中文摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-7页 |
目录 | 第7-10页 |
第一章 输血性传播病毒的研究进展 | 第10-25页 |
1 病原学 | 第10-13页 |
·TTV的理化性质 | 第10页 |
·TTV DNA的结构和功能 | 第10-12页 |
·TTV的分型 | 第12-13页 |
2 流行病学 | 第13-17页 |
·人的TTV感染 | 第13-15页 |
·灵长类动物的TTV感染 | 第15-16页 |
·猪的TTV感染 | 第16-17页 |
3 致病性 | 第17-20页 |
4 检测方法 | 第20-24页 |
·TTV分子生物学的检测方法 | 第20-22页 |
·TTV分型的检测 | 第22页 |
·TTV的其他检测方法 | 第22-24页 |
·血清免疫学法 | 第22-23页 |
·原位杂交法 | 第23-24页 |
5 本研究的目的和意义 | 第24-25页 |
第二章 猪输血性传播病毒1型和2型PCR检测方法的建立 | 第25-38页 |
前言 | 第25页 |
1 材料 | 第25-26页 |
·病料与载体 | 第25页 |
·主要试剂及溶液配制 | 第25-26页 |
·主要试剂 | 第25-26页 |
·主要仪器 | 第26页 |
2 实验方法 | 第26-30页 |
·PCR引物的设计 | 第26-27页 |
·病毒总DNA的抽提 | 第27页 |
·PCR扩增 | 第27-28页 |
·目的基因的克隆 | 第28-29页 |
·PCR产物目的DNA片段的回收 | 第28页 |
·连接 | 第28页 |
·大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备 | 第28-29页 |
·重组质粒的转化 | 第29页 |
·阳性菌的鉴定 | 第29页 |
·目的基因的序列测定 | 第29-30页 |
·PCR扩增条件的优化 | 第30页 |
·特异性实验 | 第30页 |
·敏感性实验 | 第30页 |
·重复性实验 | 第30页 |
·TTV1、TTV2 PCR检测方法的临床应用 | 第30页 |
3 实验结果与分析 | 第30-33页 |
·病料PCR扩增产物电泳结果 | 第30-31页 |
·特异性试验鉴定结果 | 第31页 |
·敏感性试验鉴定结果 | 第31-32页 |
·重复性试验鉴定结果 | 第32页 |
·PCR的临床应用的鉴定结果 | 第32-33页 |
·采用PCR进行检测 | 第32-33页 |
·TTV1、TTV2的感染情况 | 第33页 |
4 讨论 | 第33-38页 |
·关于引物设计 | 第33-34页 |
·关于TTV1、TTV2病毒的确定 | 第34-35页 |
·关于敏感性试验、特异性试验和重复性试验 | 第35-36页 |
·关于PCR方法的临床应用 | 第36-38页 |
第三章 猪输血性传播病毒1型(TTV1)和2型(TTV2)全基因组的克隆与序列分析 | 第38-57页 |
前言 | 第38页 |
1 材料 | 第38-39页 |
·试剂与仪器 | 第38页 |
·病料 | 第38-39页 |
2 方法 | 第39-42页 |
·TTV1与TTV2全基因组的克隆 | 第39-41页 |
·病毒基因组DNA的提取 | 第39页 |
·TTV1与TTV2全基因组的PCR扩增 | 第39-41页 |
·PCR产物的克隆与序列测定 | 第41页 |
·TTV1和TTV2全基因组的生物信息学分析 | 第41-42页 |
·TTV1和TTV2基因组核苷酸序列同源性分析和进化树分析 | 第41-42页 |
·TTV1和TTV2基因组核苷酸重复高变序列分析 | 第42页 |
·TTV1和TTV2 ORF1蛋白结构与功能预测 | 第42页 |
·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白抗原性预测分析 | 第42页 |
·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白疏水性分析 | 第42页 |
·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白二级结构预测 | 第42页 |
·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白亚细胞定位预测 | 第42页 |
3 结果与分析 | 第42-51页 |
·TTV1、TTV2全基因组的PCR扩增 | 第42-43页 |
·PCR产物的克隆及测序 | 第43-44页 |
·TTV1、TTV2全基因组序列的拼接 | 第44页 |
·TTV1、TTV2全基因组的序列分析 | 第44-47页 |
·TTV1、TTV2全基因组同源性分析与进化树 | 第45-46页 |
·TTV1、TTV2基因组核苷酸高变缺失序列分析 | 第46-47页 |
·TTV1、TTV2 ORF1蛋白结构与功能预测 | 第47-51页 |
·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白抗原性分析 | 第47-48页 |
·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白疏水性分析 | 第48-49页 |
·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白的二级结构预测 | 第49-50页 |
·TTV1-ORF1、TTV2-ORF1蛋白亚细胞定位预测 | 第50-51页 |
3 讨论 | 第51-57页 |
·关于全基因组克隆 | 第51-53页 |
·关于序列分析 | 第53-54页 |
·关于ORF1蛋白分析 | 第54-57页 |
结论 | 第57-58页 |
1 TTV1和TTV2 PCR检测方法的建立 | 第57页 |
2 TTV1与TTV2全基因组克隆与序列分析 | 第57-58页 |
参考文献 | 第58-64页 |
致谢 | 第64-65页 |
攻读硕士学位期间发表的论文 | 第65-66页 |
附录一 TTV1和TTV2全基因组测序结果 | 第66-70页 |