| 个人简历 | 第1-6页 |
| 英文缩略词 | 第6-7页 |
| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-12页 |
| 第一章 基于全基因组DNA甲基化芯片技术建立HBV/HCV阴性的原发性肝癌及癌旁组织DNA甲基化谱 | 第12-50页 |
| 1 前言 | 第12-13页 |
| 2 材料及方法 | 第13-28页 |
| ·组织标本 | 第13-14页 |
| ·主要试剂、耗材及设备 | 第14-16页 |
| ·实验方法 | 第16-20页 |
| ·TCGA数据库数据挖掘 | 第20-21页 |
| ·甲基化芯片数据分析 | 第21-24页 |
| ·生物信息学分析 | 第24-26页 |
| ·统计学分析 | 第26-28页 |
| 3 结果 | 第28-38页 |
| ·样本信息汇总 | 第28-29页 |
| ·探针级别和样本级别的质控 | 第29-31页 |
| ·SVA分析结果 | 第31-32页 |
| ·肝癌组织与癌旁组织的DNA甲基化差异 | 第32-35页 |
| ·GO分析 | 第35-37页 |
| ·Pathway分析 | 第37-38页 |
| 4 讨论 | 第38-42页 |
| 参考文献A | 第42-50页 |
| 第二章 部分功能基因的甲基化程度验证及表达水平验证 | 第50-76页 |
| 1 前言 | 第50页 |
| 2 材料及方法 | 第50-64页 |
| ·组织标本 | 第50页 |
| ·主要试剂、耗材及设备 | 第50-52页 |
| ·实验方法 | 第52-64页 |
| ·统计学分析 | 第64页 |
| 3 结果 | 第64-69页 |
| ·样本信息汇总 | 第64-65页 |
| ·甲基化位点的甲基化程度验证 | 第65-68页 |
| ·实时荧光定量PCR结果 | 第68页 |
| ·免疫组织化学染色结果 | 第68-69页 |
| 4 讨论 | 第69-73页 |
| 参考文献B | 第73-76页 |
| 第三章 综述DNA甲基化与肿瘤 | 第76-87页 |
| 1 DNA甲基化机制和研究方法 | 第76-77页 |
| 2 DNA甲基化与肿瘤的关系 | 第77-80页 |
| ·肿瘤细胞C-T突变 | 第78-79页 |
| ·DNA甲基化异常 | 第79-80页 |
| ·CpG岛甲基化表型 | 第80页 |
| 3 DNA甲基化对肿瘤研究的临床意义 | 第80-82页 |
| ·DNA甲基化与肿瘤诊断 | 第80-81页 |
| ·DNA甲基化与肿瘤治疗 | 第81-82页 |
| 4 结语 | 第82-83页 |
| 参考文献C | 第83-87页 |
| 全文小结 | 第87-88页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文及专利申请 | 第88-89页 |
| 致谢 | 第89页 |