| 摘要 | 第5-8页 |
| ABSTRACT | 第8-10页 |
| 第一章 绪论 | 第13-33页 |
| 1.1 乳腺癌及肿瘤微环境概述 | 第13-17页 |
| 1.2 生物信息学数据库及研究方法 | 第17-31页 |
| 1.2.1 基因芯片简介 | 第17-19页 |
| 1.2.2 生物信息学数据库简介 | 第19-26页 |
| 1.2.3 生物信息学研究工具 | 第26-29页 |
| 1.2.4 基因表达谱数据分析方法 | 第29-30页 |
| 1.2.5 生物信息学在肿瘤临床医学发展中的意义 | 第30-31页 |
| 1.3 本文的研究目的和意义 | 第31-32页 |
| 1.4 本文的章节安排 | 第32-33页 |
| 第二章 良性与恶性乳腺肿瘤外周血细胞基因差异表达研究 | 第33-47页 |
| 2.1 引言 | 第33页 |
| 2.2 材料与方法 | 第33-37页 |
| 2.2.1 基因表达谱数据 | 第33-35页 |
| 2.2.2 差异表达基因筛选 | 第35-36页 |
| 2.2.3 差异表达基因功能注释和通路分析 | 第36页 |
| 2.2.4 差异表达基因蛋白相互作用网络分析 | 第36-37页 |
| 2.3 结果 | 第37-42页 |
| 2.3.1 差异表达基因 | 第37-38页 |
| 2.3.2 差异表达基因的生物学功能及参与的信号通路 | 第38-40页 |
| 2.3.3 乳腺癌外周血PBMCs差异表达基因蛋白质相互作用网络 | 第40-42页 |
| 2.4 讨论 | 第42-45页 |
| 2.5 本章小结 | 第45-47页 |
| 第三章 乳腺癌患者外周血与肿瘤间质免疫微环境关系研究 | 第47-56页 |
| 3.1 引言 | 第47-48页 |
| 3.2 材料与方法 | 第48-50页 |
| 3.2.1 基因表达谱数据 | 第48-49页 |
| 3.2.2 数据预处理 | 第49页 |
| 3.2.3 差异表达基因筛选 | 第49页 |
| 3.2.4 差异表达基因的生物学功能分析 | 第49页 |
| 3.2.5 差异表达细胞因子（趋化因子）及其互作蛋白筛选 | 第49-50页 |
| 3.3 结果 | 第50-52页 |
| 3.3.1 差异表达基因 | 第50页 |
| 3.3.2 差异表达基因的功能注释 | 第50页 |
| 3.3.3 差异表达基因中的细胞因子（趋化因子） | 第50-52页 |
| 3.4 讨论 | 第52-55页 |
| 3.5 本章小结 | 第55-56页 |
| 第四章 乳腺癌组织与外周血的交互作用研究 | 第56-67页 |
| 4.1 引言 | 第56-57页 |
| 4.2 材料与方法 | 第57-58页 |
| 4.2.1 基因表达谱数据 | 第57-58页 |
| 4.2.2 数据预处理及筛选差异表达基因 | 第58页 |
| 4.2.3 PBMCs与乳腺癌交互作用分子筛选 | 第58页 |
| 4.2.4 交互作用分子的基因功能分析 | 第58页 |
| 4.3 结果 | 第58-64页 |
| 4.3.1 差异表达基因 | 第58-59页 |
| 4.3.2 交互作用分子组成 | 第59-64页 |
| 4.4 讨论 | 第64-65页 |
| 4.5 本章小结 | 第65-67页 |
| 第五章 全文总结与展望 | 第67-69页 |
| 5.1 总结 | 第67页 |
| 5.2 展望 | 第67-69页 |
| 附录 | 第69-87页 |
| 致谢 | 第87-88页 |
| 参考文献 | 第88-98页 |
| 攻读博士学位期间研究成果 | 第98-99页 |
| 攻读博士学位期间参加的课题工作 | 第99-100页 |
