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猪输血性传播病毒1型和2型PCR检测方法的建立及其全基因组克隆与序列分析

中文摘要第1-5页
ABSTRACT第5-7页
目录第7-10页
第一章 输血性传播病毒的研究进展第10-25页
 1 病原学第10-13页
   ·TTV的理化性质第10页
   ·TTV DNA的结构和功能第10-12页
   ·TTV的分型第12-13页
 2 流行病学第13-17页
   ·人的TTV感染第13-15页
   ·灵长类动物的TTV感染第15-16页
   ·猪的TTV感染第16-17页
 3 致病性第17-20页
 4 检测方法第20-24页
   ·TTV分子生物学的检测方法第20-22页
   ·TTV分型的检测第22页
   ·TTV的其他检测方法第22-24页
     ·血清免疫学法第22-23页
     ·原位杂交法第23-24页
 5 本研究的目的和意义第24-25页
第二章 猪输血性传播病毒1型和2型PCR检测方法的建立第25-38页
 前言第25页
 1 材料第25-26页
   ·病料与载体第25页
   ·主要试剂及溶液配制第25-26页
     ·主要试剂第25-26页
   ·主要仪器第26页
 2 实验方法第26-30页
   ·PCR引物的设计第26-27页
   ·病毒总DNA的抽提第27页
   ·PCR扩增第27-28页
   ·目的基因的克隆第28-29页
     ·PCR产物目的DNA片段的回收第28页
     ·连接第28页
     ·大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备第28-29页
     ·重组质粒的转化第29页
   ·阳性菌的鉴定第29页
   ·目的基因的序列测定第29-30页
   ·PCR扩增条件的优化第30页
   ·特异性实验第30页
   ·敏感性实验第30页
   ·重复性实验第30页
   ·TTV1、TTV2 PCR检测方法的临床应用第30页
 3 实验结果与分析第30-33页
   ·病料PCR扩增产物电泳结果第30-31页
   ·特异性试验鉴定结果第31页
   ·敏感性试验鉴定结果第31-32页
   ·重复性试验鉴定结果第32页
   ·PCR的临床应用的鉴定结果第32-33页
     ·采用PCR进行检测第32-33页
     ·TTV1、TTV2的感染情况第33页
 4 讨论第33-38页
   ·关于引物设计第33-34页
   ·关于TTV1、TTV2病毒的确定第34-35页
   ·关于敏感性试验、特异性试验和重复性试验第35-36页
   ·关于PCR方法的临床应用第36-38页
第三章 猪输血性传播病毒1型(TTV1)和2型(TTV2)全基因组的克隆与序列分析第38-57页
 前言第38页
 1 材料第38-39页
   ·试剂与仪器第38页
   ·病料第38-39页
 2 方法第39-42页
   ·TTV1与TTV2全基因组的克隆第39-41页
     ·病毒基因组DNA的提取第39页
     ·TTV1与TTV2全基因组的PCR扩增第39-41页
     ·PCR产物的克隆与序列测定第41页
   ·TTV1和TTV2全基因组的生物信息学分析第41-42页
     ·TTV1和TTV2基因组核苷酸序列同源性分析和进化树分析第41-42页
     ·TTV1和TTV2基因组核苷酸重复高变序列分析第42页
   ·TTV1和TTV2 ORF1蛋白结构与功能预测第42页
     ·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白抗原性预测分析第42页
     ·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白疏水性分析第42页
     ·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白二级结构预测第42页
     ·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白亚细胞定位预测第42页
 3 结果与分析第42-51页
   ·TTV1、TTV2全基因组的PCR扩增第42-43页
   ·PCR产物的克隆及测序第43-44页
   ·TTV1、TTV2全基因组序列的拼接第44页
   ·TTV1、TTV2全基因组的序列分析第44-47页
     ·TTV1、TTV2全基因组同源性分析与进化树第45-46页
     ·TTV1、TTV2基因组核苷酸高变缺失序列分析第46-47页
   ·TTV1、TTV2 ORF1蛋白结构与功能预测第47-51页
     ·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白抗原性分析第47-48页
     ·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白疏水性分析第48-49页
     ·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白的二级结构预测第49-50页
     ·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白亚细胞定位预测第50-51页
 3 讨论第51-57页
   ·关于全基因组克隆第51-53页
   ·关于序列分析第53-54页
   ·关于ORF1蛋白分析第54-57页
结论第57-58页
 1 TTV1和TTV2 PCR检测方法的建立第57页
 2 TTV1与TTV2全基因组克隆与序列分析第57-58页
参考文献第58-64页
致谢第64-65页
攻读硕士学位期间发表的论文第65-66页
附录一 TTV1和TTV2全基因组测序结果第66-70页

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