| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第1章 前言 | 第12-22页 |
| 1.1 解淀粉芽孢杆菌研究进展 | 第12-15页 |
| 1.1.1 解淀粉芽孢杆菌生防机制研究 | 第12-13页 |
| 1.1.2 解淀粉芽孢杆菌对根际细菌群落的影响 | 第13-15页 |
| 1.2 番茄枯萎病研究进展 | 第15-16页 |
| 1.3 土壤微生物的分子生物学研究方法 | 第16-20页 |
| 1.3.1 末端限制性片段长度多态性分析 | 第16-17页 |
| 1.3.2 高通量测序技术分析 | 第17-20页 |
| 1.4 研究目的与意义 | 第20页 |
| 1.5 研究内容与技术路线 | 第20-22页 |
| 1.5.1 研究内容 | 第20-21页 |
| 1.5.2 技术路线 | 第21-22页 |
| 第2章 生防菌SN16-1菌种鉴定和生物活性测定 | 第22-32页 |
| 2.1 材料和方法 | 第22-25页 |
| 2.1.1 生防菌SN16-1菌种鉴定 | 第22-23页 |
| 2.1.2 菌株及其生长条件 | 第23页 |
| 2.1.3 生防菌和病原菌的拮抗试验 | 第23-24页 |
| 2.1.4 高效液相色谱法确定生防菌SN16-1产生的抗生素种类 | 第24页 |
| 2.1.5 PCR扩增验证SN16-1产生抗生素相关基因 | 第24-25页 |
| 2.2 结果与分析 | 第25-30页 |
| 2.2.1 生防菌SN16-1的菌种鉴定 | 第25-27页 |
| 2.2.2 生防菌SN16-1的拮抗活性 | 第27-28页 |
| 2.2.3 HPLC检测SN16-1产生抗生素种类 | 第28-29页 |
| 2.2.4 SN16-1抗生素合成基因的鉴定 | 第29-30页 |
| 2.3 讨论 | 第30-32页 |
| 第3章 可控条件生防菌和病原菌施入对番茄植株生长和病害发生的影响 | 第32-40页 |
| 3.1 材料和方法 | 第32-33页 |
| 3.1.1 盆栽试验 | 第32页 |
| 3.1.2 土壤可培养细菌的计数 | 第32-33页 |
| 3.1.3 生防菌SN16-1和SN15-2的定量 | 第33页 |
| 3.1.4 番茄植株生物量测定 | 第33页 |
| 3.1.5 番茄植株病情指数统计 | 第33页 |
| 3.1.6 数据统计 | 第33页 |
| 3.2 结果与分析 | 第33-38页 |
| 3.2.1 生防菌和病原菌施入对土壤可培养细菌数的影响 | 第33-34页 |
| 3.2.2 生防菌SN16-1和SN15-2在根际土中的动态变化 | 第34页 |
| 3.2.3 生防菌和病原菌施入对番茄植株生长的影响 | 第34-36页 |
| 3.2.4 番茄植株病情指数统计 | 第36-38页 |
| 3.3 讨论 | 第38-40页 |
| 第4章 T-RFLP分析生防菌和病原菌对番茄根际细菌群落结构和多样性的影响 | 第40-52页 |
| 4.1 材料与方法 | 第40-43页 |
| 4.1.1 试剂与仪器 | 第40页 |
| 4.1.2 番茄根际土的采集 | 第40页 |
| 4.1.3 土壤总DNA的提取 | 第40-41页 |
| 4.1.4 DNA的纯度检测 | 第41页 |
| 4.1.5 细菌16S rRNA PCR扩增 | 第41-42页 |
| 4.1.6 PCR产物胶纯化回收 | 第42页 |
| 4.1.7 产物酶切 | 第42页 |
| 4.1.8 STR检测 | 第42页 |
| 4.1.9 数据处理与分析 | 第42-43页 |
| 4.2 结果与分析 | 第43-49页 |
| 4.2.1 土壤总DNA的提取 | 第43页 |
| 4.2.2 土壤DNA PCR扩增和胶纯化回收 | 第43页 |
| 4.2.3 STR测序酶切图谱 | 第43-44页 |
| 4.2.4 生防菌和病原菌的施入对番茄根际细菌群落多样性的影响 | 第44-46页 |
| 4.2.5 生防菌和病原菌的施入对根际细菌群落结构的影响 | 第46-47页 |
| 4.2.6 番茄根际细菌种群组成差异分析 | 第47-49页 |
| 4.3 讨论 | 第49-52页 |
| 第5章 细菌16S rRNA V4区测序分析番茄根际细菌群落结构和功能 | 第52-71页 |
| 5.1 材料与方法 | 第52-54页 |
| 5.1.1 试剂与仪器 | 第52页 |
| 5.1.2 土壤取样,宏基因组提取和检测 | 第52-53页 |
| 5.1.3 16S rRNA V4区PCR扩增 | 第53页 |
| 5.1.4 文库构建与Illumina MiSeq测序 | 第53页 |
| 5.1.5 数据分析 | 第53-54页 |
| 5.2 结果与分析 | 第54-69页 |
| 5.2.1 原始数据处理和OTUs划分 | 第54-55页 |
| 5.2.2 番茄根际细菌群落多样性分析 | 第55-57页 |
| 5.2.3 番茄根际细菌群落分类组成及其差异性分析 | 第57-63页 |
| 5.2.4 番茄根际细菌群落结构分析 | 第63-69页 |
| 5.3 讨论 | 第69-71页 |
| 第6章 结论与展望 | 第71-73页 |
| 6.1 主要结论 | 第71-72页 |
| 6.2 展望 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-83页 |
| 致谢 | 第83-84页 |
| 所发表论文 | 第84页 |
