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基于形态学和高通量测序技术对嘉陵江(凤县段)硅藻多样性的研究

摘要第5-6页
Abstract第6-7页
第一章 文献综述第10-16页
    1.1 硅藻简介第10页
    1.2 硅藻分类研究第10-12页
    1.3 分类系统研究第12-13页
    1.4 硅藻在水环境监测中的应用第13-14页
    1.5 嘉陵江自然概况第14页
    1.6 本研究的目的和意义第14-16页
第二章 材料与方法第16-20页
    2.1 主要采样工具及试剂第16页
    2.2 采样点分布第16-17页
    2.3 样品采集及处理第17页
    2.4 显微观察制样及拍照第17页
    2.5 硅藻鉴定及描述第17页
    2.6 硅藻计数第17-18页
    2.7 统计数据分析第18页
    2.8 数据处理第18-19页
    2.9 高通量测序技术分析第19-20页
第三章 嘉陵江(凤县段)硅藻分类第20-32页
    3.1 直链藻属(Melosira Agardh)第20页
    3.2 小环藻属(Cyclotella Kützing)第20-21页
    3.3 冠盘藻属(Stephanodiscus Kützing)第21页
    3.4 等片藻属(Diatoma De Candolle)第21-22页
    3.5 针杆藻属(Synedre Ehrenberg)第22-23页
    3.6 脆杆藻属(Fragilaria Lyngbye)第23-24页
    3.7 卵形藻属(Cocconeis Ehrenberg)第24页
    3.8 曲壳藻属(Achnanthes Bory)第24-25页
    3.9 异极藻属(Gomphonema Ehrenberg)第25-26页
    3.10 内丝藻属(Encyonema Kützing)第26-27页
    3.11 瑞氏藻属(Reimeria Kociolek et Stoermer)第27页
    3.12 弯肋藻属(Cymbopleura Krammer)第27页
    3.13 桥弯藻属(Cymbella Agardh emend. Krammer)第27-28页
    3.14 肋缝藻属(Frustulia. Rabenhorst)第28页
    3.15 双壁藻属(Diploneis Ehrenberg)第28-29页
    3.16 舟形藻属(Navicula Bory)第29-30页
    3.17 菱形藻属(Nitzschia Hassall)第30-32页
第四章 高通量测序技术鉴定嘉陵江(凤县段)硅藻第32-36页
    4.1 测序数据处理第32页
    4.2 OTU聚类及分析第32-33页
    4.3 物种组成分析第33-34页
    4.4 物种注释第34-36页
第五章 高通量测序技术与形态鉴定结果的差异分析第36-40页
    5.1 两种鉴定方法在种属水平上的数量差异第36页
    5.2 两种鉴定方法在种属水平上的差异分析第36-40页
第六章 嘉陵江(凤县段)的硅藻生物指数评价第40-43页
    6.1 硅藻密度和种类分析第40页
    6.2 优势种及生物指数分析第40-43页
第七章 讨论第43-47页
    7.1 未知藻的鉴定第43页
    7.2 高通量测序分析第43-45页
    7.3 水质评价结果的差异分析第45-47页
第八章 结论与展望第47-48页
参考文献第48-53页
图版Ⅰ第53-54页
图版Ⅱ第54-55页
图版Ⅲ第55-56页
图版Ⅳ第56-57页
图版Ⅴ第57-58页
图版Ⅵ第58-59页
图版Ⅶ第59-60页
图版Ⅷ第60-61页
图版Ⅸ第61-62页
图版Ⅹ第62-63页
图版Ⅺ第63-64页
图版Ⅻ第64-65页
图版ⅩⅢ第65-66页
图版ⅩⅣ第66-67页
图版ⅩⅤ第67-68页
图版ⅩⅥ第68-69页
图版ⅩⅦ第69-70页
图版ⅩⅧ第70-71页
图版ⅩⅨ第71-72页
图版ⅩⅩ第72-73页
附录A第73-74页
附录B第74-75页
致谢第75页

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