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粗糙脉孢菌纤维素酶调控因子CER-3/4功能研究

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第1章 绪论第17-30页
    1.1 纤维素酶系简介第18-21页
        1.1.1 纤维素酶系组成及酶解第18-19页
        1.1.2 半纤维素酶系组成及其酶解第19-20页
        1.1.3 多糖单加氧化酶在木质纤维素降解过程中具有重要作用第20-21页
    1.2 真菌纤维素酶诱导和调控表达机理第21-26页
        1.2.1 底物对纤维素酶诱导第21-22页
        1.2.2 糖转运蛋白在纤维素酶诱导过程中的作用第22页
        1.2.3 丝状真菌纤维素酶调控转录因子研究现状第22-23页
        1.2.4 木质纤维素水解酶转录激活因子第23-24页
        1.2.5 木质纤维素水解酶转录抑制因子第24-25页
        1.2.6 纤维素水解酶表达分泌中氮调控相关转录因子的作用第25-26页
    1.3 嗜热毁丝霉属真菌简介第26-27页
    1.4 粗糙脉孢菌第27-28页
        1.4.1 粗糙脉孢菌简介第27页
        1.4.2 粗糙脉孢菌研究现状第27-28页
        1.4.3 粗糙脉孢菌对纤维素降解在组学水平的研究第28页
    1.5 本课题研究目的及意义第28-30页
第2章 材料和方法第30-58页
    2.1 主要仪器及生化试剂第30-32页
    2.2 主要菌株及质粒第32-34页
    2.3 主要引物第34-36页
    2.4 主要生物试剂第36-38页
    2.5 主要培养基配制第38-40页
    2.6 分子克隆操作第40-45页
        2.6.1 E.coil菌落PCR验证第40页
        2.6.2 片段PCR扩增第40-41页
        2.6.3 质粒DNA或PCR产物的酶切第41-42页
        2.6.4 目的片段与载体的连接第42页
        2.6.5 E.coli感受态细胞的转化第42-43页
        2.6.6 碱裂解法小提质粒DNA(试剂盒)第43页
        2.6.7 快速琼脂糖凝胶DNA回收(试剂盒)第43-44页
        2.6.8 快速DNA产物纯化(试剂盒)第44页
        2.6.9 琼脂糖凝胶电泳第44页
        2.6.10 SDS-PAGE电泳第44-45页
    2.7 粗糙脉孢菌基因组的提取第45-46页
    2.8 嗜热毁丝霉基因组提取第46页
    2.9 丝状真菌RNA提取及纯化第46-47页
    2.10 RNA反转录第47-48页
    2.11 qRT-PCR第48页
    2.12 RNA-seq和数据分析第48-49页
    2.13 粗糙脉孢菌电转方法第49页
    2.14 根癌农杆菌转化方法第49-50页
    2.15 根癌农杆菌介导的嗜热毁丝霉遗传转化方法第50-51页
    2.16 原生质体介导的嗜热毁丝霉转化方法第51-52页
    2.17 粗糙脉孢菌有性杂交及杂交突变体筛选第52-55页
        2.17.1 生物量测定第53页
        2.17.2 蛋白浓度测定第53-54页
        2.17.3 纤维素酶活测定第54-55页
    2.18 Southern分析第55-57页
    2.19 粗糙脉孢菌及嗜热毁丝霉的培养及保存第57-58页
第3章 结果与分析第58-86页
    3.1 粗糙脉孢菌Zn_2Cys_6家族突变体库筛选第58-59页
    3.2 △cer-3和△cer-4菌株鉴定第59-60页
    3.3 △cer-3和△cer-4蛋白浓度和木质纤维素酶活的测定第60-61页
    3.4 △cer-3和△cer-4在木聚糖条件下半纤维素酶的测定第61-62页
    3.5 △cer-3和△cer-4在基本培养基中的生长第62-63页
    3.6 △cer-3和△cer-4回补菌株的构建及表型分析第63-66页
        3.6.1 △cer-3和△cer-4回补质粒构建第63-64页
        3.6.2 △cer-3和△cer-4纯核回补菌株获得第64页
        3.6.3 △cer-3和△cer-4回补菌株的表型分析第64-66页
    3.7 cer-3和cer-4过表达菌株的构建及表型分析第66-70页
        3.7.1 cer-3和cer-4过表达质粒的构建第66-67页
        3.7.2 cer-3和cer-4纯核过表达菌株获得第67页
        3.7.3 cer-3和cer-4过表达菌株的表型分析第67-70页
    3.8 纤维素诱导条件下△cer-3和△cer-4的转录组分析第70-74页
    3.9 qRTPCR分析纤维素酶基因表达水平第74-76页
    3.10 CER-3和CER-4在丝状真菌中的进化分析第76-80页
        3.10.1 嗜热毁丝霉ku70敲除盒构建第77-78页
        3.10.2 嗜热毁丝霉ku70敲除菌株获得第78页
        3.10.3 嗜热毁丝霉ku70敲除菌株Southern blotting验证第78-79页
        3.10.4 嗜热毁丝霉野生型菌株和△ku70菌株间表型比较第79-80页
    3.11 cer-3和cer-4异源表达菌株构建第80-82页
        3.11.1 cer-3和cer-4异源表达质粒构建第80-81页
        3.11.2 cer-3和cer-4异源表达纯化菌株获得第81-82页
    3.12 cer-3和cer-4异源表达菌株蛋白浓度和纤维素酶活测定第82-83页
    3.13 qRTPCR分析T1CER-3和T1CER-4纤维素酶基因表达水平第83-86页
第4章 讨论与展望第86-88页
参考文献第88-98页
附录第98-99页
致谢第99页

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