粗粒化DNA穿孔行为的分子动力学模拟研究
| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 目录 | 第7-8页 |
| 第一章 绪论 | 第8-16页 |
| 1 前言 | 第8-9页 |
| 2 生物高分子简介 | 第9-11页 |
| ·DNA 及 B 型 DNA 的结构 | 第10-11页 |
| 3 几种计算机模拟方法简介 | 第11-15页 |
| ·计算机模拟方法 | 第11-13页 |
| ·分子动力学模拟法简介 | 第13-15页 |
| 4 本文研究的主要内容和意义 | 第15-16页 |
| 第二章 DNA 粗粒化方法 | 第16-26页 |
| 1 高分子粗粒化方法简论 | 第16-17页 |
| 2 DNA 高分子链的性质 | 第17-20页 |
| ·DNA 作为半柔性链的基本性质 | 第18-20页 |
| 3 DNA 粗粒化模型 | 第20-25页 |
| ·三点粗粒化模型（3spn） | 第20-22页 |
| ·各向异性粗粒化方法 | 第22-23页 |
| ·MRG-GG：分子重置化粗粒化 DNA 模型 | 第23-25页 |
| 4 小结 | 第25-26页 |
| 第三章 DNA 穿孔行为的分子动力学模拟 | 第26-38页 |
| 1 引言 | 第26-30页 |
| 2 DS DNA 穿孔行为的研究 | 第30-36页 |
| ·模型和算法 | 第30-32页 |
| ·结果与讨论 | 第32-36页 |
| 3 小结 | 第36-38页 |
| 第四章 总结与展望 | 第38-40页 |
| 参考文献 | 第40-44页 |
| 致谢 | 第44-46页 |
| 攻读硕士期间发表的论文 | 第46页 |
