灰藤黄链霉菌中吩嗪类物质生物合成基因簇的研究
摘要 | 第4-5页 |
ABSTRACT | 第5-6页 |
第一章 文献综述 | 第9-25页 |
1.1 链霉菌简介 | 第9-11页 |
1.2 灰藤黄链霉菌次生代谢产物 | 第11-13页 |
1.2.1 灰藤黄链霉菌简介 | 第11-12页 |
1.2.2 灰藤黄菌素 | 第12-13页 |
1.3 吩嗪类化合物生物合成途径 | 第13-21页 |
1.3.1 吩嗪化合物简介 | 第13-14页 |
1.3.2 假单胞菌中吩嗪合成途径 | 第14-15页 |
1.3.3 链霉菌中吩嗪合成途径研究现状 | 第15-17页 |
1.3.4 灰藤黄菌素生物合成途径研究现状 | 第17-21页 |
1.4 基因组文库构建及测序方法 | 第21-23页 |
1.4.1 基因组文库 | 第21-22页 |
1.4.2 Fosmid 测序 | 第22-23页 |
1.5 本研究目的、意义和内容 | 第23-25页 |
1.5.1 本研究目的和意义 | 第23-24页 |
1.5.2 本研究主要内容 | 第24-25页 |
第二章 材料与方法 | 第25-35页 |
2.1 菌株与质粒 | 第25-26页 |
2.2 实验材料 | 第26-28页 |
2.2.1 培养基 | 第26页 |
2.2.2 实验试剂 | 第26-27页 |
2.2.3 抗生素及诱导剂 | 第27-28页 |
2.3 实验方法 | 第28-35页 |
2.3.1 链霉菌培养及菌种保藏 | 第28页 |
2.3.2 大肠杆菌质粒DNA 的提取 | 第28页 |
2.3.3 链霉菌总DNA 的少量快速提取 | 第28-29页 |
2.3.4 DNA 沉淀 | 第29页 |
2.3.5 DNA 的琼脂糖凝胶电泳 | 第29页 |
2.3.6 DNA 片段胶回收 | 第29页 |
2.3.7 链霉菌文库构建 | 第29-32页 |
2.3.8 PCR 方法进行文库筛选 | 第32-33页 |
2.3.9 DNA 酶切,连接 | 第33页 |
2.3.10 感受态细胞的制备及DNA 转化 | 第33页 |
2.3.11 DNA 序列测定与分析 | 第33-35页 |
第三章 灰藤黄菌基因组文库构建 | 第35-47页 |
3.1 前言 | 第35页 |
3.2 结果与分析 | 第35-44页 |
3.2.1 提取灰藤黄菌基因组DNA | 第35-36页 |
3.2.2 随机剪切基因组DNA | 第36-37页 |
3.2.3 末端补平、低熔点胶回收、连接 | 第37-38页 |
3.2.4 噬菌体蛋白包装 | 第38-39页 |
3.2.5 文库筛选 | 第39-44页 |
3.3 小结与讨论 | 第44-47页 |
3.3.1 小结 | 第44-45页 |
3.3.2 讨论 | 第45-47页 |
第四章 灰藤黄菌素生物合成基因簇分析 | 第47-61页 |
4.1 前言 | 第47页 |
4.2 结果与分析 | 第47-57页 |
4.2.1 酶谱分析 | 第47-49页 |
4.2.2 Fosmid 测序 | 第49-51页 |
4.2.3 序列分析 | 第51-57页 |
4.3 小结与讨论 | 第57-61页 |
4.3.1 小结 | 第57-58页 |
4.3.2 讨论 | 第58-61页 |
第五章 总结和展望 | 第61-63页 |
5.1 总结 | 第61-62页 |
5.2 展望 | 第62-63页 |
参考文献 | 第63-67页 |
致谢 | 第67-68页 |
攻读学位期间发表的学术论文 | 第68-70页 |