| 摘要 | 第2-3页 |
| Abstract | 第3-4页 |
| 1 绪论 | 第8-30页 |
| 1.1 天然产物 | 第8-9页 |
| 1.1.1 天然产物概述 | 第8页 |
| 1.1.2 天然产物的研究现状 | 第8-9页 |
| 1.2 基于计算的理性药物设计 | 第9-21页 |
| 1.2.1 虚拟筛选技术 | 第10-11页 |
| 1.2.2 基于结构的药物设计 | 第11-13页 |
| 1.2.3 新型药物虚拟筛选工具FIPSDock | 第13-17页 |
| 1.2.4 分子动力学模拟 | 第17-19页 |
| 1.2.5 结合自由能计算 | 第19-21页 |
| 1.3 Talin1蛋白及其研究进展 | 第21-26页 |
| 1.3.1 Talin的生物学功能 | 第21页 |
| 1.3.2 Talin1的头部结构 | 第21-23页 |
| 1.3.3 Talin1与整联蛋白的激活 | 第23-25页 |
| 1.3.4 Talin1与乳腺癌 | 第25-26页 |
| 1.4 RBM4蛋白及其研究进展 | 第26-30页 |
| 1.4.1 RBM4的结构及生物学功能 | 第26-27页 |
| 1.4.2 RBM4与肿瘤 | 第27页 |
| 1.4.3 CCHC型锌指结构与药物设计 | 第27-30页 |
| 2 新型靶向Talin-1抑制剂的虚拟筛选与验证 | 第30-44页 |
| 2.1 引言 | 第30页 |
| 2.2 实验材料 | 第30-32页 |
| 2.2.1 配体和受体结构 | 第30-31页 |
| 2.2.2 所用软件 | 第31-32页 |
| 2.3 实验方法与步骤 | 第32-36页 |
| 2.3.1 Talin1蛋白结构的获取及准备 | 第32-33页 |
| 2.3.2 配体化合物结构的获取 | 第33页 |
| 2.3.3 FIPSDock软药物的批量虚拟筛选 | 第33页 |
| 2.3.4 分子动力学模拟 | 第33-36页 |
| 2.4 实验结果与讨论 | 第36-43页 |
| 2.4.1 受体Talin1蛋白三维结构 | 第36-37页 |
| 2.4.2 FIPSDock虚拟筛选结果 | 第37-40页 |
| 2.4.3 分子动力学模拟结果分析之运动参数分析 | 第40-43页 |
| 2.4.4 结合自由能计算 | 第43页 |
| 2.5 本章小结 | 第43-44页 |
| 3 新型靶向RBM4抑制剂的设计 | 第44-65页 |
| 3.1 引言 | 第44页 |
| 3.2 实验材料 | 第44-46页 |
| 3.2.1 配体和受体结构 | 第44-45页 |
| 3.2.2 所用软件 | 第45-46页 |
| 3.3 实验方法与步骤 | 第46-51页 |
| 3.3.1 受体蛋白的获得与准备 | 第46-47页 |
| 3.3.2 配体小分子的获得与准备 | 第47-48页 |
| 3.3.3 利用FIPSDock软件进行分子对接 | 第48页 |
| 3.3.4 基于抑制剂结构的药物设计 | 第48页 |
| 3.3.5 分子动力学模拟 | 第48-51页 |
| 3.4 实验结果 | 第51-64页 |
| 3.4.1 RBM4三维模型的构建与评价 | 第51-53页 |
| 3.4.2 配体抑制剂结构 | 第53-54页 |
| 3.4.3 利用FIPSDock软件进行分子对接的结果 | 第54-55页 |
| 3.4.4 基于PATE3-1和PATE3-2的药物设计 | 第55-57页 |
| 3.4.5 配体受体的对接复合物筛选 | 第57页 |
| 3.4.6 分子动力学模拟结果分析之运动参数分析 | 第57-61页 |
| 3.4.7 结合自由能计算 | 第61-62页 |
| 3.4.8 残基能量分解及分析 | 第62-64页 |
| 3.5 本章小结 | 第64-65页 |
| 结论 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-70页 |
| 攻读硕士学位期间发表学术论文情况 | 第70-71页 |
| 致谢 | 第71-73页 |