统计聚类在生物信息分析中的应用
| 摘要 | 第3-4页 |
| Abstract | 第4页 |
| 第一章 引言 | 第7-10页 |
| 1.1 生物信息分析概述 | 第7页 |
| 1.2 聚类在生物信息分析中的应用 | 第7-8页 |
| 1.3 本文主要工作 | 第8-10页 |
| 第二章 生物数据及统计学描述 | 第10-13页 |
| 2.1 生物数据特征 | 第10-11页 |
| 2.2 相关性描述 | 第11-13页 |
| 2.2.1 Pearson相关系数 | 第11页 |
| 2.2.2 Spearmann相关性系数 | 第11-12页 |
| 2.2.3 Kendall-tau相关系数 | 第12-13页 |
| 第三章 聚类分析 | 第13-16页 |
| 3.1 聚类概述 | 第13页 |
| 3.2 聚类方法 | 第13-16页 |
| 3.2.1 层次聚类 | 第13-14页 |
| 3.2.2 K-means聚类 | 第14页 |
| 3.2.3 SOM聚类 | 第14-16页 |
| 第四章 实例分析 | 第16-30页 |
| 4.1 数据介绍 | 第16-17页 |
| 4.2 Pearson相关性分析 | 第17-20页 |
| 4.2.1 所有样本相关性分析 | 第17-18页 |
| 4.2.2 样本两两之间相关性分析 | 第18-20页 |
| 4.3 差异基因显著性检验 | 第20-23页 |
| 4.3.1 显著性检验 | 第20-21页 |
| 4.3.2 差异基因维恩图 | 第21-23页 |
| 4.4 聚类分析 | 第23-30页 |
| 4.4.1 层次聚类分析 | 第23-26页 |
| 4.4.2 K-means聚类分析 | 第26-27页 |
| 4.4.3 SOM聚类分析 | 第27-30页 |
| 结论展望 | 第30-31页 |
| 参考文献 | 第31-33页 |
| 附录 | 第33-48页 |
| 附录A R程序代码 | 第33-38页 |
| 附录B 相关性散点图 | 第38-45页 |
| 附录C 数据列表 | 第45-48页 |
| 致谢 | 第48页 |
