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小分子苦瓜多糖基于RNA-seq转录组学的降糖机制探究

中文摘要第12-13页
英文摘要第13-14页
第一章 绪论第15-26页
    1.1 糖尿病简介第15-18页
        1.1.1 糖尿病类型第15-16页
        1.1.2 糖尿病最新数据第16-18页
    1.2 多糖降血糖的研究进展第18-19页
        1.2.1 植物多糖降血糖的应用第18页
        1.2.2 苦瓜多糖降血糖的研究第18-19页
    1.3 细胞模型的应用第19-20页
        1.3.1 细胞模型在科研中的应用第19页
        1.3.2 胰岛素抵抗细胞模型第19-20页
        1.3.3 3T3-L1脂肪细胞与糖尿病研究第20页
    1.4 高通量测序与精准医疗第20-24页
        1.4.1 精准医疗计划第20页
        1.4.2 RNA-seq的简介第20-22页
        1.4.3 RNA-seq的应用第22页
        1.4.4 RNA-seq与糖尿病研究第22-24页
    1.5 本课题的研究意义及主要内容第24-26页
        1.5.1 研究意义第24页
        1.5.2 研究内容第24-25页
        1.5.3 技术路线第25-26页
第二章 苦瓜多糖的分离制备第26-32页
    2.1 材料与试剂第26页
    2.2 仪器和设备第26页
    2.3 试验方法第26-29页
        2.3.1 苦瓜粗多糖(MCP)的制备第26-27页
        2.3.2 苦瓜粗多糖除蛋白第27页
        2.3.3 G-250法检测粗多糖中蛋白质的含量第27页
        2.3.4 苯酚-硫酸法检测多糖的含量第27-28页
        2.3.5 苦瓜多糖的纯化第28-29页
        2.3.6 苦瓜多糖成分的分析第29页
    2.4 结果与分析第29-30页
        2.4.1 苦瓜多糖的纯化第29-30页
        2.4.2 MCPIIa的单糖组成第30页
    2.5 讨论第30-31页
    2.6 小结第31-32页
第三章 苦瓜多糖降血糖活性组分的筛选第32-43页
    3.1 材料与试剂第32页
    3.2 仪器和设备第32页
    3.3 试验方法第32-38页
        3.3.1 苦瓜多糖组分的制备第32页
        3.3.2 细胞试验溶液的配制第32-34页
        3.3.3 3T3-L1前脂肪细胞的复苏,传代和冻存第34-35页
        3.3.4 脂肪细胞的诱导分化第35-36页
        3.3.5 脂肪细胞胰岛素抵抗(IR)模型的建立第36-37页
        3.3.6 胰岛素抵抗(IR)细胞模型的维持第37页
        3.3.7 苦瓜多糖对胰岛素抵抗(IR)细胞模型活力的影响第37页
        3.3.8 苦瓜多糖降糖活性组分的筛选第37-38页
    3.4 结果与分析第38-41页
        3.4.1 油红O染色结果分析第38-39页
        3.4.2 胰岛素抵抗(IR)模型的建立第39页
        3.4.3 胰岛素抵抗(IR)模型的维持情况第39页
        3.4.4 MTT检测结果分析第39-40页
        3.4.5 降糖活性组分的筛选结果第40-41页
    3.5 讨论第41-42页
    3.6 小结第42-43页
第四章 MCPⅡa在Ⅱ型糖尿病大鼠体内的降血糖试验第43-54页
    4.1 材料与试剂第43页
    4.2 仪器和设备第43页
    4.3 试验方法第43-47页
        4.3.1 MCPⅡa的分离与制备第43页
        4.3.2 MCPⅡa调控Ⅱ型糖尿病大鼠血糖的试验第43-44页
        4.3.3 大鼠糖耐量变化的测定第44页
        4.3.4 大鼠体重变化的测定第44页
        4.3.5 大鼠肝脏中总蛋白质浓度的测定第44页
        4.3.6 大鼠肝脏中总超氧化物歧化酶(T-SOD)的测定第44-45页
        4.3.7 大鼠肝脏中谷胱甘肽过氧化物酶(GSH-PX)活性的测定第45-46页
        4.3.8 大鼠肝脏中丙二醛(MDA)的测定第46-47页
        4.3.9 大鼠肝脏中甘油三脂的测定第47页
    4.4 结果与分析第47-52页
        4.4.1 MCPⅡa调控T2DM大鼠血糖的分析第47-48页
        4.4.2 MCPⅡa对T2DM大鼠糖耐量的影响第48页
        4.4.3 MCPⅡa调控T2DM大鼠体重的分析第48-49页
        4.4.4 大鼠肝脏总蛋白含量分析第49页
        4.4.5 大鼠肝脏T-SOD活力分析第49-50页
        4.4.6 大鼠肝脏GSH-PX活力分析第50-51页
        4.4.7 大鼠肝脏MDA含量变化第51页
        4.4.8 大鼠肝脏中甘油三酯的测定第51-52页
    4.5 讨论第52-53页
    4.6 小结第53-54页
第五章 基于RNA-seq转录组学的T2DM大鼠及多糖处理组研究第54-67页
    5.1 材料与试剂第54页
    5.2 仪器和设备第54页
    5.3 试验方法第54-56页
        5.3.1 Total RNA样品的制备与检测第54页
        5.3.2 RNA文库的构建第54-55页
        5.3.3 上机测序第55页
        5.3.4 测序质量评估第55-56页
    5.4 结果与分析第56-65页
        5.4.1 Total RNA质量检测第56-58页
        5.4.2 测序错误率分布检查第58页
        5.4.3 A/T/G/C含量分布检查第58-59页
        5.4.4 测序数据过滤第59-60页
        5.4.5 测序数据质量情况第60-61页
        5.4.6 Reds与参考基因比对结果第61-62页
        5.4.7 Reds在染色体上的密度分布情况第62-63页
        5.4.8 基因表达水平分析第63-64页
        5.4.9 RNA-seq相关性检查第64页
        5.4.10 基因表达水平比对第64-65页
    5.5 讨论第65-66页
    5.6 小结第66-67页
第六章 转录组基因表达注释和差异基因分析第67-78页
    6.1 分析方法第67-68页
        6.1.1 样品基因表达差异分析第67页
        6.1.2 差异表达基因的筛选第67页
        6.1.3 差异基因聚类分析第67页
        6.1.4 差异基因GO富集分析第67-68页
        6.1.5 差异基因KEGG富集分析第68页
    6.2 结果与分析第68-74页
        6.2.1 韦恩图-veen Diagram第68页
        6.2.2 火山图-Hot map第68-69页
        6.2.3 差异基因聚类图第69-71页
        6.2.4 差异基因GO富集柱状图第71-72页
        6.2.5 KEGG富集散点图第72-73页
        6.2.6 KEGG通路第73-74页
    6.3 差异基因表达分析第74-75页
    6.4 讨论第75-76页
    6.5 小结第76-78页
第七章 结论第78-80页
参考文献第80-87页
附录第87-96页
致谢第96-97页
攻读学位论文期间发表文章第97页

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