| 摘要 | 第4-6页 |
| ABSTRACT | 第6-7页 |
| 第一章 绪论 | 第10-18页 |
| 1 黄毛鼠的研究现状 | 第10-11页 |
| 2 遗传变异的内涵及研究意义 | 第11页 |
| 3 岛屿物种遗传变异研究概况 | 第11-12页 |
| 4 分子标记在遗传变异研究中的应用 | 第12-17页 |
| 5 研究的主要内容 | 第17页 |
| 6 研究目的和意义 | 第17-18页 |
| 第二章 材料与方法 | 第18-29页 |
| 1 实验材料 | 第18-22页 |
| 1.1 研究地概况 | 第18页 |
| 1.2 试验材料 | 第18-20页 |
| 1.3 主要试剂及溶液的配制 | 第20-21页 |
| 1.3.1 主要试剂 | 第20页 |
| 1.3.2 主要溶液的配制 | 第20-21页 |
| 1.4 主要仪器设备 | 第21页 |
| 1.5 微卫星DNA标记引物 | 第21-22页 |
| 1.6 mt DNAD-loop序列扩增引物 | 第22页 |
| 2 实验方法 | 第22-27页 |
| 2.1 技术路线 | 第22-23页 |
| 2.2 基因组DNA提取 | 第23-24页 |
| 2.3 PCR扩增体系及反应程序 | 第24页 |
| 2.4 DNA及PCR产物检验 | 第24页 |
| 2.5 多态性微卫星引物筛选 | 第24-26页 |
| 2.5.1 退火温度及Mg~(2+)浓度的确定 | 第24-25页 |
| 2.5.2 引物筛选 | 第25-26页 |
| 2.6 STR基因分型 | 第26页 |
| 2.7 基因测序 | 第26-27页 |
| 3 数据分析 | 第27-29页 |
| 3.1 微卫星等位基因数据分析 | 第27页 |
| 3.2 mtDNA D-loop序列数据分析 | 第27-29页 |
| 第三章 结果与分析 | 第29-45页 |
| 1 基因组DNA提取 | 第29页 |
| 2 多态性微卫星引物筛选 | 第29-32页 |
| 2.1 退火温度及Mg~(2+)浓度的确定 | 第29-31页 |
| 2.2 微卫星引物的扩增和筛选 | 第31-32页 |
| 3 基于微卫星标记的黄毛鼠种群遗传变异分析 | 第32-38页 |
| 3.1 遗传多样性分析 | 第33-36页 |
| 3.1.1 等位基因数 | 第33-36页 |
| 3.1.2 杂合度 | 第36页 |
| 3.1.3 多态信息含量 | 第36页 |
| 3.1.4 岛屿面积、隔离度与遗传多样性的相关性 | 第36页 |
| 3.2 遗传结构分析 | 第36-38页 |
| 3.2.1 分子方差分析 | 第36-37页 |
| 3.2.2 群体间遗传分化 | 第37-38页 |
| 3.2.3 瓶颈效应分析 | 第38页 |
| 4 基于mtDNA D-loop区序列的黄毛鼠种群遗传变异分析 | 第38-45页 |
| 4.1 遗传多样性分析 | 第39-42页 |
| 4.1.1 mtDNA D-loop序列变异分析 | 第39-40页 |
| 4.1.2 单倍型分析 | 第40-41页 |
| 4.1.3 遗传多样性指数分析 | 第41页 |
| 4.1.4 岛屿面积、隔离度与遗传多样性的相关性 | 第41-42页 |
| 4.2 遗传结构分析 | 第42-45页 |
| 4.2.1 分子方差分析 | 第42页 |
| 4.2.2 群体间遗传分化 | 第42-43页 |
| 4.2.3 系统发育分析 | 第43-44页 |
| 4.2.4 网络关系分析 | 第44-45页 |
| 第四章 讨论与结论 | 第45-51页 |
| 1 讨论 | 第45-49页 |
| 1.1 微卫星引物筛选 | 第45-46页 |
| 1.1.1 PCR体系优化及基因分型 | 第45页 |
| 1.1.2 微卫星位点分离方法 | 第45-46页 |
| 1.2 遗传变异分析 | 第46-49页 |
| 1.2.1 遗传多样性 | 第46-47页 |
| 1.2.2 遗传结构 | 第47-48页 |
| 1.2.3 岛屿面积、隔离度与遗传变异的相关性 | 第48页 |
| 1.2.4 瓶颈效应分析 | 第48-49页 |
| 2 结论 | 第49-50页 |
| 3 展望 | 第50-51页 |
| 参考文献 | 第51-59页 |
| 攻读学位期间发表的研究论文 | 第59页 |
| 攻读学位期间参加的科研项目 | 第59-60页 |
| 致谢 | 第60-62页 |