| 中文摘要 | 第1-6页 |
| Abstract | 第6-8页 |
| 常用缩略词表 | 第8-13页 |
| 文献综述 | 第13-21页 |
| 1 PToV的发现 | 第13-15页 |
| 2 PToV基因组结构及特点 | 第15-17页 |
| 3 PToV生物学特性 | 第17页 |
| 4 PToV检测方法 | 第17-18页 |
| 5 PToV流行病学 | 第18-19页 |
| 6 前景展望 | 第19-21页 |
| 第一章 猪环曲病毒检测方法的建立 | 第21-39页 |
| 1 实验材料 | 第21-23页 |
| ·病毒与细菌 | 第21页 |
| ·临床样品 | 第21-22页 |
| ·主要试剂和仪器 | 第22页 |
| ·溶液配制 | 第22-23页 |
| 2 实验方法 | 第23-28页 |
| ·猪环曲病毒RT-PCR检测方法的建立 | 第23-26页 |
| ·引物设计与合成 | 第23页 |
| ·病毒RNA提取及反转录 | 第23页 |
| ·PCR扩增 | 第23-24页 |
| ·RT-PCR产物的回收 | 第24页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第24-25页 |
| ·目的片段的克隆 | 第25页 |
| ·目的片段的测序 | 第25-26页 |
| ·特异性实验 | 第26页 |
| ·敏感性实验 | 第26页 |
| ·重复性实验 | 第26页 |
| ·临床样品检测 | 第26页 |
| ·猪环曲病毒荧光定量RT-PCR检测方法的建立 | 第26-28页 |
| ·病毒核酸的提取 | 第26页 |
| ·荧光定量引物设计 | 第26-27页 |
| ·阳性标准品的制备 | 第27页 |
| ·反应条件的优化 | 第27页 |
| ·标准曲线建立 | 第27-28页 |
| ·特异性检测 | 第28页 |
| ·可重复性及再现性评估 | 第28页 |
| ·实时荧光RT-PCR和已建立常规的PCR灵敏度比较 | 第28页 |
| ·建立实时荧光RT-PCR对临床样品的检测 | 第28页 |
| ·实时荧光RT-PCR与已建立常规的PCR选择 | 第28页 |
| 3 结果 | 第28-35页 |
| ·猪环曲病毒RT-PCR检测方法结果 | 第28-32页 |
| ·RT-PCR扩增产物电泳结果 | 第28-29页 |
| ·目的片段克隆测序与序列分析 | 第29页 |
| ·特异性实验结果 | 第29-30页 |
| ·敏感性实验结果 | 第30-31页 |
| ·重复性实验结果 | 第31页 |
| ·临床样品检测结果 | 第31-32页 |
| ·猪环曲病毒荧光定量RT-PCR检测方法结果 | 第32-35页 |
| ·优化的Real Time RT-PCR检测条件 | 第32页 |
| ·PToV实时荧光RT-PCR敏感性 | 第32-33页 |
| ·Real Time RT-PCR标准曲线 | 第33-34页 |
| ·融解曲线和特异性分析 | 第34页 |
| ·重复性与再现性 | 第34-35页 |
| ·建立的RRT-PCR方法对临床样品的检测 | 第35页 |
| ·实时荧光RT-PCR与已建立常规的PCR的选择 | 第35页 |
| 4 讨论 | 第35-38页 |
| ·RT-PCR检测方法 | 第35-36页 |
| ·RRT-PCR检测方法 | 第36-38页 |
| 5 小结 | 第38-39页 |
| 第二章 四川省2011-2013年猪环曲病毒流行病学调查 | 第39-54页 |
| 1 实验材料 | 第39页 |
| ·样品收集及分类 | 第39页 |
| 2 实验方法 | 第39-42页 |
| ·引物设计与合成 | 第39-40页 |
| ·RNA的提取及RT-PCR的扩增 | 第40-41页 |
| ·PToV M基因的扩增,克隆及测序 | 第41-42页 |
| ·PToV M基因的序列分析及系统发育树的绘制 | 第42页 |
| 3 结果 | 第42-51页 |
| ·PToV采集区域图 | 第42页 |
| ·不同猪群PToV感染率 | 第42-43页 |
| ·不同地区PToV感染率 | 第43-44页 |
| ·混合感染检测结果 | 第44-45页 |
| ·进化树的建立 | 第45-47页 |
| ·M基因的同源性比对 | 第47-50页 |
| ·基因突变分析 | 第50-51页 |
| 4 讨论 | 第51-53页 |
| ·流行病学 | 第51-52页 |
| ·进化分析 | 第52-53页 |
| 5. 小结 | 第53-54页 |
| 全文结论 | 第54-55页 |
| 参考文献 | 第55-60页 |
| 致谢 | 第60-61页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第61页 |