| 摘要 | 第2-5页 |
| Abstract | 第5-8页 |
| 缩略词中英文对照表 | 第9-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-29页 |
| 1.1 适应性进化 | 第14-20页 |
| 1.1.1 生物进化理论 | 第14-15页 |
| 1.1.2 适应性进化 | 第15-16页 |
| 1.1.3 适应性进化的分子机制 | 第16-20页 |
| 1.1.3.1 基因序列水平上的适应性进化 | 第16-19页 |
| 1.1.3.2 基因表达调控水平上的适应性进化 | 第19-20页 |
| 1.2 转录组学在植物适应性进化方面的研究 | 第20-23页 |
| 1.2.1 转录组学的研究方法 | 第20-23页 |
| 1.2.1.1 基于基因芯片的方法 | 第21页 |
| 1.2.1.2 基于第一代测序技术的方法 | 第21-22页 |
| 1.2.1.3 基于新一代高通量测序的方法 | 第22-23页 |
| 1.2.2 基于新一代测序技术的转录组学在适应性进化方面的研究 | 第23页 |
| 1.3 植物耐干旱的研究 | 第23-26页 |
| 1.3.1 干旱化 | 第23-24页 |
| 1.3.2 干旱对植物的影响 | 第24页 |
| 1.3.3 植物抗氧化机制 | 第24-25页 |
| 1.3.4 植物响应干旱的基因以及分离方法 | 第25-26页 |
| 1.4 蚓果芥 | 第26-27页 |
| 1.5 研究目的和意义 | 第27-29页 |
| 第二章 研究内容、试验设计 | 第29-34页 |
| 2.1 研究内容 | 第29-30页 |
| 2.1.1 两种生态型蚓果芥实验室的表型差异及染色体差异 | 第29页 |
| 2.1.2 基于转录组数据的两种生态型蚓果芥适应性进化研究 | 第29页 |
| 2.1.3 互助型蚓果芥对渗透胁迫的生理及分子响应研究 | 第29-30页 |
| 2.2 技术路线 | 第30-31页 |
| 2.3 试验材料与试验设计 | 第31-34页 |
| 2.3.1 试验材料 | 第31页 |
| 2.3.2 试验设计 | 第31-34页 |
| 2.3.2.1 试验1两种生态型蚓果芥种子发芽比对试验 | 第31页 |
| 2.3.2.2 试验2两种生态型蚓果芥生长发育比对试验 | 第31-32页 |
| 2.3.2.3 试验3两种生态型蚓果芥染色体制片与观察试验 | 第32页 |
| 2.3.2.4 试验4两种生态型蚓果芥转录组学试验 | 第32页 |
| 2.3.2.5 试验5互助型蚓果芥对渗透胁迫的生理响应试验 | 第32页 |
| 2.3.2.6 试验6互助型蚓果芥响应渗透胁迫基因的分离与表达分析试验 | 第32-33页 |
| 2.3.2.7 试验7互助型蚓果芥抗氧化相关基因响应渗透胁迫的表达分析试验 | 第33-34页 |
| 第三章 两种生态型蚓果芥实验室的表型差异及染色体差异 | 第34-40页 |
| 3.1 引言 | 第34页 |
| 3.2 试验方法 | 第34-35页 |
| 3.2.1 材料培养 | 第34页 |
| 3.2.2 染色体制片与观察 | 第34-35页 |
| 3.3 结果与分析 | 第35-38页 |
| 3.4 讨论 | 第38-39页 |
| 3.5 本章小结 | 第39-40页 |
| 第四章 两种生态型蚓果芥转录组测序、组装及注释 | 第40-48页 |
| 4.1 引言 | 第40页 |
| 4.2 试验方法 | 第40-43页 |
| 4.2.1 材料培养和取样 | 第40页 |
| 4.2.2 RNA提取和质量检测 | 第40-41页 |
| 4.2.3 建库流程 | 第41页 |
| 4.2.4 转录组组装 | 第41-42页 |
| 4.2.5 转录组注释 | 第42-43页 |
| 4.3 结果与分析 | 第43-45页 |
| 4.3.1 转录组测序和从头组装结果 | 第43-44页 |
| 4.3.2 功能注释以及蚓果芥unigenes的特征 | 第44-45页 |
| 4.4 讨论 | 第45-47页 |
| 4.5 本章小结 | 第47-48页 |
| 第五章 两种生态型蚓果芥基于转录组数据的差异表达基因分析 | 第48-55页 |
| 5.1 引言 | 第48页 |
| 5.2 数据分析方法 | 第48页 |
| 5.3 结果和分析 | 第48-52页 |
| 5.3.1 差异表达基因及注释 | 第48-50页 |
| 5.3.2 差异表达转录子 | 第50页 |
| 5.3.3 差异表达的开花相关基因 | 第50-52页 |
| 5.4 讨论 | 第52-53页 |
| 5.5 本章小结 | 第53-55页 |
| 第六章 两种生态型蚓果芥正选择基因 | 第55-60页 |
| 6.1 引言 | 第55页 |
| 6.2 数据分析方法 | 第55页 |
| 6.3 结果与分析 | 第55-57页 |
| 6.4 讨论 | 第57-59页 |
| 6.4.1 差异表达正选择基因——乙烯信号调节基因EIN2 | 第57-58页 |
| 6.4.2 差异表达正选择基因——泛素连接酶基因KEG | 第58页 |
| 6.4.3 差异表达正选择基因——调节开花时间基因ELF6 | 第58-59页 |
| 6.5 本章小结 | 第59-60页 |
| 第七章 互助型蚓果芥对渗透胁迫的生理响应 | 第60-70页 |
| 7.1 引言 | 第60页 |
| 7.2 试验方法 | 第60-64页 |
| 7.2.1 材料培养和处理 | 第60-61页 |
| 7.2.2 RWC的测定 | 第61页 |
| 7.2.3 可溶性蛋白含量测定 | 第61-62页 |
| 7.2.4 MDA含量测定 | 第62页 |
| 7.2.5 SOD酶活性测定 | 第62-63页 |
| 7.2.6 POD酶活性测定 | 第63-64页 |
| 7.2.7 CAT活性测定 | 第64页 |
| 7.2.8 数据计算分析 | 第64页 |
| 7.3 结果和分析 | 第64-67页 |
| 7.3.1 表型变化 | 第64-66页 |
| 7.3.2 生理参数 | 第66-67页 |
| 7.4 讨论 | 第67-69页 |
| 7.4.1 PEG-6000胁迫下叶片的水分变化 | 第67-68页 |
| 7.4.2 PEG-6000胁迫下的蛋白含量与氧化损伤 | 第68页 |
| 7.4.3 PEG-6000胁迫下的抗氧化酶活动 | 第68-69页 |
| 7.5 本章小结 | 第69-70页 |
| 第八章 互助型蚓果芥渗透胁迫响应基因BhCIPK12的克隆及表达分析 | 第70-77页 |
| 8.1 引言 | 第70页 |
| 8.2 试验方法 | 第70-72页 |
| 8.2.1 DDRT-PCR分离响应渗透胁迫的基因 | 第70-71页 |
| 8.2.2 响应渗透胁迫基因的克隆与测序 | 第71页 |
| 8.2.3 荧光定量qRT-PCR | 第71-72页 |
| 8.2.4 基因的生物信息学分析 | 第72页 |
| 8.3 结果和分析 | 第72-75页 |
| 8.3.1 差异显示cDNA片段 | 第72-75页 |
| 8.3.2 BhCIPK12的相对转录表达水平分析 | 第75页 |
| 8.4 讨论 | 第75-76页 |
| 8.5 本章小结 | 第76-77页 |
| 第九章 互助型蚓果芥渗透胁迫下抗氧化相关基因的表达分析 | 第77-84页 |
| 9.1 引言 | 第77页 |
| 9.2 试验方法 | 第77-78页 |
| 9.2.1 材料培养和处理 | 第77-78页 |
| 9.2.2 荧光定量qRT-PCR表达分析 | 第78页 |
| 9.3 结果和分析 | 第78-83页 |
| 9.4 讨论 | 第83页 |
| 9.5 本章小结 | 第83-84页 |
| 第十章 结论和展望 | 第84-87页 |
| 10.1 结论 | 第84-86页 |
| 10.2 展望 | 第86-87页 |
| 参考文献 | 第87-100页 |
| 致谢 | 第100-101页 |
| 博士期间研究成果 | 第101-102页 |
| 作者简介 | 第102-103页 |
| 导师简介 | 第103-105页 |
