牦牛基因组遗传变异图谱和高原适应的转录组研究
| 摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 第一章 研究背景 | 第12-38页 |
| 1.1 牦牛 | 第12-22页 |
| 1.1.1 牦牛的起源与驯化 | 第12-16页 |
| 1.1.2 牦牛的育种现状 | 第16-19页 |
| 1.1.3 牦牛的高海拔适应研究 | 第19-22页 |
| 1.2 家养动物育种的研究进展 | 第22-30页 |
| 1.2.1 驯化与育种 | 第22-25页 |
| 1.2.2 分子育种 | 第25-30页 |
| 1.3 高海拔适应机制的研究进展 | 第30-35页 |
| 1.3.1 高海拔适应的分子机制 | 第31-32页 |
| 1.3.2 基因组学研究 | 第32-33页 |
| 1.3.3 转录组学研究 | 第33-35页 |
| 1.4 研究意义和科学问题 | 第35-38页 |
| 1.4.1 牦牛基因组遗传变异图谱 | 第37页 |
| 1.4.2 牦牛高海拔适应的分子机制 | 第37-38页 |
| 第二章 材料与方法 | 第38-51页 |
| 2.1 牦牛基因组遗传变异图谱 | 第38-47页 |
| 2.1.1 牦牛基因组的升级 | 第38-42页 |
| 2.1.2 样品采集与DNA测序 | 第42页 |
| 2.1.3 全基因组遗传变异的鉴定 | 第42-45页 |
| 2.1.4 群体基因组学分析 | 第45-46页 |
| 2.1.5 遗传变异图谱的可视化 | 第46-47页 |
| 2.2 牦牛高海拔适应的分子机制 | 第47-51页 |
| 2.2.1 样品采集与RNA测序 | 第47页 |
| 2.2.2 差异表达分析 | 第47-48页 |
| 2.2.3 组织间表达相关性比较 | 第48-49页 |
| 2.2.4 多组织差异表达基因 | 第49-51页 |
| 第三章 研究结果 | 第51-73页 |
| 3.1 牦牛基因组遗传变异图谱 | 第51-62页 |
| 3.1.1 基因组组装与注释 | 第51-52页 |
| 3.1.2 样品采集与测序 | 第52-54页 |
| 3.1.3 全基因组遗传变异 | 第54-58页 |
| 3.1.4 群体基因组学分析 | 第58-60页 |
| 3.1.5 遗传变异图谱的可视化 | 第60-62页 |
| 3.3 牦牛高海拔适应的分子机制 | 第62-73页 |
| 3.3.1 样品采集以及转录组测序 | 第62页 |
| 3.3.2 表达模式分析 | 第62-65页 |
| 3.3.3 差异表达基因 | 第65-69页 |
| 3.3.4 多组织差异表达基因 | 第69-73页 |
| 第四章 讨论 | 第73-85页 |
| 4.1 牦牛基因组遗传变异图谱 | 第73-79页 |
| 4.1.1 基因组的升级 | 第73-74页 |
| 4.1.2 家养牦牛与野生牦牛的遗传分化 | 第74-75页 |
| 4.1.3 家养牦牛的驯化 | 第75-77页 |
| 4.1.4 遗传变异图谱和分子育种 | 第77-79页 |
| 4.2 牦牛高海拔适应的分子机制 | 第79-83页 |
| 4.2.1 牦牛与黄牛表达模式的差异 | 第79-80页 |
| 4.2.2 差异表达基因对低氧胁迫的应答 | 第80-81页 |
| 4.2.3 多组织差异表达基因 | 第81-83页 |
| 4.3 总结与展望 | 第83-85页 |
| 参考文献 | 第85-98页 |
| 在学期间的研究成果 | 第98-99页 |
| 致谢 | 第99页 |
