| 中文摘要 | 第1-6页 |
| 英文摘要 | 第6-13页 |
| 第一章 文献综述 | 第13-26页 |
| ·车轮虫的形态分类学及系统发育学研究概况 | 第14-19页 |
| ·系统分类安排 | 第14-16页 |
| ·形态分类学研究历史 | 第16页 |
| ·基于形态特征的系统发育学研究进展 | 第16-19页 |
| ·车轮虫的分子系统发育学研究进展 | 第19-23页 |
| ·分子系统发育学研究介绍 | 第19-22页 |
| ·分子系统学采用的分子标记 | 第19-20页 |
| ·分子进化研究采用的分子技术 | 第20页 |
| ·分子系统进化树的构建 | 第20-22页 |
| ·分子系统学引发的争议 | 第22页 |
| ·车轮虫分子系统发育学研究现状 | 第22-23页 |
| ·国内车轮虫的研究历史 | 第23-24页 |
| ·当前存在的问题 | 第24-25页 |
| ·本研究的目的意义 | 第25-26页 |
| 第二章 齿体特征量化法的提出及其在车轮虫系统发育研究中的应用 | 第26-51页 |
| ·引言 | 第26页 |
| ·齿体特征量化法的提出 | 第26-30页 |
| ·显著车轮虫种群间关系研究 | 第30-37页 |
| ·材料和方法 | 第30-31页 |
| ·样品采集与种类鉴定 | 第30页 |
| ·标本测量与数据统计 | 第30页 |
| ·齿体特征量化法 | 第30-31页 |
| ·数据分析 | 第31页 |
| ·结果 | 第31-36页 |
| ·显著车轮虫形态描述及种群比较 | 第31-34页 |
| ·显著车轮虫种群间齿体特征量化值比较 | 第34-35页 |
| ·显著车轮虫种群亲缘关系分析 | 第35-36页 |
| ·讨论 | 第36页 |
| ·显著车轮虫的种群比较分析 | 第36页 |
| ·齿体特征量化应注意的问题 | 第36页 |
| ·小结 | 第36-37页 |
| ·车轮虫科属间亲缘关系研究 | 第37-49页 |
| ·材料与方法 | 第37-41页 |
| ·材料收集 | 第37-41页 |
| ·齿体特征的量化 | 第41页 |
| ·数据分析 | 第41页 |
| ·结果 | 第41-46页 |
| ·游走亚目各属齿体的特征量化值比较 | 第41-45页 |
| ·车轮虫科属间的相互关系 | 第45-46页 |
| ·讨论 | 第46-49页 |
| ·车轮虫科各属的系统发育关系 | 第46-47页 |
| ·车轮虫科齿体的演化趋势 | 第47-48页 |
| ·齿体发生与齿体演化的关系 | 第48-49页 |
| ·齿体特征量化法的意义 | 第49-51页 |
| 第三章 基于 SSU rRNA 基因序列的车轮虫分子系统发育研究 | 第51-84页 |
| ·引言 | 第51页 |
| ·材料与方法 | 第51-59页 |
| ·样品收集、分离及鉴定 | 第51-53页 |
| ·样品来源与预处理 | 第52页 |
| ·种类鉴定 | 第52-53页 |
| ·纯种分离 | 第53页 |
| ·基因组DNA的提取、PCR扩增与克隆测序 | 第53-56页 |
| ·DNA的提取 | 第53-54页 |
| ·PCR扩增 | 第54页 |
| ·DNA片断的纯化 | 第54-55页 |
| ·高效感受态细胞的制备 | 第55页 |
| ·DNA片断的克隆 | 第55-56页 |
| ·测序 | 第56页 |
| ·数据分析 | 第56-59页 |
| ·序列的对位排列 | 第56-58页 |
| ·序列的初步分析 | 第58页 |
| ·系统发育分析 | 第58-59页 |
| ·结果 | 第59-77页 |
| ·形态学特征 | 第59-63页 |
| ·异齿车轮虫 | 第59-60页 |
| ·狮鱼车轮虫 | 第60页 |
| ·显著车轮虫 | 第60页 |
| ·网状车轮虫 | 第60页 |
| ·鳜车轮虫 | 第60-61页 |
| ·眉溪小车轮虫 | 第61-63页 |
| ·分子系统发育学研究 | 第63-77页 |
| ·序列变异情况 | 第64-66页 |
| ·全序列位点的分析 | 第64页 |
| ·去掉高度变异位点的序列分析 | 第64-66页 |
| ·系统发育关系分析 | 第66-77页 |
| ·全序列位点的系统发育关系分析 | 第66-67页 |
| ·去掉高度变异位点序列的系统发育关系分析 | 第67-77页 |
| ·讨论 | 第77-84页 |
| ·缘毛类纤毛虫的系统发育地位 | 第77-79页 |
| ·缘毛类纤毛虫的亲缘关系研究 | 第79-80页 |
| ·车轮虫种属间亲缘关系研究 | 第80-81页 |
| ·纯种车轮虫分离方法的探讨 | 第81-82页 |
| ·关于将分子标记引入车轮虫分类学研究的建议 | 第82-84页 |
| 第四章 基于αTubulin 基因序列的车轮虫分子系统发育研究 | 第84-98页 |
| ·引言 | 第84页 |
| ·材料与方法 | 第84-87页 |
| ·样品的收集、鉴定及纯种分离 | 第84页 |
| ·基因组DNA的提取、PCR扩增与克隆测序 | 第84-85页 |
| ·数据分析 | 第85-87页 |
| ·序列的对位排列 | 第85页 |
| ·序列的初步分析 | 第85-86页 |
| ·系统发育分析 | 第86-87页 |
| ·结果 | 第87-96页 |
| ·序列变异情况 | 第88-90页 |
| ·系统发育关系分析 | 第90-96页 |
| ·讨论 | 第96-97页 |
| ·α Tubulin基因的选择 | 第96页 |
| ·缘毛类纤毛虫的系统发育地位 | 第96页 |
| ·车轮虫亲缘关系研究 | 第96-97页 |
| ·小结 | 第97-98页 |
| 第五章 基于车轮虫的形态特征和分子标记的系统发育比较研究 | 第98-107页 |
| ·引言 | 第98页 |
| ·材料与方法 | 第98-100页 |
| ·样品的收集、鉴定及纯种分离 | 第98-99页 |
| ·基因组DNA提取、PCR扩增与克隆测序 | 第99页 |
| ·数据分析 | 第99-100页 |
| ·分子数据分析 | 第99-100页 |
| ·序列的对位排列 | 第99页 |
| ·序列的初步分析 | 第99页 |
| ·系统发育分析 | 第99-100页 |
| ·依据形态特征的数据分析 | 第100页 |
| ·齿体特征的量化 | 第100页 |
| ·构建亲缘关系图 | 第100页 |
| ·结果 | 第100-105页 |
| ·数据初步分析 | 第100-103页 |
| ·ITS1 基因序列变异 | 第100-102页 |
| ·车轮虫齿体特征量化值 | 第102-103页 |
| ·系统树的构建 | 第103-105页 |
| ·基于ITS1基因序列的分子系统树的构建 | 第103-104页 |
| ·基于齿体特征量化值的形态学系统树的构建 | 第104-105页 |
| ·讨论 | 第105-106页 |
| ·分子标记的选择 | 第105页 |
| ·形态树与基因树的拓扑结构比较 | 第105-106页 |
| ·小结 | 第106-107页 |
| 主要结论 | 第107-108页 |
| 参考文献 | 第108-127页 |
| 攻读博士学位期间发表论文 | 第127-129页 |
| 攻读博士学位期间的获奖情况 | 第129-130页 |
| 致谢 | 第130-131页 |
