摘要 | 第10-13页 |
Abstract | 第13-15页 |
前言 | 第16-29页 |
1.1 结核分枝杆菌概述 | 第16-17页 |
1.2 sRNAs概述 | 第17-20页 |
1.3 立题依据 | 第20-28页 |
1.3.1 sRNAs在分枝杆菌中的研究 | 第20-26页 |
1.3.2 sRNAs在细菌铁离子摄取中的调控研究 | 第26-27页 |
1.3.3 结核分枝杆菌转录组在铁离子摄取中的研究 | 第27-28页 |
1.4 本研究的研究方向及意义 | 第28-29页 |
第一章 缺铁胁迫环境下结核分枝杆菌转录组分析 | 第29-46页 |
1.1 引言 | 第29页 |
1.2 材料与方法 | 第29-35页 |
1.2.1 实验材料 | 第29-30页 |
1.2.2 实验方法 | 第30-35页 |
1.3 实验结果 | 第35-43页 |
1.3.1 2,2-联吡啶螯合缺铁对结核分枝杆菌生长的影响 | 第35页 |
1.3.2 铁剥夺新模型的建立 | 第35-36页 |
1.3.3 cDNA文库建立 | 第36-38页 |
1.3.4 基因组比对 | 第38页 |
1.3.5 转录组表达定量 | 第38-39页 |
1.3.6 差异基因表达分析 | 第39-40页 |
1.3.7 差异基因GO富集分析 | 第40-42页 |
1.3.8 差异基因KEGG富集分析 | 第42页 |
1.3.9 实时定量荧光PCR | 第42-43页 |
1.4 讨论 | 第43-45页 |
1.5 小结 | 第45-46页 |
第二章 缺铁胁迫环境下结核分枝杆菌sRNA表达 | 第46-64页 |
2.1 引言 | 第46页 |
2.2 材料与方法 | 第46-53页 |
2.2.1 实验材料 | 第46-48页 |
2.2.2 实验方法 | 第48-53页 |
2.3 实验结果 | 第53-61页 |
2.3.1 sRNA预测结果 | 第53-54页 |
2.3.2 候选sRNA差异表达分析 | 第54-55页 |
2.3.3 候选sRNA靶基因的预测 | 第55-56页 |
2.3.4 候选sRNA靶基因的GO分析 | 第56-57页 |
2.3.5 候选sRNA靶基因的KEGG分析 | 第57-58页 |
2.3.6 Northern印迹 | 第58-59页 |
2.3.7 实时定量PCR | 第59-61页 |
2.4 讨论 | 第61-63页 |
2.5 小结 | 第63-64页 |
第三章 差异表达候选sRNA功能的初步探索 | 第64-88页 |
3.1 引言 | 第64页 |
3.2 材料与方法 | 第64-76页 |
3.2.1 实验材料 | 第64-66页 |
3.2.2 实验方法 | 第66-76页 |
3.3 实验结果 | 第76-85页 |
3.3.1 不同程度缺铁培养环境下候选sRNA的表达 | 第76-77页 |
3.3.2 不同临床株候选sRNA的表达比较 | 第77-79页 |
3.3.3 ASssr启动子验证实验 | 第79-80页 |
3.3.4 pMV261-ASssr穿梭质粒的构建 | 第80页 |
3.3.5 过表达菌株H37Rv-pMV261-ASssr转录组表达分析 | 第80-83页 |
3.3.6 pMV261-ASssr穿梭质粒的再构建 | 第83-84页 |
3.3.7 明确基因ASssr与Rv3098c的调控关系 | 第84页 |
3.3.8 过表达菌株H37Rv-pMV261-ASssr生长性状的分析 | 第84-85页 |
3.3.9 最小抑菌浓度实验 | 第85页 |
3.4 讨论 | 第85-86页 |
3.5 小结 | 第86-88页 |
第四章 结论与展望 | 第88-90页 |
4.1 结论 | 第88-89页 |
4.2 展望 | 第89-90页 |
参考文献 | 第90-97页 |
作者在学期间取得的学术成果 | 第97-98页 |
主要简历 | 第98-99页 |
致谢 | 第99页 |