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拟南芥叶片生命周期中circRNAs的鉴定及其特征探索

内容摘要第5-6页
ABSTRACT第6页
1 引言第11-28页
    1.1 叶片衰老第11-14页
    1.2 CircRNAs第14-23页
        1.2.1 来源于外显子的circRNAs第16页
        1.2.2 特性第16-18页
        1.2.3 功能第18-20页
        1.2.4 健康和疾病中的circRNAs的作用第20-23页
    1.3 植物circRNAs第23-26页
        1.3.1 植物circRNAs序列组成和结构第23-24页
        1.3.2 CircRNAs在发育过程中的角色第24页
        1.3.3 CircRNAs在植物中作为miRNA海绵第24-25页
        1.3.4 CircRNAs在生物和非生物胁迫下的角色第25页
        1.3.5 CircRNAs参与调节其亲本基因第25页
        1.3.6 植物circRNAs的蛋白质编码潜力第25-26页
    1.4 本文研究内容第26-28页
2 材料和方法第28-38页
    2.1 数据来源第28页
    2.2 CircRNAs的鉴定第28-31页
    2.3 CircRNAs序列的提取第31-32页
    2.4 鉴定差异表达的circRNAs第32页
    2.5 MiRNA靶标的预测第32-35页
    2.6 CircRNA-miRNA-mRNA网络的构建第35页
    2.7 功能注释第35页
    2.8 CircRNAs的验证第35-38页
3 结果与讨论第38-51页
    3.1 概述拟南芥叶中的circRNAs第38-41页
    3.2 鉴定差异表达的circRNAs第41-42页
    3.3 CircRNAs的验证第42-43页
    3.4 上调的circRNAs在衰老过程中的表达在一定程度上与宿主基因表达无关第43-44页
    3.5 CircRNA-miRNA-mRNA网络的构建第44-46页
    3.6 功能注释第46-49页
    3.7 对circRNAs的具体探索分析第49-51页
4 总结与展望第51-53页
    4.1 总结第51-52页
    4.2 展望第52-53页
参考文献第53-57页
附录第57-76页
    附录1:拟南芥一生中的circRNAs列表第57-66页
    附录2:CircRNAs的表达谱第66-67页
    附录3:差异表达的circRNAs列表第67-69页
    附录4:实时定量荧光PCR引物列表第69-70页
    附录5:配对的circRNAs-miRNA-mRNA列表第70-76页
在学期间所取得科研成果第76-77页
致谢第77页

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