摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
第1章 绪论 | 第8-15页 |
1.1 研究背景 | 第8-9页 |
1.2 研究的目的及意义 | 第9-10页 |
1.3 国内外研究现状 | 第10-13页 |
1.3.1 ENCODE 计划 | 第10-11页 |
1.3.2 DNA 语言与人类语言的关系 | 第11页 |
1.3.3 序列挖掘方法 | 第11-13页 |
1.4 论文主要内容 | 第13-15页 |
第2章 DNA 序列切分技术研究 | 第15-24页 |
2.1 切分思想 | 第15-16页 |
2.2 序列切分技术简介 | 第16-17页 |
2.2.1 基于词典的序列切分 | 第16页 |
2.2.2 基于统计的序列切分 | 第16-17页 |
2.3 条件随机场模型 | 第17-21页 |
2.3.1 条件随机场的定义 | 第17-18页 |
2.3.2 条件随机场相关公式 | 第18-20页 |
2.3.3 条件随机场的切分优势 | 第20-21页 |
2.4 基于条件随机场模型序列切分系统设计 | 第21-23页 |
2.5 本章小结 | 第23-24页 |
第3章 基于条件随机场模型的英文序列切分 | 第24-38页 |
3.1 特征分析 | 第24-29页 |
3.1.1 词典特征 | 第25页 |
3.1.2 基于信息量的特征 | 第25-29页 |
3.2 英文序列特征选取 | 第29-36页 |
3.2.1 预处理 | 第29-30页 |
3.2.2 特征选取 | 第30-35页 |
3.2.3 特征模板 | 第35-36页 |
3.3 结果评测标准 | 第36-37页 |
3.4 实验结果分析 | 第37页 |
3.5 本章小结 | 第37-38页 |
第4章 基于迁移学习 DNA 序列切分 | 第38-49页 |
4.1 迁移学习理论简介 | 第38-41页 |
4.2 基于特征迁移的 DNA 序列切分 | 第41-45页 |
4.2.1 特征迁移的思想 | 第41-42页 |
4.2.2 特征转换函数的构建 | 第42-45页 |
4.3 已有功能位点构建模型的 DNA 序列切分 | 第45-47页 |
4.4 DNA 序列切分结果比较 | 第47-48页 |
4.5 本章小结 | 第48-49页 |
第5章 基因组词序列应用 | 第49-55页 |
5.1 实验流程 | 第49页 |
5.2 相关概念介绍 | 第49-50页 |
5.3 向量空间模型和改进序列比对方法的相似度计算 | 第50-53页 |
5.3.1 基于向量空间模型的序列相似度计算 | 第50-51页 |
5.3.2 改进的序列比对方法相似度计算 | 第51-52页 |
5.3.3 实验结果分析 | 第52-53页 |
5.4 物种相似度应用 | 第53-54页 |
5.5 本章小结 | 第54-55页 |
结论 | 第55-56页 |
参考文献 | 第56-60页 |
攻读硕士学位期间发表的论文及其它成果 | 第60-62页 |
致谢 | 第62页 |