OsPAD：基于二维凝胶电泳系统的水稻蛋白质组数据库及在线分析平台
| 致谢 | 第1-8页 |
| 摘要 | 第8-9页 |
| Abstract | 第9-10页 |
| 第1章 引言 | 第10-19页 |
| 1. 背景 | 第10-15页 |
| ·蛋白质组学简介 | 第10页 |
| ·二维凝胶电泳技术简介及其在蛋白质组学中的应用 | 第10-12页 |
| ·蛋白质组学在水稻研究领域的应用 | 第12-13页 |
| ·二维凝胶数据库的现状 | 第13-15页 |
| 2. RPD简介 | 第15-17页 |
| 3. 问题所在及解决方案 | 第17-19页 |
| 第2章 构建OsPAD数据库 | 第19-28页 |
| 1. 数据来源 | 第19-21页 |
| ·RPD数据集 | 第19页 |
| ·UniProt数据集 | 第19-20页 |
| ·KEGG数据集 | 第20-21页 |
| 2. 数据集整合及自动注释 | 第21-25页 |
| ·其他数据整合 | 第21-23页 |
| ·自动注释算法思路 | 第23-24页 |
| ·比对算法思路 | 第24-25页 |
| 3. OsPAD数据库 | 第25-28页 |
| 第3章 OsPAD在线搜索及分析平台的构建 | 第28-43页 |
| 1. 整体结构及功能介绍 | 第28-29页 |
| 2. 凝胶数据搜索模块 | 第29-34页 |
| ·凝胶图基本信息 | 第29-31页 |
| ·凝胶点搜索 | 第31-33页 |
| ·凝胶片之间的比对 | 第33-34页 |
| 3. UniProt数据搜索模块 | 第34-36页 |
| 4. KEGG数据搜索模块 | 第36-37页 |
| 5. 图形化显示模块 | 第37-40页 |
| ·Virtual Gel虚拟凝胶显示 | 第37-38页 |
| ·蛋白质表达量的统计图 | 第38-39页 |
| ·KEGG代谢途径显示 | 第39-40页 |
| 6. 在线分析模块 | 第40-43页 |
| 第4章 结论 | 第43-44页 |
| 参考文献 | 第44-46页 |
| 附录: 缩略语 | 第46页 |
