
第4章 氨基酸突变前后巴豆酰化修饰的计算预测第55-67页
    4.1 前言第55-58页
    4.2 数据和方法第58-60页
        4.2.1 基准数据集第58-59页
        4.2.2 特征提取与优化第59页
        4.2.3 功能分析第59-60页
    4.3 结果与讨论第60-65页
        4.3.1 在线预测工具第60-62页
        4.3.2 功能分析第62-65页
    4.4 结论第65-67页
第5章 赖氨酸PTMs及原位共修饰的蛋白质组学分析第67-85页
    5.1 前言第67-69页
    5.2 数据和方法第69-71页
        5.2.1 数据收集和处理第69-70页
        5.2.2 序列及结构分析第70页
        5.2.3 GO和KEGG分析第70页
        5.2.4 进化保守性分析第70-71页
        5.2.5 人类基因突变和疾病相关数据第71页
    5.3 结果与讨论第71-84页
        5.3.1 赖氨酸竞争性的suffering多重原位共修饰第71-73页
        5.3.2 序列和结构偏好第73-76页
        5.3.3 保守性分析第76-78页
        5.3.4 GO和KEGG分析第78-80页
        5.3.5 赖氨酸PTMs与疾病相关的氨基酸突变第80-82页
        5.3.6 转录因子蛋白与PTMs第82-84页
    5.4 结论第84-85页
第6章 结论与展望第85-87页
    6.1 结论第85页
    6.2 展望第85-87页
致谢第87-89页
参考文献第89-105页
附录A 附录图第105-118页
附录B 附录表第118-130页
攻读学位期间的研究成果第130页

论文共130页,点击 下载论文
上一篇:下丘听觉行为相关反应模式神经元的时程选择性及神经抑制对声反应的影响
下一篇:库车坳陷东部碎屑岩层新生代断层传播褶皱过程中的裂缝发育模式