摘要 | 第4-5页 |
Abstract | 第5页 |
第一章 文献综述 | 第9-25页 |
1.1 玉米籽粒发育研究进展 | 第9-17页 |
1.1.1 玉米胚发育的分子调控机理研究 | 第9-11页 |
1.1.2 玉米胚乳发育的分子调控机理研究 | 第11-17页 |
1.2 种子发育的表观遗传调控机理研究 | 第17-24页 |
1.2.1 DNA甲基化参与植物种子发育基因的表达调控 | 第17-20页 |
1.2.2 组蛋白修饰参与调控种子发育的分子调控机理 | 第20-24页 |
1.3 立论依据、研究目标及研究内容 | 第24-25页 |
第二章 实验材料和方法 | 第25-49页 |
2.1 实验材料 | 第25-26页 |
2.1.1 植物材料和种植 | 第25页 |
2.1.2 菌株及载体 | 第25页 |
2.1.3 常用分子生物学和生物化学试剂及耗材 | 第25-26页 |
2.1.4 抗体 | 第26页 |
2.1.5 培养基 | 第26页 |
2.1.6 引物 | 第26页 |
2.2 实验方法 | 第26-49页 |
2.2.1 序列扩增 | 第27-29页 |
2.2.2 质粒构建 | 第29-30页 |
2.2.3 拟南芥转化 | 第30-31页 |
2.2.4 蛋白质原核表达及纯化 | 第31-34页 |
2.2.5 籽粒表型和细胞学形态观察 | 第34-35页 |
2.2.6 玉米籽粒总蛋白和核蛋白提取 | 第35-36页 |
2.2.7 玉米和拟南芥基因组DNA提取 | 第36页 |
2.2.8 玉米籽粒总RNA提取和cDNA合成 | 第36-38页 |
2.2.9 qPCR分析 | 第38-39页 |
2.2.10 ZmHDA101单克隆抗体制备 | 第39页 |
2.2.11 免疫印迹实验(Western-blot) | 第39-40页 |
2.2.12 免疫共沉淀实验(Co-IP) | 第40-42页 |
2.2.13 染色体免疫共沉淀实验(ChIP) | 第42-46页 |
2.2.14 酵母双杂实验 | 第46-47页 |
2.2.15 ChIP-seq | 第47页 |
2.2.16 RNA-seq | 第47-49页 |
第三章 结果与分析 | 第49-68页 |
3.1 ZmHDA101单克隆抗体制备 | 第49-50页 |
3.1.1 ZmHDA101单克隆抗体制备 | 第49页 |
3.1.2 ZmHDA101单克隆抗体特异性检测 | 第49-50页 |
3.2 ZmHDA101超表达株系的分子鉴定 | 第50-52页 |
3.2.1 ZmHDA101超表达株系籽粒中ZmHDA101蛋白水平检测 | 第50-51页 |
3.2.2 ZmHDA101超表达株系籽粒中ZmHDA101基因转录水平检测 | 第51-52页 |
3.3 hda101突变体籽粒发育形态变异 | 第52-55页 |
3.3.1 突变体籽粒表型和细胞学形态观察 | 第52-53页 |
3.3.2 突变体胚乳发育相关基因的表达分析 | 第53-55页 |
3.4 ZmHDA101调控靶位点的鉴定 | 第55-59页 |
3.4.1 ZmHDA101在全基因组水平的分布 | 第55-57页 |
3.4.2 ZmHDA101在不同转录水平的靶基因上的富集分析 | 第57-59页 |
3.5 ZmHDA101参与调控靶基因组蛋白乙酰化分析 | 第59-62页 |
3.5.1 hda101-1和B73籽粒组蛋白乙酰化检测 | 第59-60页 |
3.5.2 ZmHDA101靶基因组蛋白H4K5乙酰化水平变化 | 第60-62页 |
3.6 ZmHDA101对靶基因转录水平的调控分析 | 第62-65页 |
3.6.1 hda101突变体和B73籽粒的转录组分析 | 第62-63页 |
3.6.2 H4K5ac和转录水平都上调的ZmHDA101靶基因的表达模式分析 | 第63-64页 |
3.6.3 基因表达和ZmHDA101富集之间的关系 | 第64-65页 |
3.7 ZmHDA101互作蛋白的鉴定 | 第65-68页 |
3.7.1 ZmHDA101互作蛋白的免疫共沉淀和质谱分析 | 第65-66页 |
3.7.2 Zm HDA101和ZmSNL1、ZmNFC103的酵母双杂互作验证 | 第66-68页 |
第四章 讨论 | 第68-71页 |
4.1 ZmHDA101调控玉米籽粒胚乳传递细胞发育并影响籽粒大小 | 第68-69页 |
4.2 ZmHDA101通过不同的机制调控转录活跃和不活跃基因 | 第69-70页 |
4.3 ZmHDA101与组蛋白乙酰化的关系 | 第70-71页 |
参考文献 | 第71-81页 |
致谢 | 第81-83页 |
附录 | 第83-145页 |
作者简历 | 第145页 |