| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 前言 | 第13-19页 |
| 第一章 关键技术介绍 | 第19-33页 |
| 1.1 高通量测序技术 | 第19-20页 |
| 1.2 NGS数据分析关键软件 | 第20-24页 |
| 1.2.1 质量控制(QualityControl) | 第20-22页 |
| 1.2.2 序列比对 | 第22-23页 |
| 1.2.3 序列拼接 | 第23-24页 |
| 1.3 微生物检测算法流程 | 第24-26页 |
| 1.4 Docker虚拟化技术 | 第26-28页 |
| 1.4.1 虚拟化技术 | 第26-27页 |
| 1.4.2 引入Docker的意义 | 第27页 |
| 1.4.3 Docker的优势 | 第27-28页 |
| 1.4.4 Docker基本概念 | 第28页 |
| 1.5 数据可视化 | 第28-33页 |
| 1.5.1 基因组数据可视化 | 第29-30页 |
| 1.5.2 分析操作可视化 | 第30-31页 |
| 1.5.3 数据处理结果的可视化 | 第31-33页 |
| 第二章 平台设计 | 第33-43页 |
| 2.1 算法选择 | 第33-34页 |
| 2.2 流程设计及优化 | 第34-38页 |
| 2.2.1 典型的生物信息流程 | 第34-36页 |
| 2.2.2 设计并优化分析流程 | 第36-38页 |
| 2.3 数据库集成和构建 | 第38-40页 |
| 2.3.1 重要人兽共患病相关的宿主基因序列数据库的收集 | 第38页 |
| 2.3.2 重要人兽共患病病原微生物序列库的收集 | 第38-40页 |
| 2.4 Web可视化设计 | 第40-43页 |
| 2.4.1 可视化Web平台业务流程设计 | 第40页 |
| 2.4.2 Web平台功能设计 | 第40-43页 |
| 第三章 关键环节技术实现 | 第43-49页 |
| 3.1 数据库构建 | 第44-45页 |
| 3.2 流程开发 | 第45-46页 |
| 3.2.1 算法集成 | 第45页 |
| 3.2.2 添加注释 | 第45页 |
| 3.2.3 算法优化 | 第45-46页 |
| 3.2.4 流程自动化 | 第46页 |
| 3.3 可视化实现 | 第46-49页 |
| 3.3.1 基因组数据可视化 | 第46页 |
| 3.3.2 分析操作可视化 | 第46-47页 |
| 3.3.3 分析结果可视化 | 第47-49页 |
| 第四章 结果与分析 | 第49-57页 |
| 4.1 实现数据处理并行化 | 第49页 |
| 4.2 实现平台可视化 | 第49-52页 |
| 4.3 平台验证 | 第52-54页 |
| 4.3.1 服务器准备 | 第52页 |
| 4.3.2 测试数据准备 | 第52-53页 |
| 4.3.3 平台测试 | 第53-54页 |
| 4.4 EST参考数据库构建 | 第54-55页 |
| 4.4.1 数据库BUSCO评价 | 第54页 |
| 4.4.2 数据库验证 | 第54-55页 |
| 4.5 平台封装 | 第55-57页 |
| 第五章 工作总结与展望 | 第57-59页 |
| 5.1 工作总结 | 第57页 |
| 5.2 工作展望 | 第57-59页 |
| 参考文献 | 第59-64页 |
| 作者在学期间取得的学术成果 | 第64-65页 |
| 主要简历 | 第65-66页 |
| 致谢 | 第66页 |