| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 1 前言 | 第10-20页 |
| 1.1 多倍体植物抗性机理研究进展 | 第10-12页 |
| 1.1.1 逆境胁迫下多倍体植物的细胞形态及生理生化响应 | 第10-11页 |
| 1.1.2 逆境胁迫下多倍体植物的分子调节机制 | 第11页 |
| 1.1.3 利用多倍体优势进行西瓜抗逆育种 | 第11-12页 |
| 1.2 基因及miRNA差异表达与植物抗逆的研究进展 | 第12-16页 |
| 1.2.1 基因调控与植物抗逆性 | 第12-13页 |
| 1.2.2 miRNA调控与植物抗逆性 | 第13-14页 |
| 1.2.3 测序技术为研究差异表达基因和miRNA提供保障 | 第14-16页 |
| 1.3 海藻糖与植物抗逆的研进究展 | 第16-18页 |
| 1.3.1 植物体内海藻糖的代谢及其抗逆保护机制 | 第16-17页 |
| 1.3.2 TPS基因过表达提高植物抗逆性 | 第17页 |
| 1.3.3 外源添加海藻糖提高植物抗逆性 | 第17-18页 |
| 1.4 本研究的目的意义 | 第18-20页 |
| 2 西瓜二倍体及其同源四倍体数字基因表达谱分析 | 第20-32页 |
| 2.1 材料与方法 | 第20-24页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第20页 |
| 2.1.2 西瓜叶片Total RNA的提取 | 第20-21页 |
| 2.1.3 cDNA文库构建及测序 | 第21-22页 |
| 2.1.4 数据过滤 | 第22页 |
| 2.1.5 基因定量 | 第22页 |
| 2.1.6 差异基因筛选:泊松分布方法 | 第22-23页 |
| 2.1.7 GO分析 | 第23页 |
| 2.1.8 Pathway分析 | 第23-24页 |
| 2.2 结果分析 | 第24-30页 |
| 2.2.1 测序质量评估 | 第24-25页 |
| 2.2.2 差异表达基因分析 | 第25-26页 |
| 2.2.3 差异表达基因的GO功能分类和显著性富集分析 | 第26-27页 |
| 2.2.4 差异基因的KEGG Pathway显著性富集 | 第27-28页 |
| 2.2.5 抗逆相关差异表达基因筛选及功能分析 | 第28-30页 |
| 2.3 讨论 | 第30-32页 |
| 3 西瓜二倍体及其同源四倍体sRNA测序及抗逆相关靶基因验证 | 第32-50页 |
| 3.1 西瓜二倍体及其四倍体sRNA测序信息学分析 | 第32-41页 |
| 3.1.1 材料与方法 | 第32-34页 |
| 3.1.2 结果分析 | 第34-41页 |
| 3.2 西瓜二倍体悬浮细胞建立及靶基因qRT验证 | 第41-47页 |
| 3.2.1 材料与方法 | 第41-43页 |
| 3.2.2 结果与分析 | 第43-47页 |
| 3.3 讨论 | 第47-50页 |
| 3.3.1 西瓜二倍体及同源四倍体miRNA测序信息学分析 | 第47-48页 |
| 3.3.2 西瓜二倍体悬浮细胞建立 | 第48页 |
| 3.3.3 差异表达抗逆相关miRNA靶基因qRT验证 | 第48-50页 |
| 4 海藻糖在西瓜中的抗逆调节机制探究 | 第50-68页 |
| 4.1 材料与方法 | 第51-54页 |
| 4.1.1 材料 | 第51页 |
| 4.1.2 MeJA、ETH及SA对西瓜二倍体悬浮细胞的处理 | 第51页 |
| 4.1.3 激素模拟胁迫及实际胁迫对西瓜二倍体悬浮细胞的处理 | 第51页 |
| 4.1.4 RNA提取及检测参照第二章西瓜悬浮细胞RNA提取 | 第51页 |
| 4.1.5 基因的生物信息学分析 | 第51-52页 |
| 4.1.6 序列比对和进化树分析 | 第52页 |
| 4.1.7 基因诱导表达的qRT-PCR检测 | 第52-54页 |
| 4.1.8 胁迫条件下外源海藻糖的作用探索 | 第54页 |
| 4.2 结果与分析 | 第54-64页 |
| 4.2.1 ClTPS1基因启动子分析 | 第54-56页 |
| 4.2.2 ClTPS1基因编码的蛋白信息分析 | 第56-57页 |
| 4.2.3 ClTPS1基因编码蛋白的跨膜结构、信号肽和结构域分析 | 第57-58页 |
| 4.2.4 ClTPS1基因编码蛋白的糖基化和磷酸化位点预测 | 第58-59页 |
| 4.2.5 蛋白结构及其功能预测 | 第59页 |
| 4.2.6 ClTPS1基因系统发育树构建 | 第59-60页 |
| 4.2.7 茉莉酸甲酯诱导西瓜ClTPS1基因表达水平变化 | 第60-61页 |
| 4.2.8 西瓜中TPS基因家族响应MeJA、ETH及SA诱导的表达特性分析 | 第61页 |
| 4.2.9 ClTPS5、ClTPS6响应MeJA、ETH及高温胁迫的表达特性分析 | 第61-62页 |
| 4.2.10 西瓜中TRE家族基因受茉莉酸甲酯诱导后的表达情况分析 | 第62-63页 |
| 4.2.11 胁迫条件下外源海藻糖的作用探索 | 第63-64页 |
| 4.3 讨论 | 第64-68页 |
| 4.3.1 西瓜中TPS家族基因表达特性分析 | 第64-66页 |
| 4.3.2 西瓜中TRE家族基因表达特性分析 | 第66-67页 |
| 4.3.3 外源海藻糖对西瓜细胞抗逆性的影响 | 第67-68页 |
| 5 结论 | 第68-70页 |
| 参考文献 | 第70-84页 |
| 缩略语表 | 第84-85页 |
| 附录 | 第85-93页 |
| 附表1 西瓜二倍体和四倍体中抗逆差异表达基因筛选 | 第85-90页 |
| 附表2 抗逆差异表达miRNA统计 | 第90-92页 |
| 本研究创新点 | 第92页 |
| 读研期间发表的论文 | 第92页 |
| 本论文所受课题资助 | 第92-93页 |
| 致谢 | 第93页 |
