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黄河下游同域山羊群体mtDNA D-环多态性与起源进化研究

摘要第1-9页
Abstract第9-11页
1 引言第11-27页
   ·本研究主要涉及的分子系统学领域第11-12页
     ·群体遗传结构第11页
     ·系统发育第11-12页
   ·线粒体DNA 概述第12-16页
     ·家畜线粒体DNA 的形状和大小第12-13页
     ·线粒体DNA 的构成第13-14页
     ·线粒体DNA 的遗传特点第14-16页
   ·家畜线粒体DNA 的研究方法第16-19页
     ·RFLP 法第16页
     ·SNP 法第16-17页
     ·测序法第17页
     ·研究热点第17-19页
   ·山羊起源与进化国内外研究现状第19-26页
     ·山羊的分类学地位第19-20页
     ·考古学及形态学研究第20-21页
     ·山羊染色体核型研究与分化第21页
     ·血液蛋白多态与起源进化第21-22页
     ·分子标记方法第22-26页
   ·课题研究的目的意义第26-27页
2 材料方法第27-34页
   ·实验材料第27-29页
     ·实验样本第27页
     ·主要试剂及来源第27页
     ·主要仪器设备第27-28页
     ·缓冲液及主要试剂配制第28-29页
   ·实验方法第29-32页
     ·基因组DNA 的提取第29-30页
     ·纯化DNA 基因组第30页
     ·DNA 样品浓度测定第30-31页
     ·山羊mtDNA D-loop 高变区序列的PCR 扩增及检测第31页
     ·PCR 产物的纯化回收测序第31-32页
     ·mtDNA 高变区序列测定第32页
   ·数据处理第32-34页
     ·序列比对第32-33页
     ·序列多态性分析第33页
     ·群体遗传结构分析第33页
     ·系统发育树的构建第33-34页
3 结果分析第34-47页
   ·mtDNA D-loop 高变区部分序列的多态性检测第34页
     ·山羊全血中提取的基因组DNA第34页
     ·PCR 扩增结果第34页
   ·山羊mtDNA D-loop 序列变异第34-38页
     ·长度变异第35页
     ·核苷酸组成第35页
     ·目的序列的核苷酸变异第35-38页
   ·7 个群体单倍型分析第38-40页
   ·单倍型间系统发育树构建第40-43页
   ·群体遗传结构分析第43-46页
     ·各群体间的核苷酸分歧度和净遗传距离第43-45页
     ·山羊品种间的亲缘关系第45页
     ·分子方差分析第45-46页
   ·序列中性检验与Mismatch 分析第46-47页
4 讨论第47-52页
   ·采样原则第47页
   ·mtDNA D-loop 异质性第47-48页
   ·黄河下游同域山羊群体的起源第48-49页
   ·黄河下游同域山羊群体的遗传分化第49-50页
   ·黄河下游山羊群体的保护第50-51页
   ·mtDNA 多态性与品种划分第51-52页
5 结论第52-53页
参考文献第53-60页
致谢第60-61页
攻读学位期间发表论文情况第61-62页
附表 1 37 种单倍型的核苷酸距离第62-64页

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