| 致谢 | 第1-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-15页 |
| 1 绪论 | 第15-47页 |
| ·引言 | 第15页 |
| ·深海微生物多样性研究概况 | 第15-20页 |
| ·深海微生物的生境 | 第16-17页 |
| ·深海微生物的营养来源 | 第17-19页 |
| ·深海微生物的多样性 | 第19-20页 |
| ·深海热液区微生物多样性研究进展 | 第20-29页 |
| ·深海热液区的环境特点和全球分布 | 第21-23页 |
| ·深海热液区微生物的多样性 | 第23-25页 |
| ·深海热液区微生物代谢的多样性 | 第25-28页 |
| ·深海热液区微生物nifH基因的多样性 | 第28-29页 |
| ·深海嗜压微生物研究进展 | 第29-41页 |
| ·嗜压微生物的定义 | 第30-31页 |
| ·深海嗜压微生物的培养 | 第31-35页 |
| ·深海嗜压微生物的多样性 | 第35-40页 |
| ·深海嗜压微生物的环境适应性 | 第40-41页 |
| ·嗜盐古菌基因组与乙醇代谢研究进展 | 第41-46页 |
| ·嗜盐古菌Natronomonas pharaonis的基因组与功能基因 | 第41-45页 |
| ·嗜盐古菌的乙醇代谢及相关基因 | 第45-46页 |
| ·本论文的主要内容和研究意义 | 第46-47页 |
| 2 西南印度洋洋中脊深海热液区沉积物原核微生物多样性研究 | 第47-71页 |
| ·引言 | 第47-48页 |
| ·材料与方法 | 第48-53页 |
| ·样品采集 | 第48-49页 |
| ·试剂与培养基 | 第49页 |
| ·试剂 | 第49页 |
| ·培养基 | 第49页 |
| ·环境基因组DNA的提取 | 第49页 |
| ·目的基因的PCR | 第49-51页 |
| ·引物 | 第49-50页 |
| ·反应体系与过程 | 第50-51页 |
| ·基因文库的构建 | 第51-52页 |
| ·基因文库的分析 | 第52-53页 |
| ·16SrRNA基因文库的分析 | 第52-53页 |
| ·nifH基因文库的分析 | 第53页 |
| ·实验结果 | 第53-68页 |
| ·16SrRNA和nifH基因文库的构建 | 第53-54页 |
| ·古菌16S rRNA基因的多样性 | 第54-58页 |
| ·细菌16S rRNA基因的多样性 | 第58-67页 |
| ·nifH基因的多样性 | 第67-68页 |
| ·讨论 | 第68-70页 |
| ·本章小节 | 第70-71页 |
| 3 波多黎各海沟深海嗜压细菌的培养和多相分类学研究 | 第71-93页 |
| ·引言 | 第71-72页 |
| ·材料与方法 | 第72-84页 |
| ·样品采集 | 第72页 |
| ·试剂与培养基 | 第72-74页 |
| ·试剂 | 第72-73页 |
| ·培养基 | 第73-74页 |
| ·深海微生物的高压富集 | 第74-76页 |
| ·高压富集培养 | 第74-75页 |
| ·细胞的DAPI荧光染色计数 | 第75-76页 |
| ·菌株的分离纯化 | 第76-77页 |
| ·稀释灭绝法 | 第76页 |
| ·硅胶的制备 | 第76-77页 |
| ·硅胶培养和分离单克隆菌落 | 第77页 |
| ·深海菌株的多相分类学研究 | 第77-84页 |
| ·生长限制因子研究 | 第77-78页 |
| ·形态研究 | 第78页 |
| ·电子供体和电子受体研究 | 第78-79页 |
| ·酶学活性研究 | 第79-80页 |
| ·糖醇产酸研究 | 第80页 |
| ·硫化氢、吲哚产生和运动状态研究 | 第80-81页 |
| ·全细胞脂肪酸研究 | 第81页 |
| ·16S rRNA基因序列的测定以及系统发育研究 | 第81-83页 |
| ·基因组DNA的G+C mol%研究 | 第83-84页 |
| ·实验结果 | 第84-88页 |
| ·深海微生物的高压富集和菌株YC-1的分离纯化 | 第84页 |
| ·菌株YC-1的多相分类学特征 | 第84-88页 |
| ·表型特征 | 第84-85页 |
| ·生理学特征 | 第85-86页 |
| ·生物化学特征 | 第86页 |
| ·遗传学特征 | 第86-88页 |
| ·讨论 | 第88-90页 |
| ·新种描述 | 第90-91页 |
| ·Description of Profundimonas gen.nov.(新属描述) | 第90-91页 |
| ·Description of Profundimonas piezophila sp.nov.(新种描述) | 第91页 |
| ·本章小节 | 第91-93页 |
| 4 嗜盐古菌Natronomonas pharaonis乙醇代谢相关酶基因研究 | 第93-114页 |
| ·引言 | 第93-94页 |
| ·材料与方法 | 第94-105页 |
| ·菌株与质粒 | 第94页 |
| ·试剂与培养基 | 第94-95页 |
| ·试剂 | 第94页 |
| ·培养基 | 第94-95页 |
| ·细胞总RNA的提取 | 第95-96页 |
| ·目的基因的RT-PCR | 第96-97页 |
| ·引物 | 第96页 |
| ·反应体系与过程 | 第96-97页 |
| ·基因组DNA的提取 | 第97-98页 |
| ·目的基因的PCR | 第98-99页 |
| ·引物 | 第98-99页 |
| ·反应体系与过程 | 第99页 |
| ·表达载体的构建 | 第99-101页 |
| ·目的蛋白质的异源表达 | 第101-102页 |
| ·目的蛋白质的纯化 | 第102-104页 |
| ·NpADH的纯化 | 第102-103页 |
| ·NpALDH的纯化 | 第103-104页 |
| ·酶学性质的研究 | 第104-105页 |
| ·酶活性的测定 | 第104-105页 |
| ·pH对酶活性的影响 | 第105页 |
| ·温度对酶活性的影响 | 第105页 |
| ·盐浓度对酶活性的影响 | 第105页 |
| ·实验结果 | 第105-111页 |
| ·乙醇对N.pharaonis生长的影响 | 第105-107页 |
| ·乙醇胁迫下N.pharaonis相关酶基因的表达 | 第107-108页 |
| ·N.pharaonis乙醇代谢相关酶基因的克隆、异源表达与纯化 | 第108-109页 |
| ·NpADH的克隆、异源表达与纯化 | 第108-109页 |
| ·NpALDH的克隆、异源表达与纯化 | 第109页 |
| ·N.pharaonis乙醇代谢相关酶的性质 | 第109-111页 |
| ·NpADH的性质 | 第109-110页 |
| ·NpALDH的性质 | 第110-111页 |
| ·讨论 | 第111-113页 |
| ·本章小结 | 第113-114页 |
| 5 结论 | 第114-115页 |
| 参考文献 | 第115-132页 |
| 攻读学位期间发表的学术论文(含待发表) | 第132页 |
