| 中文摘要 | 第1-11页 |
| 英文摘要 | 第11-14页 |
| 第一章 绪论 | 第14-34页 |
| 一 引言 | 第14页 |
| 二 沼虾属的研究概况 | 第14-23页 |
| 1 基于形态特征的系统分类学研究 | 第14-16页 |
| 2 细胞遗传学研究 | 第16-18页 |
| 3 分子系统学研究 | 第18-19页 |
| 4 群体遗传学研究 | 第19-23页 |
| 三 常用的分子标记技术 | 第23-27页 |
| 1 分子标记技术(间接方法) | 第23-26页 |
| 2 DNA序列测定(直接方法) | 第26-27页 |
| 四 分子系统学及种群遗传学研究方法 | 第27-32页 |
| 1 外群的选择 | 第27页 |
| 2 常用的建树方法 | 第27-29页 |
| 3 评估数据系统发育信号和进化树的可靠性与置信度的检验 | 第29-32页 |
| 五 沼虾属研究中存在的问题及本研究的目的与意义 | 第32-34页 |
| 第二章 我国长臂虾亚科系统发育研究 | 第34-45页 |
| 一 前言 | 第34-35页 |
| 二 材料与方法 | 第35-41页 |
| 1 材料 | 第35-36页 |
| 2 研究方法 | 第36-41页 |
| 三 结果 | 第41页 |
| 四 讨论 | 第41-45页 |
| 第三章 应用线粒体16S rDNA序列初步探讨我国沼虾属的系统发育关系 | 第45-70页 |
| 一 前言 | 第45页 |
| 二 材料与方法 | 第45-51页 |
| 1 研究材料 | 第45-47页 |
| 2 实验方法 | 第47-48页 |
| 3 数据分析 | 第48-49页 |
| 4 外群选取 | 第49页 |
| 5 系统发育关系的构建 | 第49-51页 |
| 三 结果 | 第51-59页 |
| 1 沼虾属的系统发生分析 | 第51-52页 |
| ·16S rDNA序列组成分析 | 第51页 |
| ·序列信息检验 | 第51-52页 |
| 2 系统发育关系 | 第52-57页 |
| ·NJ树 | 第52-54页 |
| ·MP树 | 第54-55页 |
| ·ML树 | 第55-56页 |
| ·BI树 | 第56-57页 |
| 3 四种建树方法得到的系统树的比较和总结 | 第57-59页 |
| 四 讨论 | 第59-70页 |
| 1 所研究类群16S rRNA基因部分片段的序列组成和分子进化 | 第59-60页 |
| 2 沼虾属的单系性 | 第60-61页 |
| 3 沼虾属的类群划分 | 第61页 |
| 4 四种方法重建系统发育树的比较 | 第61-70页 |
| 第四章 我国沼虾属部分种类的分子鉴别 | 第70-90页 |
| 一 前言 | 第70-71页 |
| 二 材料与方法 | 第71-73页 |
| 1 样品采集和DNA提取 | 第71页 |
| 2 PCR扩增和序列测定 | 第71-72页 |
| 3 数据分析 | 第72-73页 |
| 三 结果 | 第73-81页 |
| 1 16S rDNA序列分析结果 | 第73-77页 |
| 2 mtDNA CO Ⅰ基因序列分析结果 | 第77-80页 |
| 3 PCR-RFLP分析结果 | 第80-81页 |
| 四 讨论 | 第81-90页 |
| 1 日本沼虾、细螯沼虾和胖掌沼虾间的亲缘关系 | 第82-83页 |
| 2 分子标记的选取 | 第83-90页 |
| 第五章 日本沼虾不同地理群体的遗传结构 | 第90-117页 |
| 第一节 利用CO Ⅰ基因部分序列分析日本沼虾Macrobrachium nipponense群体的遗传结构 | 第92-106页 |
| 一 材料与方法 | 第92-94页 |
| 1 样品的采集和DNA提取 | 第92页 |
| 2 PCR扩增和序列测定 | 第92-93页 |
| 3 数据分析 | 第93-94页 |
| 二 结果 | 第94-100页 |
| 1 日本沼虾线粒体CO Ⅰ基因序列特征 | 第94页 |
| 2 单倍型之间的关系 | 第94页 |
| 3 分子群体遗传结构 | 第94-98页 |
| 4 46个单倍型构建的分子系统树 | 第98-100页 |
| 三 讨论 | 第100-106页 |
| 1 mtDNA CO Ⅰ作为群体遗传多样性的分子标记 | 第100页 |
| 2 CO Ⅰ基因片段组成分析 | 第100-101页 |
| 3 日本沼虾不同地理群体的遗传结构 | 第101-102页 |
| 4 日本沼虾群体间的系统进化关系 | 第102-106页 |
| 第二节 日本沼虾地理群体ISSR分子标记的初步研究 | 第106-117页 |
| 一 材料与方法 | 第106-108页 |
| 1 样品的采集和DNA提取 | 第106页 |
| 2 PCR反应体系 | 第106-107页 |
| 3 数据处理 | 第107-108页 |
| 二 结果 | 第108-113页 |
| 1 引物筛选结果 | 第108-109页 |
| 2 ISSR扩增结果 | 第109-110页 |
| 3 日本沼虾不同地理群体的遗传结构 | 第110-112页 |
| 4 聚类分析 | 第112-113页 |
| 三 讨论 | 第113-117页 |
| 1 ISSR分子标记作为日本沼虾不同群体遗传标记的有效性 | 第113页 |
| 2 日本沼虾的遗传多样性和遗传结构 | 第113-114页 |
| 3 日本沼虾各地理群体间的系统发生关系 | 第114-115页 |
| 4 ISSR标记与线粒体CO Ⅰ基因结果的异同点 | 第115-117页 |
| 参考文献 | 第117-129页 |
| 论文发表情况 | 第129-130页 |
| 致谢 | 第130页 |
