| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-7页 |
| 第一章 绪论 | 第7-15页 |
| ·基因调控元件的计算机识别 | 第8-11页 |
| ·国内外寻找共同模体的方法的简介 | 第11-13页 |
| ·本文要解决的问题和整体结构安排 | 第13-15页 |
| 第二章 吉布斯采样算法及其在寻找共同模体中的应用 | 第15-26页 |
| ·统计学理论背景 | 第15-16页 |
| ·基本吉布斯采样算法 | 第16页 |
| ·吉布斯采样算法用于寻找模体的基本算法 | 第16-21页 |
| ·吉布斯采样算法用于寻找模体的仿真试验及算法改进的启示 | 第21-26页 |
| 第三章 基于模体库评估的改进的吉布斯采样算法设计与实现 | 第26-41页 |
| ·吉布斯采样算法用于寻找模体的三次验证理论改进 | 第26-34页 |
| ·改进吉布斯采样算法的试验验证报告 | 第34-39页 |
| ·改进的吉布斯采样算法的算法总结 | 第39-41页 |
| 第四章 基于马尔可夫背景模型新型编码规则改造的吉布斯采样算法用于寻找共同模体 | 第41-50页 |
| ·预测共同模体时生物数据的噪声源 | 第41页 |
| ·背景模型提出的历史简介 | 第41-42页 |
| ·隐马尔可夫链理论知识 | 第42-43页 |
| ·马尔可夫链理论知识应用于寻找共同模体 | 第43-44页 |
| ·马尔可夫链理论应用于寻找共同模体的编码实现方法 | 第44-45页 |
| ·本文提出的基于马尔可夫链理论寻找共同模体的编码方法 | 第45-47页 |
| ·初步的数值试验计算结果 | 第47-49页 |
| ·新型马尔可夫背景模型编码的小结 | 第49-50页 |
| 第五章 寻找共同模体的吉布斯采样算法改进思路探讨 | 第50-52页 |
| ·用先验知识对算法进行改进 | 第50页 |
| ·调整计分函数改进算法 | 第50-51页 |
| ·增对模体库的二次挖掘 | 第51-52页 |
| 第六章 论文总结 | 第52-53页 |
| 致谢 | 第53-54页 |
| 参考文献 | 第54-58页 |
| 个人简历及攻硕期间的研究成果 | 第58-59页 |
