摘要 | 第1-6页 |
本论文常用英文缩写 | 第6-13页 |
前言 | 第13-17页 |
第一章 弓首蛔虫和狮弓蛔虫种特异PCR鉴定方法的建立和应用 | 第17-42页 |
第一节 弓首蛔虫和狮弓蛔虫种特异PCR鉴定方法的建立 | 第17-29页 |
1 材料与方法 | 第17-21页 |
·虫体样品 | 第17页 |
·仪器和试剂 | 第17-19页 |
·仪器 | 第17-18页 |
·试剂和酶 | 第18页 |
·溶液配制 | 第18-19页 |
·引物的设计与合成 | 第19页 |
·虫体总DNA 的提取和验证 | 第19-21页 |
·虫体总DNA 的提取 | 第19-20页 |
·虫体总DNA 的验证 | 第20-21页 |
·特异 PCR 反应条件的优化 | 第21页 |
·特异性实验 | 第21页 |
·敏感性实验 | 第21页 |
·序列分析 | 第21页 |
2 结果 | 第21-27页 |
·PCR 试验条件的优化 | 第21页 |
·PCR 扩增结果 | 第21-22页 |
·特异性试验结果 | 第22-24页 |
·敏感性试验结果 | 第24-25页 |
·测序结果分析 | 第25-27页 |
3 讨论 | 第27-29页 |
第二节 非同位素SSCP 方法对弓首蛔虫和狮弓蛔虫ITS-2 序列的分析 | 第29-37页 |
1 材料与方法 | 第29-32页 |
·虫体样品 | 第29页 |
·仪器和试剂 | 第29-30页 |
·主要仪器 | 第29页 |
·主要试剂和溶液配制 | 第29-30页 |
·虫体DNA 提取和PCR 扩增 | 第30-31页 |
·虫体基因组DNA的提取 | 第30页 |
·PCR 扩增 | 第30-31页 |
·非变性聚丙烯酰胺凝胶电泳(SSCP 电泳) | 第31-32页 |
2 结果与讨论 | 第32-37页 |
·PCR 扩增 | 第32-33页 |
·Cold-SSCP 分析 | 第33-35页 |
·讨论 | 第35-37页 |
第三节 马来西亚弓首蛔虫在我国的首次发现 | 第37-41页 |
1 材料与方法 | 第37-38页 |
·虫体的采集和处理 | 第37页 |
·主要仪器和试剂 | 第37页 |
·虫体基因组DNA的提取和特异PCR扩增 | 第37页 |
·ITS 的 PCR 扩增和测序 | 第37-38页 |
·虫体形态学观察 | 第38页 |
2 结果 | 第38-40页 |
·形态学观察结果 | 第38页 |
·特异PCR结果 | 第38-39页 |
·ITS-2测序结果 | 第39-40页 |
3 讨论和小结 | 第40-41页 |
本章小结 | 第41-42页 |
第二章 弓首属和弓蛔属蛔虫线粒体cox1、nad1 和nad4 基因多态性研究 | 第42-77页 |
1 材料与方法 | 第42-51页 |
·虫体样品 | 第42页 |
·仪器和试剂 | 第42-43页 |
·主要仪器 | 第42-43页 |
·试剂和酶 | 第43页 |
·溶液和培养基的配制 | 第43-44页 |
·溶液的配制 | 第43-44页 |
·培养基的配制 | 第44页 |
·感受态细胞 | 第44-45页 |
·虫体总 DNA 的提取 | 第45页 |
·线粒体DNA 三个基因片段的PCR 扩增 | 第45-47页 |
·cox1 基因片段的PCR 扩增 | 第45-46页 |
·nad1 基因片段的PCR 扩增 | 第46页 |
·nad4 基因片段的PCR 扩增 | 第46-47页 |
·非变性聚丙烯酰胺凝胶分析(SSCP 分析) | 第47-49页 |
·引物标记 | 第47页 |
·SSCP分析 | 第47-49页 |
·测序 | 第49-51页 |
·PCR 产物的纯化和连接 | 第49-50页 |
·重组质粒的转化及菌落PCR鉴定 | 第50页 |
·质粒的小量抽提及酶切鉴定 | 第50-51页 |
·DNA 序列分析 | 第51页 |
2 结果 | 第51-74页 |
·PCR 扩增结果 | 第51-52页 |
·PCR-SSCP 分析 | 第52-55页 |
·cox1 基因PCR-SSCP 分析 | 第52-53页 |
·nad1 基因PCR-SSCP 分析 | 第53-54页 |
·nad4 基因PCR-SSCP 分析 | 第54-55页 |
·测序结果 | 第55-57页 |
·cox1 基因片断测序结果 | 第55页 |
·nad1 基因片断测序结果 | 第55页 |
·nad4 基因片断测序结果 | 第55-57页 |
·DNA 序列分析结果 | 第57-74页 |
·cox1 基因片断 DNA 序列分析结果 | 第57-59页 |
·nad1 基因片断DNA 序列分析结果 | 第59-61页 |
·nad4 基因片断 DNA 序列分析结果 | 第61-74页 |
3 讨论 | 第74-76页 |
·cox1 基因多态性研究 | 第74页 |
·nad1 基因多态性研究 | 第74-75页 |
·nad4 基因多态性研究 | 第75页 |
·线粒体三个基因序列上遗传标记位点比较 | 第75页 |
·线粒体DNA三段基因序列种内和种间变异的分析 | 第75页 |
·线粒体 DNA 序列作为遗传标记在虫种分类上的意义 | 第75-76页 |
本章小结 | 第76-77页 |
第三章 犬弓首蛔虫线粒体基因组全序列测序及序列分析 | 第77-94页 |
1 材料与方法 | 第77-79页 |
·虫体样品 | 第77页 |
·仪器和试剂 | 第77页 |
·仪器 | 第77页 |
·试剂和试剂盒 | 第77页 |
·基因组 DNA 的抽提和验证 | 第77页 |
·线粒体DNA 的长PCR 扩增 | 第77-79页 |
·长 PCR 扩增引物 | 第77-78页 |
·长 PCR 扩增条件 | 第78-79页 |
·序列分析方法 | 第79页 |
2 结果和讨论 | 第79-92页 |
·长PCR扩增结果 | 第79-80页 |
·犬弓首蛔虫线粒体基因组总的特征 | 第80-88页 |
·蛋白质编码基因和密码子使用模式 | 第88-91页 |
·转移RNA(tRNA)基因 | 第91-92页 |
·核糖体 RNA(rRNA)基因 | 第92页 |
·非编码区 | 第92页 |
本章小结 | 第92-94页 |
全文总结 | 第94-96页 |
致谢 | 第96-97页 |
参考文献 | 第97-109页 |
英文摘要 | 第109-114页 |
附录 A 综述 | 第114-130页 |
附录B 质粒pGEM-T Easy Vector基因图谱 | 第130-131页 |
附录 C tRNA 二级结构 | 第131-142页 |
附录 D 在学期间发表论文、著作及参加科研课题情况 | 第142-145页 |