| 作者简历 | 第6-8页 |
| 摘要 | 第8-12页 |
| abstract | 第12-16页 |
| 第一章 前言 | 第21-38页 |
| 1.1 砷的地球化学 | 第21-24页 |
| 1.1.1 砷的存在形式及来源 | 第21-22页 |
| 1.1.2 砷的分布及含量 | 第22-23页 |
| 1.1.3 砷的毒性 | 第23-24页 |
| 1.2 微生物催化的砷的生物地球化学过程 | 第24-29页 |
| 1.2.1 微生物对砷的摄取、沉淀及排出 | 第25页 |
| 1.2.2 微生物催化的砷氧化 | 第25-26页 |
| 1.2.3 微生物催化的抗性/呼吸性砷还原 | 第26-27页 |
| 1.2.4 微生物催化的砷甲基化和去甲基化 | 第27页 |
| 1.2.5 微生物催化的砷的生物地球化学循环 | 第27-29页 |
| 1.3 砷氧化微生物的分子特征 | 第29-32页 |
| 1.3.1 砷氧化微生物的多样性 | 第29-30页 |
| 1.3.2 砷氧化酶概况 | 第30-31页 |
| 1.3.3 砷氧化酶基因的表达调控机制 | 第31-32页 |
| 1.4 砷氧化微生物的环境意义 | 第32-33页 |
| 1.4.1 砷污染环境处理现状 | 第32-33页 |
| 1.4.2 砷氧化微生物的环境意义 | 第33页 |
| 1.5 极端环境砷污染研究概况 | 第33-35页 |
| 1.5.1 地下深部砷污染研究现状 | 第34页 |
| 1.5.2 酸性矿坑排水砷污染研究现状 | 第34页 |
| 1.5.3 热泉砷污染研究现状 | 第34-35页 |
| 1.6 研究目的与技术路线 | 第35-38页 |
| 1.6.1 研究目的及创新点 | 第35页 |
| 1.6.2 目前存在的问题 | 第35-36页 |
| 1.6.3 研究内容及技术路线 | 第36-38页 |
| 第二章 地下深部高砷沉积物砷氧化微生物多样性、活性特征及其对砷释放的影响 | 第38-76页 |
| 2.1 前言 | 第38-39页 |
| 2.2 材料与方法 | 第39-50页 |
| 2.2.1 样品的采集 | 第39-42页 |
| 2.2.2 样品地球化学的测定 | 第42页 |
| 2.2.3 砷浓度的测定 | 第42-43页 |
| 2.2.4 微生物群落结构的分析 | 第43-44页 |
| 2.2.5 微生物群落催化砷氧化的活性特征 | 第44-45页 |
| 2.2.6 微生物群落砷氧化酶的克隆及测序 | 第45-48页 |
| 2.2.7 有氧状态下微生物群落的砷释放 | 第48页 |
| 2.2.8 生物信息学分析 | 第48-49页 |
| 2.2.9 核苷酸序列编号 | 第49-50页 |
| 2.3 结果与分析 | 第50-73页 |
| 2.3.1 沉积物样品的地球化学分析 | 第50-52页 |
| 2.3.2 地下深部高砷沉积物微生物群落结构的多样性及组成 | 第52-59页 |
| 2.3.3 基于RDA分析的地下深部沉积物与环境因子的相关性 | 第59-60页 |
| 2.3.4 地下深部高砷沉积物微生物群落砷氧化能力 | 第60-64页 |
| 2.3.5 地下深部高砷沉积物微生物群落aioA基因文库的多样性与分类 | 第64-69页 |
| 2.3.6 地下深部高砷沉积物微生物群落有氧状态下的砷释放 | 第69-73页 |
| 2.4 本章小结 | 第73-76页 |
| 第三章 酸性矿坑排水高砷沉积物中砷氧化微生物多样性、活性特征及其对砷释放的影响 | 第76-94页 |
| 3.1 前言 | 第76页 |
| 3.2 材料与方法 | 第76-79页 |
| 3.2.1 样品的采集 | 第76-77页 |
| 3.2.2 样品地球化学的测定 | 第77页 |
| 3.2.3 微生物群落结构的分析 | 第77-78页 |
| 3.2.4 微生物群落催化砷氧化的活性特征 | 第78页 |
| 3.2.5 微生物群落砷氧化酶的克隆及测序 | 第78-79页 |
| 3.2.6 有氧状态下微生物群落的砷释放 | 第79页 |
| 3.2.7 生物信息学分析 | 第79页 |
| 3.3 结果与分析 | 第79-91页 |
| 3.3.1 沉积物样品的地球化学分析 | 第79-80页 |
| 3.3.2 酸性矿坑排水高砷沉积物微生物群落结构的多样性 | 第80-84页 |
| 3.3.3 酸性矿坑排水高砷沉积物微生物群落砷氧化能力 | 第84-86页 |
| 3.3.4 酸性矿坑排水高砷沉积物微生物群落aioA基因文库的多样性与分类 | 第86-89页 |
| 3.3.5 酸性矿坑排水高砷沉积物微生物群落有氧状态下的砷释放 | 第89-91页 |
| 3.4 本章小节 | 第91-94页 |
| 第四章 热泉高砷沉积物砷氧化微生物多样性、活性特征及其对砷释放的影响.. | 第94-112页 |
| 4.1 前言 | 第94-95页 |
| 4.2 材料与方法 | 第95-100页 |
| 4.2.1 样品的采集 | 第95-96页 |
| 4.2.2 样品地球化学的测定 | 第96页 |
| 4.2.3 微生物群落砷氧化功能研究 | 第96页 |
| 4.2.4 微生物群落结构的分析 | 第96-97页 |
| 4.2.5 可培养砷氧化微生物的富集、分离及纯化 | 第97-98页 |
| 4.2.6 单株砷氧化活力的检测 | 第98页 |
| 4.2.7 微生物群落及可培养砷氧化单株砷氧化酶基因的克隆 | 第98-99页 |
| 4.2.8 有氧状态下微生物群落的砷释放 | 第99页 |
| 4.2.9 系统发育进化分析 | 第99页 |
| 4.2.10 核苷酸序列编号 | 第99-100页 |
| 4.3 结果与分析 | 第100-110页 |
| 4.3.1 沉积物样品的地球化学分析 | 第100页 |
| 4.3.2 热泉高砷沉积物微生物群落砷氧化能力 | 第100-101页 |
| 4.3.3 热泉高砷沉积物微生物群落结构的多样性及组成 | 第101-104页 |
| 4.3.4 热泉高砷沉积物微生物群落aioA基因文库的多样性与分类 | 第104-106页 |
| 4.3.5 热泉可培养砷氧化微生物的功能 | 第106-108页 |
| 4.3.6 热泉可培养砷氧化微生物aioA基因的独特性 | 第108页 |
| 4.3.7 热泉高砷沉积物微生物群落有氧状态下的砷释放 | 第108-110页 |
| 4.4 本章小结 | 第110-112页 |
| 第五章 新的可培养砷氧化微生物的筛选和功能研究 | 第112-128页 |
| 5.1 前言 | 第112-113页 |
| 5.2 材料与方法 | 第113-115页 |
| 5.2.1 砷抗性微生物的富集、分离及纯化 | 第113页 |
| 5.2.3 可培养砷氧化菌株的筛选 | 第113页 |
| 5.2.4 可培养砷氧化微生物生长曲线的绘制 | 第113页 |
| 5.2.5 可培养砷氧化微生物16SrRNA/aioA基因的扩增、克隆与测序 | 第113-114页 |
| 5.2.6 基于16SrRNA基因的系统发育分析 | 第114页 |
| 5.2.7 可培养砷氧化微生物aioA基因的多序列比对及水平转移 | 第114-115页 |
| 5.2.8 可培养砷氧化微生物与含砷矿物的相互作用 | 第115页 |
| 5.3 结果与分析 | 第115-126页 |
| 5.3.1 可培养砷氧化菌株的筛选 | 第115-116页 |
| 5.3.2 可培养砷氧化菌株的分类学研究 | 第116-118页 |
| 5.3.3 可培养砷氧化菌株的功能学研究 | 第118-121页 |
| 5.3.4 地下深部高砷沉积物可培养砷氧化微生物aioA基因的水平转移 | 第121-124页 |
| 5.3.5 地下深部可培养砷氧化微生物与含砷矿物的相互作用 | 第124-126页 |
| 5.4 本章小结 | 第126-128页 |
| 第六章 极端环境砷氧化微生物多样性、活性特征及其对砷释放影响的比较 | 第128-137页 |
| 6.1 前言 | 第128页 |
| 6.2 分析与讨论 | 第128-137页 |
| 6.2.1 极端环境高砷沉积地球化学的比较 | 第128-130页 |
| 6.2.2 极端环境高砷沉积物微生物群落结构的比较 | 第130-131页 |
| 6.2.3 极端环境高砷沉积物微生物群落砷氧化能力的比较 | 第131-132页 |
| 6.2.4 极端环境高砷沉积物微生物群落aioA基因的比较 | 第132-134页 |
| 6.2.5 极端环境高砷沉积物微生物群落有氧状态下砷释放比较 | 第134-137页 |
| 第七章 总结与展望 | 第137-141页 |
| 致谢 | 第141-143页 |
| 参考文献 | 第143-165页 |
| 附录 | 第165-169页 |
