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基于辅因子调控的S-腺苷蛋氨酸合成研究

摘要第5-9页
ABSTRACT第9-12页
第一章 绪论第22-38页
    1.1 S-腺苷蛋氨酸简介第22-23页
        1.1.1 S-腺苷蛋氨酸的理化性质第22页
        1.1.2 S-腺苷蛋氨酸的生理功能第22-23页
    1.2 S-腺苷蛋氨酸的生产方法第23-26页
        1.2.1 酶催化法合成S-腺苷蛋氨酸第23-24页
        1.2.2 全细胞催化法合成S-腺苷蛋氨酸第24页
        1.2.3 微生物发酵法生产S-腺苷蛋氨酸第24-26页
    1.3 S-腺苷蛋氨酸高产菌株的改造第26-29页
        1.3.1 S-腺苷蛋氨酸高产菌株的传统选育第26-27页
        1.3.2 S-腺苷蛋氨酸合成酶的选择及改造第27页
        1.3.3 S-腺苷蛋氨酸合成途径的优化第27-28页
        1.3.4 菌株合成ATP能力的改善第28-29页
    1.4 辅因子调控的研究现状第29-34页
        1.4.1 辅因子工程简介第29页
        1.4.2 辅因子NAD(P)H调控的研究现状第29-31页
        1.4.3 辅因子ATP调控的研究现状第31-34页
    1.5 论文主要研究内容第34-38页
        1.5.1 微生物法制备S-腺苷蛋氨酸存在的问题第34-35页
        1.5.2 辅因子调控S-腺苷蛋氨酸合成过程存在的问题第35页
        1.5.3 主要研究内容第35-38页
第二章 NADPH调控大肠杆菌合成S-腺苷蛋氨酸的研究第38-76页
    2.1 引言第38-39页
    2.2 实验材料第39-43页
        2.2.1 菌株和质粒第39-41页
        2.2.2 引物第41-43页
        2.2.3 酶及试剂盒第43页
        2.2.4 实验仪器及常用试剂第43页
    2.3 分子生物学操作方法第43-50页
        2.3.1 基因组提取第43-44页
        2.3.2 大肠杆菌质粒提取第44页
        2.3.3 目的基因的扩增第44-45页
        2.3.4 琼脂糖凝胶电泳及DNA回收第45-46页
        2.3.5 酶切及连接第46页
        2.3.6 大肠杆菌的化学转化第46-47页
        2.3.7 菌落PCR第47页
        2.3.8 大肠杆菌的电转化第47-48页
        2.3.9 SDS-PAGE电泳第48-49页
        2.3.10 细菌RNA的提取第49页
        2.3.11 cDNA的制备第49-50页
        2.3.12 荧光定量PCR第50页
    2.4 发酵方法第50-52页
        2.4.1 菌种保藏第50-51页
        2.4.2 培养条件第51-52页
    2.5 分析方法第52-53页
        2.5.1 生物量测定第52页
        2.5.2 荧光强度测定第52页
        2.5.3 S-腺苷蛋氨酸的萃取及含量测定第52-53页
        2.5.4 谷胱甘肽的提取及含量测定第53页
        2.5.5 其他代谢物测定第53页
        2.5.6 ATP和ADP的含量测定第53页
        2.5.7 NAD(H)和NADP(H)的含量测定第53页
    2.6 实验结果与讨论第53-75页
        2.6.1 基于人工合成sRNA系统的构建第53-57页
        2.6.2 基于人工合成sRNA系统的弱化效果评价第57-60页
        2.6.3 基于人工合成sRNA调控副产物代谢途径相关基因第60-62页
        2.6.4 基于合成sRNA系统调控胞内NADPH水平第62-66页
        2.6.5 NADPH再生系统对S-腺苷蛋氨酸合成的影响第66-69页
        2.6.6 NADPH调控胞内S-腺苷蛋氨酸合成的机理研究第69-75页
    2.7 本章小结第75-76页
第三章 基于人工合成的sRNA策略及核糖开关ydaO模块调控大肠杆菌胞内ATP水平的研究第76-98页
    3.1 引言第76-77页
    3.2 实验材料与方法第77-80页
        3.2.1 菌株和质粒第77-78页
        3.2.2 引物第78-79页
        3.2.3 枯草芽孢杆菌基因组提取第79页
        3.2.4 磷钼酸比色法测定胞内ATP含量第79-80页
    3.3 结果分析与讨论第80-95页
        3.3.1 ATP依赖的副产物代谢途径相关基因的sRNA弱化系统构建第80-85页
        3.3.2 合成的sRNA系统对于细胞生长和S-腺苷蛋氨酸合成的影响第85-87页
        3.3.3 合成的sRNA策略扰动ATP水平并且重新定向碳代谢分布第87-89页
        3.3.4 ATP水平变化对于谷胱甘肽合成的影响第89页
        3.3.5 ydaO模块动态调控ATP的原理及设计第89-91页
        3.3.6 ydaO模块动态调控ATP相关质粒的构建第91-93页
        3.3.7 ydaO模块在大肠杆菌胞内表达的验证第93-94页
        3.3.8 核糖开关ydaO对于大肠杆菌胞内合成S-腺苷蛋氨酸的调控作用第94-95页
    3.4 本章小结第95-98页
第四章 酿酒酵母中细胞质和线粒体中NADPH的调控作用第98-114页
    4.1 引言第98-99页
    4.2 实验材料与方法第99-102页
        4.2.1 菌株和质粒第99-100页
        4.2.2 引物第100页
        4.2.3 菌种保藏及培养条件第100-101页
        4.2.4 酿酒酵母的化学转化第101-102页
        4.2.5 重组酿酒酵母菌落PCR第102页
    4.3 结果分析与讨论第102-112页
        4.3.1 酿酒酵母不同区域NADPH再生重组质粒的构建第102-104页
        4.3.2 NADPH再生重组菌株的构建第104页
        4.3.3 NADPH再生系统在酿酒酵母细胞中的定位表征第104-106页
        4.3.4 NADPH再生系统对于胞内吡啶核苷酸的扰动第106-109页
        4.3.5 分区域调控NADPH对于S-腺苷蛋氨酸合成的影响第109-110页
        4.3.6 酿酒酵母分区域NADPH调控机理分析第110-112页
    4.4 本章小结第112-114页
第五章 ATP调控策略用于酿酒酵母合成S-腺苷蛋氨酸的研究第114-142页
    5.1 引言第114-115页
    5.2 实验材料与方法第115-122页
        5.2.1 菌株和质粒第115-116页
        5.2.2 引物第116-118页
        5.2.3 酿酒酵母基因表达盒的快速构建第118-120页
        5.2.4 酿酒酵母RNA的提取第120-121页
        5.2.5 酿酒酵母胞内代谢物的测定第121-122页
    5.3 结果分析与讨论第122-141页
        5.3.1 pRS425-P_(TFEl)-sam2-T_(PGI)重组质粒构建第122-123页
        5.3.2 胞内ATP水平扰动的相关质粒构建第123-125页
        5.3.3 启动子的选择第125-126页
        5.3.4 ATP水平变化对于S-腺苷蛋氨酸合成的影响第126-128页
        5.3.5 酿酒酵母胞内ATP水平变化第128-129页
        5.3.6 ATP调控对于胞内代谢物的分布影响第129-134页
        5.3.7 ATP调控对于中心碳代谢关键基因的转录作用分析第134-138页
        5.3.8 不同蛋氨酸浓度对于S-腺苷蛋氨酸合成的影响第138-141页
    5.4 本章小结第141-142页
第六章 结论与建议第142-146页
    6.1 论文主要结论第142-143页
    6.2 论文创新点第143-144页
    6.3 问题与展望第144-146页
参考文献第146-156页
附录第156-162页
    附录1 试剂盒及分子操作主要试剂第156-157页
    附录2 其他主要试剂第157-158页
    附录3 主要设备第158-159页
    附录4 基因优化序列第159-162页
研究成果及发表的学术论文第162-164页
致谢第164-166页
作者与导师简介第166-167页
附件第167-168页

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