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牛microRNA的计算机鉴定及分析

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-10页
第1章 综述第10-31页
   ·引言第10页
   ·miRNA基因第10-12页
     ·miRNA的发现过程第10-11页
     ·miRNA基因的特征第11-12页
   ·miRNA的生物合成第12-15页
     ·动物miRNA的生物合成第12-14页
     ·植物miRNA的生物合成第14-15页
   ·miRNA的作用机制第15-18页
     ·miRNA介导mRNA的特异性切割第16-17页
     ·miRNA介导mRNA的翻译抑制第17页
     ·miRNA与siRNA的异同第17-18页
   ·miRNA的生物学功能第18-21页
     ·miRNA在动物中的作用第18-20页
     ·miRNA在植物中的作用第20-21页
   ·miRNA的命名与界定第21-22页
     ·miRNA的界定第21-22页
     ·miRNA的命名第22页
   ·miRNA的研究第22-29页
     ·实验RNA组学研究miRNA第23-27页
     ·计算机RNA组学研究miRNA第27-29页
   ·本论文的研究目的与意义第29-31页
第2章 材料与方法第31-44页
   ·材料第31-35页
     ·使用的数据库及分析软件第31页
     ·供试牛品种第31页
     ·主要的仪器和设备第31-32页
     ·PCR引物第32-33页
     ·主要的酶和试剂第33-34页
     ·主要的缓冲液和试剂的成分及配制第34-35页
   ·方法第35-44页
     ·miRNA的计算机分析第35-36页
     ·牛各组织(心、肝、脾、肺)总RNA的提取(热酚法)第36-39页
     ·牛基因组DNA的提取(玻璃珠法)第39-40页
     ·RNA中的DNA的酶解第40-41页
     ·RNA的逆转录反应第41-42页
     ·PCR反应及其产物鉴定第42-44页
第3章 结果第44-69页
   ·289个miRNA同源基因的发现第44-53页
   ·miRNA分子的基因组织形式第53-56页
   ·miRNA分子的进化第56-60页
   ·miRNA靶序列的鉴定第60-63页
   ·miRNA的表达分析第63-69页
     ·牛总RNA提取结果第63-64页
     ·牛基因组DNA提取结果第64-65页
     ·RT-PCR结果第65-69页
第4章 讨论第69-73页
   ·计算机RNA组学与实验RNA组学结合研究miRNA第69-70页
   ·miRNA基因组织形式多样性第70页
   ·miRNA进化的机制第70-71页
   ·miRNA的功能多样性第71-72页
   ·miRNA组织表达特异性第72-73页
致谢第73-74页
参考文献第74-79页
附录A miRbase已公布的牛miRNA分子第79-84页
附录B 预测miRNA靶序列的相关软件第84-85页
附录C 预测牛miRNA靶序列第85-106页
附录D 缩略词第106-107页
攻读学位期间的研究成果第107页

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