| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 第一章 分子马达与蛋白 | 第7-10页 |
| ·引言 | 第7-8页 |
| ·驱动蛋白力产生机制 | 第8-9页 |
| ·半螺旋 | 第9-10页 |
| 第二章 分子动力学简介 | 第10-16页 |
| ·NAMD概述 | 第10-11页 |
| ·温度控制和平衡 | 第11-12页 |
| ·朗之万动力学参数 | 第11-12页 |
| ·非键相互作用的距离测试 | 第12-16页 |
| 第三章 驱动蛋白颈链对接的启动机制 | 第16-29页 |
| ·引言 | 第16-17页 |
| ·颈链对接的三个步骤 | 第17-18页 |
| ·半螺旋形成的机理 | 第18-19页 |
| ·颈链对接过程的分子动力学模拟 | 第19-29页 |
| ·模型与方法 | 第19-21页 |
| ·分子动力学模拟 | 第21-22页 |
| ·结果与讨论 | 第22-29页 |
| 第四章 结论与展望 | 第29-30页 |
| 参考文献 | 第30-32页 |
| 致谢 | 第32-33页 |
| 攻读硕士学位期间所取得的相关科研成果 | 第33页 |